SCI 干细胞国际 1687 - 9678 1687 - 966 x Hindawi 10.1155 / 2021/6663960 6663960 研究文章 Nsd2压制内源性逆转录病毒MERVL胚胎干细胞 https://orcid.org/0000 - 0001 - 6753 - 1058 高 婷婷 https://orcid.org/0000 - 0002 - 0538 - 2648 陈 己 https://orcid.org/0000 - 0002 - 0979 - 6645 张 署名为 https://orcid.org/0000 - 0002 - 7429 - 6786 赵 宣 https://orcid.org/0000 - 0002 - 8732 - 7334 胡 肖 https://orcid.org/0000 - 0002 - 3885 - 3960 陆 欣怡 张 分析师Wensheng 药物化学生物学国家重点实验室 药学院 南开大学 天津300350 中国 nankai.edu.cn 2021年 18 1 2021年 2021年 28 10 2020年 31日 12 2020年 5 1 2021年 18 1 2021年 2021年 版权©2021婷婷高et al。 这是一个开放的文章在知识共享归属许可下发布的,它允许无限制的使用,分布和繁殖在任何媒介,提供最初的工作是正确的引用。

促进染色质转录(事实)复杂是一个组蛋白H2A、H2B伴侣蛋白,而压制内源性逆转录病毒(erv)和转录ERV-chimeric记录。它结合转录起始站点和基因的身体区域。在这里,我们调查了下游目标实际上复杂的MERVL识别潜在的监管机构,这是一个关键的有标记基因。H3K36me2概要Ssrp1呈正相关,事实的组件。在H3K36me2沉积酶, Nsd2是表达下调后的损失 Ssrp1。此外,我们表明,Nsd2压抑erv的表达而不影响多能性基因的表达。MERVL和有基因的表达部分获救 Nsd2超表达。的浓缩H3K36me2 ESCs MERVL-chimeric基因上没有下降 Ssrp1。我们的研究发现Nsd2 MERVL的抑制因子,和事实部分压制MERVL表达式通过调节的表达 Nsd2及其下游H3K36me2。

 中央大学基础研究基金 63161150 63151113 中国国家自然科学基金 31871488 31671352 32070858 中国国家重点研究和发展项目 2018年yfa0107000 1。介绍

内源性逆转录病毒是哺乳动物基因组的重要组成部分 1]。他们通常被宿主细胞维持基因组的稳定性。然而,研究还表明,erv功能在开发期间和在小鼠胚胎干细胞(ESCs) [ 2- - - - - - 7]。例如,MERVL标志着都有(2 c)胚胎和ESC人口中少数2 c细胞( 8, 9]。MERVL可以通过各种表观遗传沉默监管机构,如组蛋白H3变体,H3K9甲基转移酶,和组蛋白陪伴 10- - - - - - 15]。最近,我们发现H2A、H2B组蛋白伴侣的事实(促进染色质转录)复杂参与ESCs的镇压MERVL和MERVL-derived神秘成绩单( 16]。事实功能部分通过Usp7去除H2Bub MERVL和MERVL-fused基因( 16]。然而,的影响 Usp7损耗在MERVL感应是弱于复杂事实本身的损失 16]。这意味着还有其他方法存在事实复杂镇压MERVL及其嵌合成绩单的表达。因此,在这项研究中,我们的目标是识别间接通路的下游复杂在压抑MERVL的表达。

我们之前和其他人发现Ssrp1绑定浓缩在基因转录起始站点和身体周围地区( 16, 17]。基因体区域可以被H3K36me3和H3K36me2 18, 19]。一个重要H3K36甲基转移酶家族Nsd家庭。在这里,我们审查的角色Nsd下游实际上复杂的家庭成员压抑ERV表达式。

 2。方法 2.1。细胞培养

E14灯头老鼠胚胎干细胞(ESCs)培养板上涂上无菌0.1 - -0.2%明胶(G1890σ)在介质包含杜尔贝科修改鹰的介质(Hyclone), 15%胎牛血清(Hyclone), 10 ng / ml白血病抑制因子(生活)(Z03077 GenScript), 1%青霉素和链霉素(P1400 Solarbio)、谷酰胺(Gibco) 2毫米,0.1毫米不必要的氨基酸(Gibco)和0.1毫米 β巯基乙醇(σ)。ESCs是每两天维修通道。

