PD
帕金森病
2042 - 0080
2090-8083
Hindawi出版公司
10.1155 / 2015/973298
973298
研究文章
一个协会
BACE1 挪威人群帕金森病的基因多态性
兰格
约翰内斯
1
Lunde
克里斯汀·阿瑟
1,2
2
民心
卡米拉
2
Mø噢
冰岛西蒙
3.
Tysnes
Ole-Bjørn
4,5
5
阿尔维斯
圭多
1,6
6
拉森
Jan培特
1
Maple-Grø民主党
乔迪•
1,2
2
Pisani
安东尼奥
1
挪威运动障碍中心
斯塔万格大学医院
4011斯塔万格
挪威
helse-stavanger.no
2
Organelle研究中心
斯塔万格大学
4036年,斯塔万格
挪威
uis.no
3.
生物科学系
圣约翰大学
纽约
纽约11439
美国
stjohns.edu
4
神经学部门
Haukeland大学医院
5021年卑尔根
挪威
helse-bergen.no
5
临床医学研究所
卑尔根大学
5021年卑尔根
挪威
uib.no
6
神经学部门
斯塔万格大学医院
4011斯塔万格
挪威
helse-stavanger.no
2015
14
12
2015
2015
05
10
2015
29
11
2015
14
12
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版权所有©2015 Johannes Lange等人。
这是一篇在知识共享署名许可下发布的开放存取的文章,它允许在任何媒体上无限制地使用、传播和复制,只要原始作品被适当地引用。
背景 .帕金森病(PD)和阿尔茨海默病(AD)具有共同的病理特征,包括淀粉样蛋白病理。淀粉样蛋白- β肽是由淀粉样前体蛋白(APP)序列蛋白水解产生的,研究发现加工通路基因的遗传变异会增加AD的风险;然而,其在PD中的作用尚不清楚。
方法 .本研究的目的是调查5个基因(
ADAM10 ,
BACE1 ,
BACE2 ,
PSEN2 ,
俱乐部 在挪威ParkWest研究的一项以人群为基础的PD事件患者队列和对照受试者中,APP处理通路影响PD风险。
结果 .我们在中发现了rs638405的关联
BACE1 因此,在基因水平上,β淀粉样蛋白病理学与帕金森病之间存在一种新的联系。
1.导言
帕金森病(PD)和阿尔茨海默病(AD)是两种最常见的年龄相关性神经退行性疾病。PD主要是一种运动障碍,其特征性运动特征主要是黑质致密部多巴胺能神经元缺失所致[
1 ].然而,PD患者可能会出现一系列非运动性症状,包括一些通常与AD相关的特征,如轻度认知障碍,经常发展为痴呆[
2 ]除了Lewy体病理学外,典型的AD相关形态学改变,包括β淀粉样蛋白(A
β )病理学被认为与帕金森病痴呆的发病机制有关。这一点通过PET的神经影像学研究得到了证实,并且两者之间存在强烈的反向关联
β 尸检时的负荷和帕金森病的痴呆时间[
3. ,
4 ].
一个
β 肽是由淀粉样前体蛋白(APP)裂解形成的,APP可被至少三种蛋白酶加工,称为
α -,
β -,及
γ -分泌酶,通过淀粉样变或非淀粉样变APP处理途径[
5 ].根据淀粉样蛋白级联假说,A
β AD的产生和清除在AD发病机制中起着关键作用。两者的遗传变异
应用程序 而APP处理途径的编码酶基因与AD的改良风险相关[
6 - - - - - -
8 ],提高APP产量[
6 及脑脊液A的变化
β 水平(
9 - - - - - -
11 ].鉴于A的出现
β ,我们试图确定参与APP处理和清除的5个基因是否存在遗传变异(
ADAM10 ,
BACE1 ,
BACE2 ,
PSEN2 ,
CLU1 )是一项未经选择的、以人群为基础的PD事件队列患者和年龄匹配对照的PD的危险因素。
2.方法
2.1.病人和控制
所有患者(
n
=
184
,男性60.9%,平均发病年龄68.1岁
±
9.2 SD)和正常对照组(
n
=
178
男性占51.4%,纳入时平均年龄66.7岁
±
9.6 SD)参与正在进行的挪威ParkWest研究[
12 ].ParkWest是一项以人群为基础的针对drug-naïve PD新诊断患者的多中心研究,旨在确定PD的发病率、神经生物学和预后。在2004年11月1日至2006年8月31日的22个月期间,采用多种招募策略来确定挪威西南部四个县的所有PD事件患者[
12 ].患者在开始药物治疗前进行全面、规范的临床检查,采用统一帕金森病评定量表(UPDRS)对疾病严重程度进行评分,基线评分23.6分
±
Hoehn和Yahr分期(基线评分1.9
±
0.6 SD)。痴呆症的诊断是根据既定的标准进行的[
13 和两位神经学家的研究,如前所述[
14 ].帕金森病患者目前正在继续随访,只有在最近一次临床访视前诊断保持不变的患者,平均为4.6(1.1%) SD)首次出现数年后,被认为有资格进行本研究,以最大限度地提高诊断准确性[
12 ].在同一时期,我们也在同一地理区域招募了正常的对照组。单核苷酸多态性(SNP)基因型分析不考虑作为患者一级或二级亲属的对照(
n
=
10
).所有参与者签署书面知情同意书。挪威卑尔根大学研究伦理区域委员会批准了这项研究。
2.2.基因分析
为了研究遗传变异在APP加工基因在PD风险中的作用,我们首先基于它们在APP加工通路中的生物学确立的作用选择了位点[
5 ].如果SNPs位于已知的调控或编码区域,并且/或在之前的研究中与APP处理或AD相关,则进一步优先排序(BACE [
8 ,
15 ];ADAM10 [
9 ];PSEN [
10 ];和俱乐部(
16 ]).在5个基因中选择了8个SNP:
ADAM10 (rs514049 rs2305421),
BACE1 (rs638405 rs11601511),
BACE2 (rs12149 rs2252576),
PSEN2 (rs1295652),
俱乐部 (rs11136000)。我们还包括
ApoE SNPs rs429358和rs7412,此前已被证实与PD、AD和淀粉样斑块负担有关[
17 - - - - - -
19 ].
