mamaprint (MP) 70基因表达谱的开发是为了帮助预测乳腺癌患者的临床结局,并已在雌激素受体(ER)阳性和阴性乳腺癌的先前研究中得到验证[据xref ref-type="bibr" rid="B1"> 1据/xref>-据xref ref-type="bibr" rid="B5"> 5.据/xref>].MP通过微阵列测量70个基因面板的mRNA表达水平,然后施加算法将肿瘤分类为高或低风险的算法[据xref ref-type="bibr" rid="B1"> 1据/xref>].在没有辅助治疗的情况下,高风险相当于10年的距离转移的几率> 29%,并且低风险相当于远处转移而没有佐剂治疗的10%的机会[据xref ref-type="bibr" rid="B3"> 3.据/xref>].虽然基因组和风险算法的最初开发是使用阴性淋巴结的乳腺癌患者队列设计的,但随后的欧洲研究已经验证了MP在多达3个肿瘤阳性淋巴结患者中的预后价值[据xref ref-type="bibr" rid="B2"> 2据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B5"> 5.据/xref>].据/p>
原始队列仅包括55岁的患者,而MP测试的3个主要欧洲验证随后缩写了53,61和71的诊断年龄[据xref ref-type="bibr" rid="B2"> 2据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B3"> 3.据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B5"> 5.据/xref>].来自Massachusetts总医院的100个冷冻肿瘤样本的额外分析,其中大多数患者大于55岁,鉴定了荷兰验证研究中MP的无转移存活率的阳性预测价值的显着差异(12%与52%),表明老年患者肿瘤的生物差异可能导致MammaPrint测试的临床效用的差异[据xref ref-type="bibr" rid="B4"> 4.据/xref>].此外,没有任何验证报告了通过比赛报告的MP结果,尽管已经表明不同的种族可能有遗传不同的肿瘤[据xref ref-type="bibr" rid="B6"> 6.据/xref>].因此,MP的预后效用在绝经后、种族多样化的美国城市患者人群中可能与它开发和最初验证的欧洲患者人群不同。据/p>
MP产生的风险评估已证明与基于临床参数(如圣加仑、NIH标准和辅助在线)的“传统”风险评估指南存在显著差异,并一直被证明更准确[据xref ref-type="bibr" rid="B2"> 2据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B3"> 3.据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B7"> 7.据/xref>].MP用于转移的MP的高负预测值表明,基于MP的治疗计划而不是常规标准可能识别生物上有利的肿瘤的群体,其中可以拒绝佐剂化疗[据xref ref-type="bibr" rid="B8"> 8.据/xref>].一项前瞻性多中心的欧洲试验,MINDACT(芯片在淋巴结阴性疾病可以避免化疗),目前正在进一步验证这一假说,患者服用有不和谐的MP和传统的风险评估和随机他们基于常规或MP结果接受辅助化疗当这些结果是不一致[据xref ref-type="bibr" rid="B8"> 8.据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B9"> 9.据/xref>].据/p>
MP分析是基于RNA微阵列,需要新鲜组织样本[据xref ref-type="bibr" rid="B1"> 1据/xref>].逻辑上,这提出了一个潜在的挑战,因为手术标本必须被运送新鲜病理上墨和切除不到一小时获得的分析足够的样本。这需要预先计划,并与病理科协调。相比于预测21-基因测定OncotypeDx,这依赖于实时聚合酶链反应(RT-PCR),可以在被执行时,此后勤挑战已被确定为一个缺点福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的部分[据xref ref-type="bibr" rid="B10"> 10据/xref>].然而,与Oncotypedx相比,MP验证用于ER正乳腺癌,验证仅用于仅用于ER阳性癌症。因此,在激素受体阳性和阴性肿瘤的应用中,MP允许获得更多乳腺癌患者的预后信息。然而,与Oncotypedx相反,目前验证MP不用于预测治疗的响应,因此在一个阳性患者有资格获得癌型或MP测试的情况下,oncotypedx具有更多的临床效用[据xref ref-type="bibr" rid="B10"> 10据/xref>].据/p>
结合MP分析,TargetPrint (TP)阵列确定雌激素、孕酮(PR)和HER2-neu (HER2)受体状态,与传统免疫组化(IHC)或荧光原位杂交(FISH)分析高度一致[据xref ref-type="bibr" rid="B11"> 11据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B12"> 12据/xref>].为了测定从新鲜肿瘤中提取的ER,Pr和Her2 mRNA的阳性与阴性受体表达,测定了微阵列阈值,导致IHC / FISH结果的最高一致性[据xref ref-type="bibr" rid="B11"> 11据/xref>].在用于设置最优阈值的原始队列,符合率为不对任何受体的100%,这表明在mRNA水平的肿瘤是通过IHC / FISH和肿瘤是通过IHC / FISH受体阴性受体阳性之间的重叠。随后的验证中预先形成的对患者单独群组,并与IHC / FISH结果,并观察到83和97之间%的一致性率[据xref ref-type="bibr" rid="B11"> 11据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B12"> 12据/xref>].据/p>
