toll样受体(TLRs)在HIV感染的先天免疫应答中发挥重要作用。单核苷酸多态性(SNP)
在印度,艾滋病毒仍然是主要问题之一(世卫组织,艾滋病毒/艾滋病情况说明书,2017年11月)。获得艾滋病毒和疾病进展的易感性差异与遗传背景有关[
到目前为止,没有任何研究报告了
主题招聘期已于4月二〇一四年至2017年三月;153艾滋病毒感染者天真的艺术,年龄18至50岁之间,分别来自连续的国家艾滋病研究所,浦那的户外门诊服用。与此同时,158个个人自由(来自同一个家庭的个人除外)HIV,乙肝和丙肝,以及结核患者年龄匹配的血清阴性的ELISA试验,从属于同一机构门诊招募的。临床数据是通过问卷调查,个人访谈,和的情况下,记录的审查收集。CD4细胞计数的估计通过荧光激活细胞分选(FACS)进行。CD4 +
的单核苷酸多态性(rs179008和rs179009)
用于扩增TLR7多态性的引物已被报道[
年龄变量被表示为
在本研究中,我们招收150艾滋病毒感染者和158个健康对照。平均年龄(
艾滋病毒感染者和健康对照的特征。
| 主题 | 艾滋病毒感染者 | 健康对照组 |
|---|---|---|
| 数 | 150 | 158 |
| 平均年龄(范围) |
|
|
| 性别 | ||
| Females | 76例(50.07%) | 41(25.09%) |
| 男性 | 74例(49.03%) | 117例(74.01%) |
| 喝酒的习惯 | ||
| 用户 | 18 (11.76%) | 23 (14.74%) |
| 弃权 | 90例(58.82%) | 133例(85.25%) |
| 吸烟的习惯 | ||
| 用户 | 22 (14.37%) | 22 (14.10%) |
| 弃权 | 86(56.20%) | 134(85.89%) |
| CD4 +状态 | ||
| 0 - 350 | 68例(44.44%) | NA |
| 351 - 500 | 41 (26.79%) | NA |
| 501 above | 44 (28.75%) | NA |
0 =数据未以问卷形式记录;NA =不适用。
的发生
基因型/等位基因的频率分布和风险估计
| 模型 | 基因型 |
艾滋病毒感染者 |
健康对照组 |
|
或(95%置信区间) |
|
|
|||||
| 共显性的 | AA | 124例(82.7%) | 128例(81.0%) | 1 | 参考 |
| 在 | 21 (14.0%) | 26 (16.5%) | 0.85 | 0.90 (0.45 - -1.81) | |
| TT | 5 (3.3%) | 4 (2.5%) | 0.59 | 1.54 (0.31 - -7.60) | |
| 等位基因 |
|
|
|
|
或(95%置信区间) |
| 一个 | 269例(89.66%) | 282例(89.24%) | 1 | 参考 | |
| T | 31(10.33%) | 34 (10.75%) | 0.96 | 0.96 (0.55 - -1.65) | |
| 占主导地位的 | AA | 124例(82.7%) | 128(81%) | 1 | 参考 |
| AT-TT | 26 (17.3%) | 30 (19%) | 0.94 | 0.98 (0.52 - -1.85) | |
| 隐性 | AA-AT | 145例(96.7%) | 154(97.5%) | 1 | 参考 |
| TT | 5 (3.3%) | 4 (2.5%) | 0.62 | 1.42 (0.34 - -5.92) | |
| 超显性 | AA-TT | 129例(86%) | 132例(83.5%) | 1 | 参考 |
| 在 | 21(14%) | 26 (16.5%) | 0.75 | 0.89 (0.45 - -1.79) | |
|
|
|||||
| 模型 | 基因型 |
艾滋病患者 |
健康对照组 |
|
或(95%置信区间) |
|
|
|||||
| 共显性的 | AA | 110例(73.3%) | 100例(63.3%) | 1 | 参考 |
| AG) | 27(18.0%) | 46 (29.1%) | 0.016 | 0.42 (0.23 - -0.77) | |
| GG | 13 (8.7%) | 12 (7.6%) | 0.86 | 0.97 (0.40 - -2.43) | |
| 等位基因 | 等位基因 |
|
|
|
或(95%置信区间) |
| 一个 | 247例(80.71%) | 246例(77.84%) | 1 | 参考 | |
| G | 53 (17.32%) | 70例(22.15%) | 0.19 | 0.75 (0.50 - -1.14) | |
| 占主导地位的 | AA | 110例(73.3%) | 100例(63.3%) | 1 | 参考 |
| AG-GG | 40(26.7%) | 58 (36.7%) | 0.016 | 0.52 (0.30 - -0.89) | |
| 隐性 | AA-AG | 137例(91.3%) | 146例(92.4%) | 1 | 参考 |
| GG | 13 (8.7%) | 12 (7.6%) | 0.68 | 1.21 (0.48 - -3.07) | |
| 超显性 | AA-GG | 123例(82%) | 112例(70.9%) | 1 | 参考 |
| AG) | 27(18%) | 46 (29.1%) | 0.003 | 0.42 (0.23 - -0.77) | |
N =被试人数;% =基因型/等位基因的频率。以AT的AA, rs179008的TT, AG的AA, rs179009的GG, T的A等位基因和G的A等位基因作为参照组进行统计分析。