 2.2。ChIP-seq数据的分析

ChIP-seq数据分析,阅读都是第一次处理Cutadapt削减适配器序列和低质量的读取和随后映射到鼠标使用Bowtie2 mm10基因组组装。Ssrp1之间的相关系数,H3K4me3 H3K36me2,并从Deeptools H3K36me3由plotCorrelation决定。ChIP-seq信号从Deeptools浓缩bamCompare获得的文件,和芯片信号行情节也由Deeptools生成。从Gencode推断基因结构信息。vM21注释文件。

 2.3。逆转录和qPCR

从细胞总RNA分离RNAiso试剂(DEPC B9109、豆类)水(B501005 Sangon生物技术)在RNase-free管DNase我治疗后(401001年,巢生物技术)。反转录与1执行 μ使用Transcriptor g纯化RNA合成第一链cDNA工具包(4897030001,罗氏公司)如前所述 20.]。qPCR分析使用SYBR绿色qPCR大师(H97410 Yeasen)和混合qPCR检测系统(CFX384实时系统,Bio-Rad)根据标准协议。引物合成Sangon生物技术和包括在表中 1。

qPCR分析引物。

基因 向前 反向
Nsd1 TCCGGTGAATTTAGATGCCTCC CGGTAACTGCATAGTACACCCAT
Nsd2 GGTGATCCTGGCACAGACAA GAGCAGAGCCTGTGGACTTT
Nsd3 CCGAGGTTGTGCCAAAGAAG ACGGAGCTGTCACTGAATCTG
MERVL AAGAGCCAAGACCTGCTGAG TCCTCGTTTCTGCAACTGGT
LINE1 GGACCAGAAAAGAAATTCCTCCCG CTCTTCTGGCTTTCATAGTCTCTGG
SINEB1 GTGGCGCACGCCTTTAATC GACAGGGTTTCTCTGTGTAG
Oct4 GTGGAAAGCAACTCAGAGG GGTTCCACCTTCTCCAACT
Sox2 GCGGAGTGGAAACTTTTGTCC CGGGAAGCGTGTACTTATCCTT
Nanog TTGCTTACAAGGGTCTGCTACT ACTGGTAGAAGAATCAGGGCT
Zscan4 GAGATTCATGGAGAGTCTGACTGATGAGTG GCTGTTGTTTCAAAAGCTTGATGACTTC
成绩最优的学生 CCCAGCGACTCAAACTCCTTC GGACTTCGTCCAGCAGTTGAT
芯片控制 GATTAGCAGCTCCACAGGA TGGACAATGTGGCCTGTTTA
Zfp809 芯片 AAGCTGGCTGACTGTAGTGG GTGAGCCTTCCAATTCCGGA
Foxa2 CCCTACGCCAACATGAACTCG GTTCTGCCGGTAGAAAGGGA
Sox17 GATGCGGGATACGCCAGTG CCACCACCTCGCCTTTCAC
Gata4 CCCTACCCAGCCTACATGG ACATATCGAGATTGGGGTGTCT
Nkx2.5 GACAAAGCCGAGACGGATGG CTGTCGCTTGCACTTGTAGC
Msx1 TGCTGCTATGACTTCTTTGCC GCTTCCTGTGATCGGCCAT
Pax6 TACCAGTGTCTACCAGCCAAT TGCACGAGTATGAGGAGGTCT
Foxd3 GAGTTCATCAGCAACCGTTTTC CGAAGCTCTGCATCATCAGC
Gata3 CTCGGCCATTCGTACATGGAA GGATACCTCTGCACCGTAGC
2.4。shRNA-Mediated基因损耗

shrna目标 Nsd2设计一个在线工具( http://sirna.wi.mit.edu/)[ 21]。目标序列的shrna CCTGGTGCTCATGATACTAAA shRNA1和GAGCTGACTTTCAACTATAA shRNA2。的成分被克隆到pSuper-puro GENEWIZ公司和合成。1 μg质粒转染到鼠标的ESCs Polyjet (SignaGen)。细胞进一步培养三天在嘌呤霉素选择(1 μg / ml)和RNA提取的收获。

 2.5。染色质免疫沉淀反应耦合qPCR(芯片)

ChIP-qPCR像之前描述的那样执行( 16]。ESCs短暂,收获和交联1%甲醛、和细胞固定停止添加甘氨酸。细胞主要是细胞溶解,染色质提取收集和用获得可溶性染色质片段。染色质的样本孵化与特定的抗体和免疫沉淀反应蛋白G磁珠(GenScript,美国)。DNA免疫沉淀反应下筛选了,qPCR decrosslinked,和分析。免疫沉淀反应的抗体使用anti-H3K36me2 (ab9049 Abcam)。

