许多早期的研究涉及异烟肼(INH)治疗的效果完全集中在脂酰(FA)的范畴
全球结核病仍然是严重的疾病和艾滋病患者死亡最常见的原因(
异烟酸酰肼或俗称异烟肼(INH)是最重要的抗结核一线药物之一,阻碍霉菌酸合成杀死积极增长的细胞内和细胞外的结节杆菌(
在这种情况下,这将是巨大的利益和价值的理解耐药性结核分枝杆菌,对异烟肼的基础。考虑到异烟肼的主要目标包括抑制霉菌酸合成(
异烟肼(西格玛奥德里奇),麦德汤7 h9麦德琼脂,OADC和ADC (BD Difco),氯化钾(氯化钾)、二甲亚砜(DMSO)和氯仿(费舍尔科学),甲醇(默克公司)、聚四氟乙烯覆盖玻璃小瓶(Borosil),巴斯德吸管,绘画纸1号滤纸被使用的材料。
MTB(临床应变)被用于这项研究。文化是保持Lowenstein-Jenson (LJ)偏实验应变之前刚有在琼脂板经过21天的全面增长。它再次接种在麦德7 h9汤作为主要为14天(
结核分枝杆菌的细胞治疗(控制)和异烟肼治疗指数期被修改Folch用于完整的细胞脂质提取方法(
分析的样本质(水域,ACQ-TQD # QBP 1152),三重四极杆串联质谱仪在极性切换模式。LC完成C18柱(100毫米x 3毫米,2.6
MTB细胞生长在麦德布鲁克7 h9汤没有(控制)和异烟肼的存在。完整的细胞蛋白提取和蛋白质浓度是由洛瑞方法如前所述
(我)标准基于峰值强度值:在这项研究中,只有那些峰值
(2)质量准则基于值窗口范围用于数据库搜索:分析过程中使用MS-LAMP (Mtb LipidDB集成),当质量窗口搜索范围设置为任何值小于0.5,如0.25中,很少有脂质在输出也获得了“Mtb LipidDB”(见补充材料)。然而,尽管搜索通过使用质量窗口的值范围在MS-LAMP > 0.5,质量错误(
图
对应于观测的分子式的脂质
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317年 | - - - - - - | C18 H36 O4 | - - - - - - |
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331年 | - - - - - - | C19 H38 O4 | - - - - - - |
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409年 | C27 H52 O2 | - - - - - - | - - - - - - |
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485年 | - - - - - - | C30 H60 O4 | C22 H45 O9 P1 |
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497年 | - - - - - - | - - - - - - | C23 H45 O9 P1 |
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513年 | - - - - - - | C31 H60 O5 | C24 H49 O9 P1 |
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539年 | - - - - - - | C33 H62 O5 | - - - - - - |
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611年 | - - - - - - | - - - - - - | C28 H51 O12 P1 |
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626年 | - - - - - - | C39 H76 O5 | - - - - - - |
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650年 | - - - - - - | C41 H76 O5 | - - - - - - |
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694年 | C46 H92 O3 | C44 H84 O5 | - - - - - - |
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706年 | C48 H96 O2 | C45 H84 O5 | - - - - - - |
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872年 | - - - - - - | C56 H102 O6 | - - - - - - |
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1054年 | - - - - - - | C69 H128 O6 | - - - - - - |
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1240年 | C83 H162 O5, C84 H166 O4 | C82 H158 O6 | C65 H123 O19 P1 |
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|---|---|---|---|---|
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343年 | - - - - - - | 甜H38 O4 | - - - - - - |
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369年 | C24 H48 O2 |
- - - - - - | - - - - - - |
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411年 | C27 H54 O2 | - - - - - - | - - - - - - |
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413年 | C26 H52 O3 | 这件H48 O4 | - - - - - - |
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425年 | C28 H56 O2 | - - - - - - | - - - - - - |
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467年 | C31 H62 O2(2号)。 | - - - - - - | - - - - - - |
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483年 | C31 H62 O3 | - - - - - - | C22 H43 O9 P1 |
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496年 | C33 H66 O2(2号)。 | - - - - - - | C24 H50 N1 O7 P1 |
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511年 | - - - - - - | - - - - - - | C24 H47 O9 P1 |
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512年 | C33 H66 O3 | - - - - - - | - - - - - - |
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551年 | - - - - - - | C34 H62 O5 | - - - - - - |
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624年 | - - - - - - | C39 H74 O5 | - - - - - - |
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700年 |
- - - - - - | - - - - - - | - - - - - - |
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734年 | - - - - - - | C47 H88 O5 | C39 H73 O10 P1 |
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738年 |
- - - - - - | C46 H88 O6, C47 H92 O5 | C39 H77 O10 P1 |
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752年 | - - - - - - | C47 H90 O6, C48 H94 O5 | C40 H79 O10 P1 |
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763年 | - - - - - - | - - - - - - | 促H84 N1 O8 P1, C33 H63 O17 P1 |
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780年 |
- - - - - - | C49 H94 O6 C50 H98 O5 | 促H83 O10 P1 |
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794年 | - - - - - - | 网H96 O6, C51 H100 O5 | C43 H85 O10 P1 |
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805年 | - - - - - - | - - - - - - | C45 H90 N1 O8 P1 |
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806年 | - - - - - - |
C51 H96 O6, C52 H100 O5 | C44 H85 O10 P1 |
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850年 | - - - - - - | C54 H104 O6, C55 H108 O5 | C44 H81 O13 P1 |
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852年 | - - - - - - | - - - - - - | C44 H83 O13 P1 |
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854年 | - - - - - - | - - - - - - | C44 H85 O13 P1 |
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873年 |
- - - - - - | - - - - - - | - - - - - - |
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911年 | - - - - - - | - - - - - - | C38 H71 O22 P1 |
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930年 | - - - - - - | C60 H112 O6 | - - - - - - |
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934年 | - - - - - - | C60 H116 O6 | - - - - - - |
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1008年 | - - - - - - | - - - - - - | 网H87 O18 P1 |
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1044年 | - - - - - - | C68 H130 O6 | C52 H99下降O18 P1 |