采用预先设计的TaqMan SNP基因分型法进行大规模等位基因鉴别分析(Applied Biosystems)。扩增反应在ABI PRISM 7300 Real Time PCR系统中进行。利用序列检测系统软件检测扩增后的等位基因特异性荧光。所有SNPs的隔夜拆借利率为>99%。TaqMan重复测定的一致性为100%。
2.3.统计分析
使用IBM SPSS Statistics 22软件(2013)和基于web的工具SNPStats进行统计分析[
20. ].采用Fisher精确检验(SPSS精确检验模块)评估患者组和对照组之间基因型和等位基因频率差异的统计显著性.随访5年内,基因型与帕金森病或痴呆症诊断风险的相关性的统计显著性、优势比和95%置信区间通过年龄和性别作为协变量的logistic回归(SPSS)进行估计.患者组和对照组之间连续变量和分类变量差异的统计显著性采用
t
-检验(年龄变量),以年龄和性别作为协变量的方差分析(连续变量),或Fisher精确检验(分类变量)。使用SNPStats工具中的一个精确测试(1个自由度)来测试Hardy-Weinberg平衡的偏差。的值
P
<
0.05
在单次比较和
P
<
0.006
进行多次比较(
n
=
8
).
3.结果
对184名患者和178名对照组的血液样本进行了分析。患者和对照组的基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡(表)
1 ).比较PD与对照组的基因型频率
BACE1 SNP rs638405与PD显著相关(见表)
1 ).使用logistic回归估计PD相关性风险,校正年龄和性别的协变量,显示“C”等位基因使PD风险增加(优势比[OR]: 2.29;95%置信区间[CI]: 1.24-4.21;
P
=
0.008
;看到补充表
1
可在网上找到补充资料
http://dx.doi.org/10.1155/2015/973298 ).我们没有发现rs514049、rs2305421、rs11601511、rs12149、rs2252576、rs1295652或rs11136000与帕金森病风险或诊断时帕金森严重程度的临床测量相关(表)
1 数据未显示)。
表1
基因型和等位基因频率。
基因
SNP ID
等位基因 m / m
n
PD
n
控制
基因型频率(
n
)
HWE
P
§
病人
控制
χ
2
P
#
m / m
m / m
M / M
m / m
m / m
M / M
ADAM10
rs514049
a / C
183
177
32
99
52
27
93
57
0.70
0.11
rs2305421
g /
184
178
3.
47
134
3.
37
138
0.55
1.00
BACE1
rs638405
g / C
184
178
19
97
68
35
73
70
0.02
0.91
rs11601511
c / G
184
178
4
53
127
5
48
125
0.86
1.00
BACE2
rs12149
c / T
184
178
48
90
46
41
86
51
0.68
0.60
rs2252576
t / C
184
178
15
67
102
15
62
101
0.96
0.17
PSEN2
rs1295652
a / G
184
178
7
60
117
13
58
107
0.34
0.44
俱乐部
rs11136000
t / C
184
177
28
88
68
23
82
72
0.72
1.00
MAF:次要等位基因频率。HWE:哈代-温伯格平衡。
# 双尾
P Fisher精确检验得出的值。
§
对哈代-温伯格分布(SNPStats)的精确检验。
的
BACE1 rs638405主等位基因与晚发型AD (LOAD)风险增加有关,多项研究观察到ApoE-增强了这种作用
ε 4运营商[
7 ,
8 ,
21 ,
22 ].我们测试了rs638405和ApoE-之间可能的联系
ε 发现ApoE-
ε 4没有增加rs638405对PD风险的影响(数据未显示)。
增加A的遗传因素
β 聚合导致AD和变异
BACE1 也与唐氏综合症的痴呆有关[
23 ].因此,我们分析了rs638405与PD患者痴呆风险增加相关的可能性。本研究纳入的184例PD患者中,35例诊断为PD后5年内出现痴呆。使用校正年龄和性别的logistic回归估计PD患者的痴呆风险。我们发现rs638405的“C”等位基因与PD患者的痴呆早期诊断没有显著相关性([OR]: 1.64;95%置信区间:0.43—-6.29;
P
=
0.471
).