 2.6。建立ESC细胞系Overexpressing Nsd2

鼠标 Nsd2编码区被克隆到pCAG-3HA向量和潮霉素抗性和净化设备(1211 - 01,Biomiga)。 Ssrp1- / -ESCs转染有1 μg质粒表达 Nsd2通过Polyjet试剂(SL100688 SignaGen)按照制造商的推荐方案。与800年的ESCs是不断选择 μg / ml潮霉素B为14天。ESCs选择性细胞培养后,收集下游实验。

 3所示。结果 3.1。复杂的绑定与H3K36甲基化相关

以前,我们发现事实复杂互动与启动子和基因体区域,由H3K36me2/3标记。有趣的是,基因分布剖面H3K36me2和H3K36me3呈正相关,Ssrp1(图 1(一)),相比之下的低相关性强度的Ssrp1 H3K4me3(图 1(一))。此外,这是值得注意的,H3K36me3浓缩在基因体从转录开始不断增加网站(TSS)转录终止网站(te)而H3K36me2优先与TSS地区和逐渐衰变TSS te(图 1 (b))。的分布剖面H3K36me2更类似于事实上比H3K36me3(复杂的数字 1(一)和 1 (b))。因此,我们进一步研究了Nsd家族基因的表达( Nsd1, Nsd2, Nsd3),这是已知的调解H3K36甲基化。 Nsd1表达最高的ESCs的表情吗 Nsd2和 Nsd3较低(图 1 (c))。的表达 Nsd1和 Nsd3保持不变或略有调节ESCs没有复杂(图 1 (d))。然而, Nsd2表达式中表达下调 Ssrp1- / -ESCs(图 1 (d)),这意味着 Nsd2作为一个潜在的下游靶基因复杂的事实。

Nsd2-mediated H3K36me2与Ssrp1绑定。(a)基因的分布剖面H3K36me2, H3K36me3 H3K4me3, Ssrp1。皮尔森相关的颜色规模代表了力量。(b) ChIP-seq信号密度Ssrp1浓缩,H3K4me3 H3K36me2, H3K36me3 (<在line-formula> Y 设在)基因的身体从TSS te (<在line-formula> X 设在)。H3K36me3浓缩从TSS增加到测试工程师。(c)相对mRNA的表达 Nsd1, Nsd2, Nsd3ESCs根据qPCR。(d) qPCR分析 Nsd1, Nsd2, Nsd3在WT ESC和表达水平 Ssrp1- / -ESC;数据显示为<在line-formula> 的意思是 ± 年代 。 e 。 米 。 ;<在line-formula> n = 3 生理上独立的重复。ns:无意义的;<在line-formula> ∗ p < 0.05 ;<在line-formula> ∗ ∗ p < 0.01 。

 3.2。在的ESCs Nsd2压制MERVL

同意密切的相似之处的形象和H3K36me2 Ssrp1绑定,主要Nsd2 chromatin-regulatory活动是调节组蛋白H3的dimethylation赖氨酸36 (H3K36me2) [ 19]。因此,我们耗尽 Nsd2与两个独立的ESCs shrna检查Nsd2能否调节erv的表达(图 2(一个))。的损耗 Nsd2并不影响ESCs的细胞形态(图 2 (b))。而且,多能性基因的表达( Oct4, Sox2, Nanog)没有被两个 Nsd2同时shrna(图 2 (c))。的抑制 Nsd2由两个独立的shrna没有扰乱内胚层分化标记的表达( Foxa2和 Sox17)、中胚层( Gata4和 Nkx2.5),外胚层( Msx1和 Pax6)和滋养外胚层( Foxd3和 Gata3)在同一时间(数字 2 (d)- - - - - - 2 (g)),这表明ESCs保持未分化 Nsd2。有趣的是,MERVL被激活的表达~ 2折 Nsd2损耗(图 2 (h)),但其他反转位子活动(LINE1或正弦B1)激活或较低表达下调,下游确认Nsd2行为实际上复杂的镇压ERV表达式。这些结果表明,Nsd2压制MERVL而不影响ESC多能性的表达。