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1058年 | - - - - - - | C69 H132 O6 | - - - - - - |
网# H82 O1群:1 prenol脂质;
脂类的名称对应于观测到
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317年 | - - - - - - | 毫克 | - - - - - - |
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331年 | - - - - - - | 毫克 | - - - - - - |
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409年 | Mycolipenic酸(C27) | - - - - - - | - - - - - - |
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485年 | - - - - - - | 毫克 | Lyso-GP |
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497年 | - - - - - - | - - - - - - | Lyso-GP |
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513年 | - - - - - - | DG | Lyso-GP |
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539年 | - - - - - - | DG | - - - - - - |
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611年 | - - - - - - | - - - - - - | Lyso-PI |
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626年 | - - - - - - | DG | - - - - - - |
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650年 | - - - - - - | DG | - - - - - - |
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694年 | Hydroxyphthioceranic酸(C46) | DG | - - - - - - |
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706年 | Phthioceranic酸(C48) | DG | - - - - - - |
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872年 | - - - - - - | TG | - - - - - - |
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1054年 | - - - - - - | TG | - - - - - - |
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1240年 | DIM-B, Methoxy-MA | TG | Ac1PIM1 |
MG: monoacylglycerols;DG:甘油二酯;TG:甘油三酯;PG: diacylglycerophosphoglycerols;PI: diacylglycerophosphoinositols;体育:diacylglycerolphosphoethanolamines;PIM:磷脂酰肌醇甘露糖苷;PIM1:磷脂酰肌醇monomannosides;PIM2:磷脂酰肌醇dimannoside;DIM-B: phthiodiolone dimycocerosates; MA: mycolic acids; Lyso-GP: monoacylglycerophosphoglycerols; Lyso-PI: monoacylglycerophosphoinositols; Ac1PIM1: monoacylated diacylglycerophosphoinositol monomannosides.
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|---|---|---|---|---|
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343年 | - - - - - - | 毫克 | - - - - - - |
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369年 | Mycosanoic酸(C24), Mycocerosic酸(C24) | - - - - - - | - - - - - - |
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411年 | Mycocerosic酸(C27) | - - - - - - | - - - - - - |
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413年 | Mycolipanolic酸(C26) | 毫克 | - - - - - - |
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425年 | Mycocerosic酸(C28) | - - - - - - | - - - - - - |
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467年 | Mycocerosic酸(C31), Phthioceranic酸(C31) | - - - - - - | - - - - - - |
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483年 | 羟基phthioceranic酸(C31) | - - - - - - | Lyso-GP |
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496年 | Phthioceranic酸(C33), Mycocerosic酸(C33) |
- - - - - - | Lyso-PE |
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511年 | - - - - - - | - - - - - - | Lyso-GP |
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512年 | 羟基phthioceranic酸(C33) | - - - - - - | - - - - - - |
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551年 | - - - - - - | DG | - - - - - - |
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624年 | - - - - - - | DG | - - - - - - |
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700年 |
- - - - - - | - - - - - - | - - - - - - |
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734年 | - - - - - - | DG | PG |
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738年 |
- - - - - - | DG, TG | PG |
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752年 | - - - - - - | DG, TG | PG |
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763年 | - - - - - - | - - - - - - | PE、Lyso-PIM1 |
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780年 |
- - - - - - | DG, TG | PG |
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794年 | - - - - - - | DG, TG | PG |
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805年 | - - - - - - | - - - - - - | 体育 |
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806年 | - - - - - - | DG, TG | PG |
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850年 | - - - - - - | DG, TG | π |
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852年 | - - - - - - | - - - - - - | π |
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854年 | - - - - - - | - - - - - - | π |
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873年 |
- - - - - - | - - - - - - | - - - - - - |
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911年 | - - - - - - | - - - - - - | Lyso-PIM2 |
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930年 | - - - - - - | TG | - - - - - - |
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934年 | - - - - - - | TG | - - - - - - |
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1008年 | - - - - - - | - - - - - - | PIM1 |
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1044年 | - - - - - - | TG | PIM1 |
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1058年 | - - - - - - | TG | - - - - - - |
MG: monoacylglycerols;DG:甘油二酯;TG:甘油三酯;PG: diacylglycerophosphoglycerols;PI: diacylglycerophosphoinositols;体育:diacylglycerolphosphoethanolamines;PIM:磷脂酰肌醇甘露糖苷;PIM1:磷脂酰肌醇monomannosides;PIM2:磷脂酰肌醇dimannoside;DIM-B: phthiodiolone dimycocerosates; MA: mycolic acids; Lyso-GP: monoacylglycerophosphoglycerols; Lyso-PI: monoacylglycerophosphoinositols; Lyso-PIM1: monoacylglycerophosphoinositol monomannosides; Lyso-PIM2: monoacylglycerophosphoinositol dimannosides.