4.讨论
本探索性研究表明rs638405, a
BACE1 SNP以前在白种人中与AD相关[
7 ,
8 ,
21 ]和亚洲人口[
22 ,
24 ,
25 ]在挪威ParkWest研究中,也与PD风险增加相关(表1)
1 ).两者之间的联系
BACE1 而PD具有临床意义,因为BACE1在毒性A的生成中起重要作用
β 肽(
26 故选A
β 帕金森病的病理学[
3. ,
4 ],以及最近发现的
β 帕金森病的水平和临床特征[
14 ,
27 - - - - - -
29 ].
CSF一
β 42正在成为PD患者进展为痴呆的独立预测因子,并在该领域获得越来越多的关注(综述见[
30. ])。在本研究中,我们调查了rs638405在区分帕金森病伴痴呆和无痴呆时的有效性,并发现其与痴呆的早期发展没有关联。关于帕金森病对痴呆的遗传易感性的研究还没有定论;然而,一些研究已经在病程较长的患者中发现了与痴呆症相关的snp [
30. ],重新评估
BACE1 晚期帕金森病患者痴呆的单核苷酸多态性。
帕金森病和AD存在于一系列神经退行性疾病。观察到的临床和病理特征的重叠导致了AD和PD可能有一些共同的遗传决定因素的假设。为了研究这一点,一些研究利用GWAS数据检查了AD中散发PD风险等位基因的影响(反之亦然)[
31 ,
32 ],但他们未能确定增加PD和AD风险的基因座。然而,对目标候选SNP的研究发现,这两种疾病和多个基因座都有关联,包括
MAPT [
33 ,
34 ],
PON1 [
35 ,
36 ),而
TREM2 [
37 ,提示PD和AD的病理可能存在一些共同的遗传机制。
rs638405被反复发现与AD风险增加有关[
7 ,
8 ,
21 ,
22 ,
24 ,
25 ]同时,患退行性神经系统疾病的风险增加,散发性克雅氏病[
38 ].鉴于此,我们认为,尽管在本研究中检测到的关联水平可能是由于在多次比较中I型错误的增加
BACE1 rs638405多态性值得在PD中进一步研究,因为它为PD和AD淀粉样蛋白病理中观察到的重叠提供了新的遗传链接,并增加了与该变体相关的神经退行性疾病的数量。由于BACE1 rs638405是一种沉默多态性,其与疾病的关联机制尚不清楚。由于发现基因型和等位基因频率在不同的种族之间存在差异,而且在不同的种群中无论是G等位基因还是GG基因型,这使得情况更加复杂[
7 ,
8 ,
21 ,
24 ,或C等位基因或CC基因型[
22 ,
25 ,
38 会增加患病的风险。一些人推测,这种SNP可能与其他功能变异(s)的连锁不平衡,无论是在
BACE1 基因本身或附近的另一个基因,这还没有被研究过。
在本研究中,我们通过关注可能导致重叠A的候选基因,针对PD和AD之间的遗传重叠进行研究
β 病理本研究的局限性包括决定只检测与APP加工相关的选定基因和SNPs,以及队列规模有限的事实,这意味着可能错过了一些APP加工和PD风险的遗传贡献。
最近在一项研究中采用了类似的方法,该研究对86例PD患者和161例对照组进行了调查,其中一组APP处理基因的遗传变异[
39 ].作者未发现两者之间存在关联
BACE1 与对照组相比,多态性和PD。然而,之前的多重比较校正结果表明,与对照组相比,APP处理基因和PD之间存在关联。此外,作者还表明,在
应用程序 (rs466448)和
APH1B (rs2068143)和CSF A
β PD患者的42个水平[
39 ].综上所述,本研究及本研究结果提示APP加工通路基因变异可能在PD中发挥生物学作用。
5.结论
总之,我们的结果表明
BACE1 rs638405与PD发病风险增加相关,增加了该变体在神经退行性疾病中发挥作用的范围。这些结果,连同最近发表的研究表明A
β 挪威ParkWest两项研究中PD患者的水平都发生了改变[
14 ,
27 ,
28 ]及其他研究[
29 ,提出了一个有趣的研究领域,将常见的遗传危险因素与AD联系起来,并重叠致病机制导致APP加工改变。
利益冲突
作者声明本文的发表不存在利益冲突。
致谢
作者感谢参与本研究的患者和对照组。研究经费来源如下。挪威ParkWest研究由挪威研究委员会(177966)、挪威西部地区卫生局(911218)和挪威帕金森病协会资助。Johannes Lange和Kristin Aaser Lunde得到了挪威西部地区卫生局(911698和911830)的支持。
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Pankratz说道
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布里斯
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夸夸其谈的人
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Soderkvist
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帕金森氏病中对氧磷酶1 (PON1)的保护性多态性
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2012
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贝尼特斯
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TREM2和神经退行性疾病
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Rabano
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Tsuang
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脑脊髓液的
β
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应用程序 帕金森病的加工途径基因
Mov Disord
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