损耗的 Nsd2ESCs。(一)qPCR的相对表达水平的分析 Nsd2后 Nsd2损耗的ESCs的正常化 Gapdh。数据被绘制<在line-formula> 的意思是 ± 年代 。 e 。 米 。 ,<在line-formula> n = 3 生物学重复。(b)细胞的形态 Nsd2在的ESCs损耗。酒吧,100 μm。(c) qPCR分析多功能基因( Oct4, Sox2, NanogESCs)与 Nsd2枯竭。(d) qPCR内胚层标记分析 Foxa2和 Sox17(d),中胚层标记 Gata4和 Nkx2.5(e),外胚层标记 Msx1和 Pax6(f)和滋养外胚层标记 Foxd3和 Gata3(g)。(h) qPCR MERVL表达水平和其他分析反转位子活动(LINE1、正弦B1)之后 Nsd2在的ESCs损耗。结果被规范化 Gapdh。数据显示为<在line-formula> 的意思是 ± 年代 。 e 。 米 。 ;<在line-formula> n = 3 生理上独立复制;ns:无意义的;<在line-formula> ∗ p < 0.05 ;<在line-formula> ∗ ∗ p < 0.01 ;<在line-formula> ∗ ∗ ∗ p < 0.001 。

 3.3。<斜体> Nsd2 < /斜体>过度救助MERVL表达<斜体> Ssrp1 < /斜体> <一口> - / - ESCs < /一口>

自Nsd2 MERVL表达和压制 Nsd2中表达下调 Ssrp1- / -ESCs,我们接下来是否恢复 Nsd2表达 Ssrp1- / -ESCs可以挽救MERVL的表达。因此,我们建立了一个 Ssrp1- / -ESC与 Nsd2过表达。我们的qPCR结果显示 Nsd2成功在 Ssrp1- / -ESCs(图 3(一个))。此外,过度的 Nsd2可以部分降低MERVL的表达 Ssrp1- / -ESCs(图 3 (b))。此外,有标记基因的表达( Zscan4和 成绩最优的学生(图)部分恢复 3 (c))。这些结果表明, Nsd2是一个重要的下游靶基因的压抑erv Ssrp1和有基因。

Nsd2过度救助MERVL和有基因的表达。(一)qPCR分析 Nsd2表达过度后 Nsd2在 Ssrp1- / -ESC。结果显示为<在line-formula> 的意思是 ± 年代 。 e 。 米 。 ,<在line-formula> n = 3 生理上独立的复制和规范化 Gapdh。(b) qPCR MERVL经过过度的表达分析 Nsd2在 Ssrp1- / -ESC。<在line-formula> 的意思是 ± 年代 。 e 。 米 。 ,<在line-formula> n = 3 。(c) qPCR有标记基因的表达分析 Zscan4和 成绩最优的学生超表达后 Nsd2在 Ssrp1- / -ESC。控制:控制;OE:过度;<在line-formula> 的意思是 ± 年代 。 e 。 米 。 ,<在line-formula> n = 3 ;<在line-formula> ∗ ∗ p < 0.01 ;<在line-formula> ∗ ∗ ∗ p < 0.001 。

 3.4。Nsd2-Mediated H3K36me2减少MERVL-Fused基因在<斜体> Ssrp1 < /斜体> <一口> - / - ESCs < /一口>

我们进一步调查的目标是否Nsd2, H3K36me2,影响MERVL-fusion ChIP-qPCR ESCs基因没有事实。我们ChIP-qPCR结果表明H3K36me2丰富等MERVL-fused基因 Zfp809(图 4(一)),但不是在控制区域(图 4 (b))。然而,这种浓缩在ESC没有减少MERVL-fusion基因 Ssrp1表达式(数据 4(一)和 4 (b))。在一起,这些表明,降低浓缩H3K36me2 MERVL-fused基因可以解释MERVL-fused基因的激活 Nsd2downregulation在 Ssrp1- / -ESCs。

H3K36me2浓缩MERVL-fused基因。(a, b) ChIP-qPCR H3K36me2浓缩MERVL-fused基因的分析 Zfp809(a)和(b)在WT ESC和控制区域 Ssrp1- / -ESC与规范化 Gapdh和输入;数据显示为<在line-formula> 的意思是 ± 年代 。 e 。 米 。 (<在line-formula> n = 3 提取)。ns:无意义的;<在line-formula> ∗ ∗ ∗ p < 0.001 。