患者来自哥伦比亚大学医学中心乳房外科,数据收集于2008年12月至2009年9月。在这段时间内,每一位接受MP检测的患者都由该部门的四名初级乳腺外科医生之一独立确定MP合格性。一般来说,所有肿瘤最大直径大于1cm的患者都被认为符合检测条件。在乳房切除或肿瘤切除或肿瘤切除前的核心穿刺活检中收集肿瘤样本。乳房肿瘤切除术或乳房切除术的标本从手术室运送到病理实验室。一名专业的技术人员协助运输和标本提取。至少,从肿瘤周围获得一个3mm的标本,并放置在RNA保存液中运送到Agendia实验室。芯针活检标本以类似的方式处理。Agendia在加州的中心实验室提取并分析了MP和TP的基因图谱,然后将结果以电子方式发送给主治乳腺外科医生。这些肿瘤由哥伦比亚大学医学中心的病理学部门独立评估组织学和标准受体状态。 ER and PR status was determined by using IHC staining and HER2-neu status by IHC, or if HER2 was 2+, FISH was sent.据/p>
建立IRB批准的MP和/或TP患者数据库来分析结果。数据点包括外科医生、年龄、种族、标本类型(乳房切除术、肿瘤切除术或核心活检)、肿瘤组织学类型、肿瘤阳性淋巴结数量(如果进行腋下淋巴结清扫或前哨淋巴结活检)、肿瘤大小、肿瘤病理分期、免疫组化和/或FISH确定的受体状态,和OncotypeDx复发评分(如果可用)以及MP和TP结果。据/p>
回顾性地,我们鉴定了乳房手术部门的所有患者,患有ER正面或阴性肿瘤,≤3肿瘤阳性淋巴结,肿瘤小于5cm,但最大直径大于1cm。然后计算捕获比例,因为所有患者符合MP评估的这些标准的所有患者分为“所有符合这些标准的患者”。据/p>
共有54例乳腺癌患者提交MP分析的样品,51名患者伴随着TP分析。在这54例患者中,7例患有多个MP和/或TP报告在提交的样品上返回,初步分析中的评估肿瘤的次数是不足的,这是对样品进行第二次分析的初步分析。这导致总共62个MP报告和59个TP报告。54型蛋白患者的种族分布为36(67%)高加索人,9(17%)西班牙裔,6(11%)黑,3(6%)亚洲人。手术标本包括19个肿块切除术,32个肿瘤切除术和3个核心活组织检查。接受核心活组织检查的一名患者没有接受随后的淋巴结评估。oncotypedx是对接受媒体的14名患者进行的。确定这些患者的九个患者的复发风险低(OncotypeDX复发得分<18)和5,中间风险(复发评分18-30)。风险结果在表格中列出据xref ref-type="table" rid="tab1">
1据/xref>.在54名独特的患者中,4例患有> 3个阳性淋巴结,因此不需要MP风险评估。对于剩余的50个独特样品,29(58%)的风险高,7(14%)风险低,14(28%)在样品中肿瘤的数量不足(QNS)。在该组中,50个样品,最大直径为<1cm,其中1(12%)的风险高,剩余7(88%)是QNS。出于七个低风险患者中,三个有一个或多个阳性淋巴结。据/p>
三名患者没有接受TP分析,得到51分个人的患者共有59个TP评估(表据xref ref-type="table" rid="tab2">
2据/xref>).TP结果包括多结果患者的最终报告,共发现ER阴性11例,ER阳性26例,PR阴性18例,PR阳性19例,HER2-neu阴性32例,HER2-neu阳性5例,14份QNS(数量不足)用于TP受体mRNA评估。当将受体状态(2er, 6pr和2her2 -neu)与IHC/FISH进行比较时,8例患者发现10个不一致的结果。这导致整体(ER/PR/Her2-neu合并)不一致结果与独立、非qns受体评估的比例为10/111(9%)。据/p>
逐月回顾显示,在研究的前5个月有17例特殊患者接受了MP治疗,在研究的最后5个月有37例特殊患者接受了MP治疗,增加了117%。对科室每位初级外科医生发送的用于MP分析的总独特样本的比例进行审查,结果显示,外科医生A发送的MP样本占总样本的26/54 (48%),B发送的13/54 (24%),C发送的8/54 (15%),D发送的5/54(9%)。在54例独特的MP患者中,有12例不符合我们用于构建捕获率的合格标准。排除这些患者是基于术后组织病理学评估,其中4例淋巴结阳性超过3个,8例肿瘤最大直径小于1cm。回顾性分析139例最大直径≥1cm、淋巴结阳性≤3个的ER阳性或阴性浸润性肿瘤患者,计算捕获比为42/139(30%)。据/p>
本研究的主要目标是确定在大型城市,第三级护理中心实施MammaPrint测试是否可行。在这方面的一个值得注意的发现是QNS结果的高速率;14/50(28%)返回QNS的所有结果。肿瘤患者的亚组仅为1-5厘米,仅为7/42(17%),具有QNS结果。当评估小(<1cm)肿瘤时,病理学家可能涉及放弃任何诊断组织。这可能会影响病理学家在切除来自较小肿瘤的足够量的组织时的舒适性,因为它们可能面临送到MP分析的肿瘤组织之间的选择,而在制度肿瘤库中将其存放。尽管需要进一步研究由于我们的小样本大小,但为MP样本设定最小尺寸可能导致第三节护理中心的QNS率较低,导致MP的更具成本效益利用率和增加其临床效用。据/p>
However, there would be significant ramifications if MP was restricted to patients with tumors >1 cm. Although OncotypeDx has the benefit of allowing tumor tissue selection after routine pathology processing, thus lowering concerns about sacrificing tumor tissue with small primary tumors, the test is not validated in ER negative tumors. Therefore, a gap in currently commercially available genomic profile options would exist for patients with subcentimeter ER negative tumors.据/p>