的分布
的单倍型的频率分布
| 单倍型 |
艾滋病毒感染者 |
健康对照组 |
|
或(95%置信区间) |
|---|---|---|---|---|
| AA | 75.33% | 72.44% | - - - - - - | 参考 |
| AG) | 14.33% | 16.8% | 0.22 | 0.75(0.48-1.18) |
| 助教 | 7.00% | 5.41% | 0.43 | 1.35 (0.64 - -2.84) |
| TG | 3.33% | 5.35% | 0.32 | 0.66 (0.29 - -1.50) |
患病率
频率分布的
|
|
健康对照组 |
艾滋病早期阶段 | 艾滋病毒疾病中期 | 爱滋病晚期 | |||
|
|
或( |
|
或( |
|
或( |
||
|
|
|||||||
| AA | 128例(81.0%) | 38 (95.0%) | 1(参考) | 33(94.3%) | 1(参考) | 60(93.8%) | 1(参考) |
| 在 | 26 (16.5%) | 2 (5.0%) | 0.26 (0.09) | 2 (5.7%) | 0.30 (0.15) | 2 (3.1%) | 0.16(0.01) |
| TT | 4 (2.5%) | 0 (0.0%) | NS | 0 (0.0%) | NS | 2 (3.1%) | 1.07(0.71) |
|
|
|||||||
|
|
健康对照组 |
艾滋病早期阶段 | 艾滋病毒疾病中期 | 爱滋病晚期 | |||
|
|
或( |
|
或( |
|
或( |
||
|
|
|||||||
| AA | 100例(63.3%) | 38 (95.0%) | 1(参考) | 33(94.3%) | 1(参考) | 60(93.8%) | 1(参考) |
| AG) | 46 (29.1%) | 2 (5.0%) | 0.11 (0.001) | 5 (5.7%) | 0.03 (0.04) | 3 (4.7%) | 0.11 (≤0.001) |
| GG | 12 (7.6%) | 0 (0.0%) | NS | 0 (0.0%) | NS | 1 (1.6%) | 0.14 (0.03) |
对艾滋病毒感染者的烟酒消费进行了分析
频率分布的
|
|
烟草使用者 |
烟草使用者 |
|
或95%CI |
|
|
||||
| CC | 19 (82.6%) | 101例(82.8%) | 1 | 参考 |
| CT | 3 (13.0%) | 17 (13.9%) | 0.81 | 0.94 (0.20 - -3.89) |
| TT | 1 (4.3%) | 4 (3.3%) | 0.70 | 1.33(玉米田限制无效) |
|
|
||||
|
|
烟草使用者 |
烟草使用者 |
|
或95%CI |
|
|
||||
| AA | 15(65.2%) | 90(73.8%) | 1 | 参考 |
| AG) | 6(26.1%) | 21 (17.2%) | 0.47 | 1.71 (0.52 - -5.49) |
| GG | 2 (8.7%) | 11 (9.0%) | 0.75 | 1.09 (0.0 - -6.09) |
|
|
||||
|
|
酒精的用户 |
酒精是否 |
|
或95%CI |
|
|
||||
| AA | 20 (87.0%) | 104例(81.9%) | 1 | 参考 |
| 在 | 3 (13.0%) | 18(14.2%) | 0.91 | 0.87 (0.18 - -3.55) |
| TT | 0 (0.0%) | 5 (3.9%) | - - - - - - | NS |
|
|
||||
|
|
酒精的用户 |
酒精是否 |
|
或(95%置信区间) |
|
|
||||
| AA | 18 (78.3%) | 92(72.4%) | 1 | 参考 |
| AG) | 4 (17.4%) | 23 (18.1%) | 0.92 | 0.89 (0.23 - -3.17) |
| GG | 1 (4.3%) | 12 (9.4%) | 0.68 | 0.43 (0.02 - -3.53) |
年龄、性别、吸烟、酒精、基线CD4计数和
来自印度的这项研究是同类研究中的第一个
在我们的研究中,
我们还分析了单倍型来评估两个snp (rs179008和rs179009)在基因多态性中的协同作用
我们进行了一项病例对照研究,CD4+细胞计数作为HIV-1感染的替代标记。获得艾滋病毒-1的时间尚不清楚;因此,这些影响可能会产生混淆的后果。在这里,我们分析了
大多数疾病是个人遗传背景与个人所接触的环境因素之间多方面相互作用的结果。基因-环境相互作用描述了不同基因型个体的疾病风险[
本研究具有一定的局限性。(1)可以向协会提出。(2)不能建立因果关系。(3)我们没有研究的其他区域多态性的影响
总之,总的来说,
数据可通过电子邮件请求获得。
该研究获得了机构伦理委员会的伦理批准。ICF 1.0版本发布于2011年4月18日。
作者声明他们没有利益冲突。
HariOm Singh对手稿进行了全面监督和写作。达哈梅什·萨马尼进行了实验和数据分析。Ranjana Choudhari对手稿进行了批判性的评论。Sumit Aggarwal对手稿进行了临床输入和评论。
我们感谢主管临床医生Seema Sahay博士安排社区工作人员招募健康对照者。我们也感谢Manisha Ghate博士和R。R Gangakhedkar诊所负责模型群体诊所和Gadikhana诊所招募HIV患者。我要感谢Asha Krishnaraj帮助编辑手稿。这项研究得到了印度医学研究委员会(ICMR)的研究资助。