 4所示。讨论

总之,我们发现Nsd2 MERVL和MERVL-fused 2 c基因的抑制因子,以上的差别,对这些 Nsd2担任二级监管途径激活MERVL后的损失 Ssrp1。有趣的是,只有 Nsd2(图 1 (d)),但不 Nsd1也不 Nsd3,中断的表达下调是函数,考虑到所有三个参与H3K36 Nsd基因甲基化。Nsd2是一个重要的H3K36me2甲基转移酶( 19, 22]。的损失 Nsd2模仿H3.3K36M突变,但不是 Nsd1或 Setd2模仿H3.3K36M在脂肪生成的影响 23),暗示的独特作用Nsd2 Nsd成员之间基因表达的调控。H3K6me2激活和抑制有关的基因表达 24]。最近报道,Nsd1 / Nsd2-mediated基因间H3K36me2招募Dnmt3a对DNA甲基化 25, 26]。在酵母细胞,H3K36me1/2/3也展示了镇压的转录( 27]。此外,H3K36me2可以招募Rpd3s组蛋白脱乙酰酶抑制寄生转录( 28]。这些都是符合我们发现H3K36me2减少MERVL-fused基因后的损失 Ssrp1(数据 4(一)和 4 (b)),这意味着一个潜在的镇压H3K36me2的角色。

Nsd2不仅参与基因转录调控。它参与调节基因组稳定性和甲醇non-histone蛋白质。Nsd2-mediated H3K36me2促进nonhomologous end-joining在无保护端粒,从而提高基因组不稳定性引起的端粒功能障碍( 29日]。人类NSD2-mediated PTEN甲基化调节细胞对DNA损伤的反应( 30.]。最近发现,DNA损伤是引起的损耗MERVL活化剂Zscan4 [ 3, 31日]。反应的ATR和CHK1复制强调激活 Zscan4和MERVL 20.),这意味着DNA损害复制压力和Zscan4相互地互相调节。这将是有趣的调查是否涉及Nsd2 DNA损伤修复与将来Zscan4及其关系。

 5。结论

总之,我们发现 Nsd2的下游基因,压抑MERVL,不影响ESC多能性。的减少 Nsd2在 Ssrp1- / -ESCs伴随着H3K36me2 MERVL-fused基因超表达的减少 Nsd2部分获救MERVL的表达。这些研究结果建立Nsd2 ESCs MERVL的一个重要的抑制因子,在事实的损失函数。

 数据可用性

发表ChIP-seq数据我们分析GSE141791 Ssrp1 [ 16),GSE117155 H3K36me2 [ 32),GSE110321 H3K36me3 [ 33),GSE90893 H3K4me3 [ 34]。

 的利益冲突

我们声明,没有利益冲突,在这项研究中。

 作者的贡献

X.L.构思和设计研究。T.G.,F。C。,和W。Z。performed most experiments. X.Z. did bioinformatics analysis. T.G., X.H., and X.L. wrote the manuscript.

 确认

这项工作是由国家重点支持的研究和发展项目的中国(2018 yfa0107000),中国国家自然科学基金(32070858,32070858,32070858),以及基础研究基金为中央大学(63151113,63161150)。