出于> 1厘米的肿瘤中,4个小叶癌中的3个具有QNS结果。虽然我们的患者系列足够大,但对这种QNS结果的任何统计学意义得出了统计学意义的结论,但它可能需要进一步调查从具有高足够高的肿瘤细胞的小叶癌的适当大小的肿瘤样本来进一步调查肿瘤细胞进行MP分析。QNS没有趋势导致乳房切除术,肿瘤切除术或核心活检标本之间导致,表明用于收集标本的技术不太重要,即肿瘤的绝对大小。值得注意的是,7个样品中的3个分类为低风险的患者来自一个或多个阳性淋巴结患者。这确实肯定了MP提供从传统评估中不安的风险评估的能力,如果思想试验证明成功,可能会导致避免不必要的化疗。据/p>
如果要有效利用MP,除了样本质量之外,识别符合MP条件的患者和收集个体样本的后勤工作也是至关重要的。需要与病理部门协调,必须有最少数量的肿瘤组织可以发送MP检测。根据我们的经验,后勤问题是可以解决的。在较大肿瘤患者中30%的捕获率表明,许多MP检测可能有用的患者没有进行这种检测。问题是,这种低捕获率是由于新鲜MP标本采集物流方面的基本限制,还是由于每位外科医生在组织标本采集方面的专业知识和他/她倾向于进行这种评估方面的个人差异。按外科医生和月分类的结果表明,本可以达到更高的比率。A外科医生采集的MP标本数量是D外科医生的5倍以上,不同外科医生之间的差异表明,在不改变标本采集物流的情况下,提高捕获率是可行的。同样,在研究的后半部分,标本采集量增加了117%,这表明,随着外科医生对采集过程越来越熟悉,捕获率也大大提高了。我们目前正在通过使用手术室预约单上的复选框来改进病例捕获的标准化。因此,在大型三级护理中心以高捕获率采集新鲜MP和TP样本在后勤上似乎是可行的。据/p>
一般来说,mamaprint结果对内科肿瘤学家做出系统治疗决定非常有兴趣。然而,他们不愿意独立使用MP结果,对于不推荐低风险评分的淋巴结阳性患者化疗感到不舒服。在MINDACT试验完成之前,MP不太可能对临床实践产生重大影响。在此期间,MP分析的亚组选择表明,> 1 cm且ER -的肿瘤患者可能受益;低风险评分可以改变全身治疗建议。据/p>
TP受体评估对IHC / FISH的9%不等调与德国人口类似的研究中发现的8%不一致,强调我们患者人口的多样性不会影响TP评估的准确性[据xref ref-type="bibr" rid="B12"> 12据/xref>].不一致的结果证实了先前的研究,即受体基因的mRNA水平可能与IHC确定的蛋白质受体表达不完全相关[据xref ref-type="bibr" rid="B11"> 11据/xref>那据xref ref-type="bibr" rid="B12"> 12据/xref>].哪种方法更加预测对治疗的反应仍有待确定据italic> .据/italic>当IHC / FISH结果不确定或表明当可在可容纳受体表达研究时,TP评估可作为具有成本效益的辅助。据/p>
Although the study did not involve enough OncotypeDx patients to draw statistically significant results, the 6 patients with discordant results, that is, high risk MP results and either low or intermediate risk OncotypeDx results, may represent fundamental differences between the two gene assays’ risk results and suggest further investigation into disparities between MP and OncotypeDx is warranted. Although MP is used currently for its prognostic value, with the MINDACT trial nearing accrual, MP may soon become a useful predictive tool for planning treatment of breast cancer. Therefore, in ER positive patients who are eligible for both OncotypeDx and MP, discordant results would result in different treatment suggestions for the same individual. It will be of utmost importance to identify the nature and frequency of these discordancies through further study before MP comes into use as a predictive tool. We are continuing to collect MP and OncotypeDx data on prospective patients with tumors greater than 1 cm toward the goal of identifying all patients who may respond to endocrine or HER2 directed therapy. We also plan to further explore the utility of MP for invasive lobular carcinoma. Genomic evaluation of our ethnically diverse patient population may allow better understanding of variations among subgroups.据/p>