 Enriquez-Gasca R。 古尔德 p。 罗 h . M。 宿主基因调控的转座的元素:新、旧的和丑陋的 病毒 2020年 12 10 1089年 10.3390 / v12101089 32993145 陆 X。 萨克斯 F。 拉姆齐 l。 雅克。 p E。 Goke J。 Bourque G。 Ng H . H。 需要长时间的非编码RNA逆转录病毒HERVH是人类胚胎干细胞的身份 《自然结构和分子生物》上 2014年 21 4 423年 425年 10.1038 / nsmb.2799 2 - s2.0 - 84898010302 24681886 张 W。 陈 F。 陈 R。 谢 D。 杨 J。 赵 X。 郭 R。 张 Y。 沈 Y。 Goke J。 刘 l 陆 X。 Zscan4c激活内源性逆转录病毒MERVL和卵裂胚胎基因 核酸的研究 2019年 47 16 8485年 8501年 10.1093 / nar / gkz594 2 - s2.0 - 85073311711 31304534 Goke J。 陆 X。 常ydF4y2Ba y S。 Ng H . H。 Ly l . H。 萨克斯 F。 Szczerbinska 我。 不同类别的内源性逆转录病毒的动态转录元素是特定的早期人类胚胎干细胞的数量 细胞干细胞 2015年 16 2 135年 141年 10.1016 / j.stem.2015.01.005 2 - s2.0 - 84924907701 25658370 成长 e . J。 弗林 r。 查韦斯 s . L。 贝里斯 n . L。 Wossidlo M。 Wesche d . J。 马丁 l 制品 c . B。 布利什 c。 常 h . Y。 Reijo啤梨 r。 Wysocka J。 内在的逆转录病毒在人类早期胚胎和多能细胞活化 自然 2015年 522年 7555年 221年 225年 10.1038 / nature14308 2 - s2.0 - 84930227422 25896322 心肌梗死 年代。 李 X。 李 x P。 Veldman g . M。 Finnerty H。 Racie l LaVallie E。 唐 x Y。 爱德华。 P。 豪斯 年代。 基思 j . C。 Jr。 麦科伊 j . M。 合胞体蛋白是一个俘虏逆转录病毒包膜蛋白参与人类胎盘形态发生 自然 2000年 403年 6771年 785年 789年 10.1038 / 35001608 2 - s2.0 - 0342545919 Peaston 答:E。 Evsikov 答:V。 Graber j . H。 德弗里斯 w . N。 霍尔布鲁克 答:E。 你 D。 诺尔斯 B . B。 反转位子活动调节宿主基因在小鼠卵母细胞和胚胎植入前的胚胎 细胞发育 2004年 7 4 597年 606年 10.1016 / j.devcel.2004.09.004 2 - s2.0 - 5044251591 15469847 Macfarlan t·S。 吉福德 w·D。 德里斯科尔 年代。 Lettieri K。 罗 h . M。 Bonanomi D。 弗斯 一个。 歌手 O。 Trono D。 普法夫 s . L。 胚胎干细胞的力量波动与内源性逆转录病毒的活动 自然 2012年 487年 7405年 57 63年 10.1038 / nature11244 2 - s2.0 - 84863458292 22722858 Kigami D。 南城 N。 高山 H。 Imai H。 MuERV-L最早的转录基因在小鼠一个细胞的胚胎 生物的繁殖 2003年 68年 2 651年 654年 10.1095 / biolreprod.102.007906 2 - s2.0 - 0037307630 12533431 elsas 美国J。 能剧 k . M。 迪亚兹 N。 阿莱 c, D。 Banaszynski l。 组蛋白H3.3内源性逆转录病毒需要元素沉默在胚胎干细胞 自然 2015年 522年 7555年 240年 244年 10.1038 / nature14345 2 - s2.0 - 84930939091 25938714 Hatanaka Y。 井上 K。 Oikawa M。 Kamimura 年代。 Ogonuki N。 小玉 e . N。 Ohkawa Y。 Tsukada y。 Ogura 一个。 组蛋白伴侣CAF-1介导的组蛋白修饰保护胚胎植入前的小鼠胚胎从内生反转位子活动 美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国 2015年 112年 47 14641年 14646年 10.1073 / pnas.1512775112 2 - s2.0 - 84948424417 26546670 Ishiuchi T。 Enriquez-Gasca R。 弘水谷 E。 Bošković 一个。 Ziegler-Birling C。 Rodriguez-Terrones D。 和歌山 T。 Vaquerizas j . M。 Torres-Padilla m E。 类似胚胎早期细胞诱导表达下调复制-依赖的染色质组装 《自然结构和分子生物》上 2015年 22 9 662年 671年 10.1038 / nsmb.3066 2 - s2.0 - 84940990521 26237512 杨 b . X。 el Farran c。 郭 h . C。 余 T。 方 h·T。 王 h·F。 施莱辛格 年代。 Seah y f·S。 吴 g . y . L。 Neo s P。 李 Y。 Lorincz m . C。 Tergaonkar V。 Lim t M。 陈 l Gunaratne J。 柯林斯 J·J。 高夫 s P。 戴利 g . Q。 李 H。 吟游诗人 f。 Loh y . H。 系统识别的因素前病毒沉默在胚胎干细胞 细胞 2015年 163年 1 230年 245年 10.1016 / j.cell.2015.08.037 2 - s2.0 - 84945472619 26365490 罗 h . M。 Jakobsson J。 Mesnard D。 Rougemont J。 狐狸 年代。 Aktas T。 美拉德 p V。 Layard-Liesching H。 Verp 年代。 侯爵 J。 斯帕斯 F。 Constam d·B。 Trono D。 KAP1控制胚胎干细胞内源性逆转录病毒 自然 2010年 463年 7278年 237年 240年 10.1038 / nature08674 2 - s2.0 - 74549116659 20075919 Maksakova 我一个。 汤普森 p . J。 Goyal P。 琼斯 s . j . M。 辛格 p . B。 卡里 M . M。 Lorincz m . C。 KAP1截然不同的角色,HP1和G9a / GLP的沉默two-cell-specific逆转录转座子MERVL在小鼠ES细胞 表观遗传学与染色质 2013年 6 1 15 10.1186 / 1756-8935-6-15 2 - s2.0 - 84878422484 23735015 陈 F。 张 W。 谢 D。 高 T。 越南盾 Z。 陆 X。 组蛋白伴侣实际上压制逆转录转座子MERVL MERVL-derived神秘的推动者 核酸的研究 2020年 48 18 10211年 10225年 10.1093 / nar / gkaa732 32894293 Mylonas C。 Tessarz P。 转录镇压的事实与监管染色质可访问性启动子的胚胎干细胞 生命科学联盟 2018年 1 第三条e201800085 10.26508 / lsa.201800085 2 - s2.0 - 85052466396 30456357 米凯尔森 t·S。 Ku M。 杰夫 d·B。 伊萨克 B。 利伯曼 E。 Giannoukos G。 阿尔瓦雷斯 P。 布洛克曼 W。 金 t·K。 Koche r P。 李 W。 林业局 E。 马路 一个。 压 一个。 拉斯 C。 谢 X。 迈斯纳 一个。 Wernig M。 Jaenisch R。 Nusbaum C。 着陆器 大肠。 伯恩斯坦 b E。 全基因组的地图多能和lineage-committed细胞中染色质状态 自然 2007年 448年 7153年 553年 560年 10.1038 / nature06008 2 - s2.0 - 34547624303 17603471 郭 a·J。 张 P。 陈 K。 Zee b . M。 Kioi M。 罗兰 J。 习 Y。 公园 b . H。 史 X。 加西亚 b。 李 W。 Gozani O。 的组蛋白H3 NSD2链接dimethylation赖氨酸36致癌编程 分子细胞 2011年 44 4 609年 620年 10.1016 / j.molcel.2011.08.042 2 - s2.0 - 81355133161 22099308 Atashpaz 年代。 Samadi夏姆斯 年代。 冈萨雷斯 j . M。 塞巴斯蒂 E。 Arghavanifard N。 汤圆 一个。 阿尔伯斯 E。 赛季 年代。 丝腰带 G。 Soffientini P。 Allievi E。 Cancila V。 Bachi 一个。 Fernandez-Capetillo O。 Tripodo C。 法拉利 F。 Lopez-Contreras a·J。 使用 V。 ATR扩大胚胎干细胞的命运可能复制压力的反应 eLife 2020年 9 10.7554 / eLife.54756 元 B。 Latek R。 Hossbach M。 Tuschl T。 Lewitter F。 小干扰rna寡核苷酸siRNA选择服务器:一个自动预测服务器 核酸的研究 2004年 32 Web服务器 W130 W134 10.1093 / nar / gkh366 2 - s2.0 - 3242890471 15215365 李 Y。 Trojer P。 徐 c F。 张 P。 郭 一个。 特鲁里街 w·J。 三世 乔 Q。 Neubert t。 徐 r·M。 Gozani O。 Reinberg D。 NSD的组蛋白赖氨酸甲基转移酶家族的目标取决于基质的性质 《生物化学》杂志上 2009年 284年 49 34283年 34295年 10.1074 / jbc.M109.034462 2 - s2.0 - 71749121455 19808676 壮族 l 张成泽 Y。 公园 y K。 李 j·E。 耆那教徒的 年代。 Froimchuk E。 博朗 一个。 刘 C。 Gavrilova O。 通用电气 K。 损耗的Nsd2-mediated组蛋白H3K36甲基化影响脂肪组织发育和功能 自然通讯 2018年 9 1 1796年 10.1038 / s41467 - 018 - 04127 - 6 2 - s2.0 - 85046648548 29728617 瓦格纳 e . J。 卡彭特 p . B。 理解在组蛋白H3 Lys36甲基化的语言。自然评论 自然评论分子细胞生物学 2012年 13 2 115年 126年 温伯格 d . N。 Papillon-Cavanagh 年代。 陈 H。 悦 Y。 陈 X。 Rajagopalan k . N。 豪 C。 McGuire j . T。 徐 X。 Nikbakht H。 Lemiesz 答:E。 Marchione d . M。 Marunde m·R。 Meiners m·J。 脸颊 m·A。 基奥计划 m . C。 Bareke E。 Djedid 一个。 Harutyunyan 答:S。 Jabado N。 加西亚 b。 李 H。 阿莱 c, D。 北京 J。 陆 C。 组蛋白标记H3K36me2新兵DNMT3A和形状的基因间的DNA甲基化景观 自然 2019年 573年 7773年 281年 286年 10.1038 / s41586 - 019 - 1534 - 3 2 - s2.0 - 85071916685 31485078 徐 W。 李 J。 荣 B。 赵 B。 王 M。 戴 R。 陈 Q。 刘 H。 顾 Z。 刘 年代。 郭 R。 沈 H。 吴 F。 局域网 F。 DNMT3A读取和连接组蛋白H3K36me2 DNA甲基化 蛋白和细胞 2020年 11 2 150年 154年 10.1007 / s13238 - 019 - 00672 - y 31758527 DiFiore j . V。 “ t·S。 王 Y。 李 B。 西蒙 j . M。 特拉 b D。 独特的和共享的角色组蛋白H3K36转录调控功能的甲基化状态 细胞的报道 2020年 31日 10 107751年 10.1016 / j.celrep.2020.107751 李 B。 杰克逊 J。 西蒙 m D。 Fleharty B。 果戈理 M。 塞德尔 C。 工人 j·L。 Shilatifard 一个。 组蛋白H3赖氨酸36 dimethylation (H3K36me2)足以招募Rpd3s组蛋白脱乙酰酶复杂和镇压的转录 《生物化学》杂志上 2009年 284年 12 7970年 7976年 10.1074 / jbc.M808220200 2 - s2.0 - 65549095078 19155214 de Krijger 我。 van der老爹 J。 Peuscher m . H。 埃德尔 M。 雅可布 j·j·L。 由MMSET H3K36 dimethylation促进古典异源end-joining保护端粒 致癌基因 2020年 39 25 4814年 4827年 10.1038 / s41388 - 020 - 1334 - 0 32472076 张 J。 李 y R。 见鬼 F。 氮化镓 W。 梅农 答:V。 Katon j . M。 许 c . H。 Asara j . M。 Tibarewal P。 莱斯利 n R。 史 Y。 Pandolfi P P。 魏 W。 PTEN甲基化通过NSD2控制细胞对DNA损伤的敏感性 癌症的发现 2019年 9 9 1306年 1323年 2159 - 8290. - 10.1158 / cd - 18 - 0083 2 - s2.0 - 85071263223 31217297 Srinivasan R。 Nady N。 Arora N。 谢长廷 l . J。 Swigut T。 Narlikar g . J。 Wossidlo M。 Wysocka J。 Zscan4结合nucleosomal微卫星DNA和保护鼠标两个胚胎DNA损伤 科学的进步 2020年 6 12 eaaz9115 10.1126 / sciadv.aaz9115 32219172 勒罗伊 G。 Oksuz O。 Descostes N。 苍老师 Y。 Ganai r。 喀拉海 h . O。 余 j . R。 李 c . H。 斯塔福德 J。 Shilatifard 一个。 Reinberg D。 LEDGF和HDGF2缓解nucleosome-induced分化细胞中转录的障碍 科学的进步 2019年 5 10 eaay3068 黄 H。 翁 H。 周 K。 吴 T。 赵 b S。 太阳 M。 陈 Z。 邓 X。 肖 G。 奥氏小体 F。 克莱姆 l 吴 H。 左 Z。 清ydF4y2Ba X。 越南盾 Y。 周 Y。 清ydF4y2Ba H。 道 年代。 杜 J。 刘 J。 陆 Z。 阴 H。 Mesquita 一个。 元 c . L。 胡 y . C。 太阳 W。 苏 R。 越南盾 l 沈 C。 李 C。 清 Y。 江 X。 吴 X。 太阳 M。 关 j·L。 曲 l 魏 M。 Muschen M。 黄 G。 他 C。 杨 J。 陈 J。 组蛋白H3 trimethylation在赖氨酸36指南<年代up>6RNA修改co-transcriptionally 自然 2019年 567年 7748年 414年 419年 10.1038 / s41586 - 019 - 1016 - 7 2 - s2.0 - 85063255258 30867593 Chronis C。 Fiziev P。 Papp B。 一部 年代。 Bonora G。 萨布 年代。 恩斯特 J。 普拉斯 K。 合作结合转录因子协调重组 细胞 2017年 168年 3 442年 459. e20 e20 10.1016 / j.cell.2016.12.016 2 - s2.0 - 85009807694 28111071