分子式及其各自的脂质5观察对应的名称
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|---|---|---|---|---|
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415年 | 这件H50 O4 | 毫克(RCO2H = 22:0) | Glycerolipids (GL) |
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439年 | C29 H58 O2 | Mycocerosic酸(C29) | 脂肪酰基(FA) |
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441年 | C28 H56 O3 | Mycolipanolic酸(C28) | 脂肪酰基(FA) |
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598年 | C37 H72 O5 | DG (R1CO2H + R2CO2H = 34:0) | Glycerolipids (GL) |
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654年 | C41 H80 O5 | DG (R1CO2H + R2CO2H = 38:0) | Glycerolipids (GL) |
从控制和INH-treated样本代表性的质谱(见补充数据
我们也分析了LC-ESI-MS数据与另一个数据库中,MycoMass,报道Layre et al . 2011
结核分枝杆菌的每个类别的脂质LipidDB和MycoMass数据库。
| 脂质类 |
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|---|---|---|
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| 其他人 | 0 |
7 |
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| 总 |
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结核分枝杆菌的脂质稳态有重要作用致病性和近60%的细胞干重是由于脂质(
在八脂质类定义为脂质地图(
22的潜在脂质解释“控制”样本,5属于FAs类别,12 gl, 5是gpl(表
比较变化在每一个脂质类别之间的“控制”和“INH-treated MTB细胞:结核分枝杆菌的脂质在解释每个类别LipidDB [
霉菌酸(MA)和phthiocerol dimycocerosates(暗)属于致病性FA类和观察,没有发现异烟肼(表的存在
gl类别包含三种不同的子类的数量取决于脂肪酸甘油骨架,即monoacylglycerol(毫克),甘油二酯(DG)和三酰甘油(TG)。gl可以与马(
gpl形成脂类的另一个重要类别,这似乎是在异烟肼的反应更迅速。此外,它已经知道,结核分枝杆菌的毒性菌株具有更高的gpl(内容
进一步,我们进行比较分析脂质类别的识别从数据库MycoMass MS-LAMP的输出。MycoMass数据库中搜索也以同样的方式进行搜索是用Mtb LipidDB使用MS-LAMP,即窗口范围设置为0.5(见部分
表显示的列表
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|---|---|---|
| 321年 | 309年 | 300年 |
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| 333年 | 318年 | 310年 |
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| 335年 | 362年 | 325年 |
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| 338年 | 431年 | 339年 |
|
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| 349年 | 459年 |
342年 |
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| 364年 | 520年 | 351年 |
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| 432年 | 536年 |
355年 |
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| 449年 | 547年 |
367年 |
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| 457年 |
628年 | 371年 |
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| 470年 | 637年 |
386年 |
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| 529年 |
1022年 | 391年 |
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| 531年 |
393年 | |
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| 590年 |
398年 |
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| 620年 |
435年 |
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| 673年 |
445年 |
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| 828年 |
503年 | |
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| 912年 |
515年 |
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| 957年 |
519年 |
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| 1001年 |
522年 |
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| 1077年 | 523年 |
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| 528年 | ||
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| 533年 |
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| 537年 |
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| 540年 | ||
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| 549年 |
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| 564年 |
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| 569年 |
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| 575年 |
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| 577年 |
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| 589年 |
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| 591年 |
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| 593年 |
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| 617年 |
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| 621年 |
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| 634年 |
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| 639年 |
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| 644年 | ||
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| 686年 | ||
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| 701年 |
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| 712年 | ||
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| 726年 | ||
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| 768年 | ||
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| 769年 |
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| 770年 | ||
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| 782年 | ||
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| 795年 | ||
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| 797年 | ||
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| 803年 |
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| 823年 | ||
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| 842年 | ||
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| 849年 | ||
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| 855年 | ||
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| 887年 |
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| 893年 | ||
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| 899年 |
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| 901年 |
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| 1036年 |
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表
| 示例: |
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|---|---|---|---|---|---|---|
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| 不。观察到的 |
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| 数据库 |
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| 脂质类 | ||||||
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5 | 6 | 2 | 3 | 11 | 16 |
|
|
||||||
|
|
12 | 19 | 3 | 5 | 21 | 33 |
|
|
||||||
|
|
5 | 21 | 0 | 7 | 18 | 68年 |
|
|
||||||
|
|
0 | 16 | 0 | 1 | 2 | 30. |
|
|
||||||
|
|
0 | 2 | 0 | 0 | 2 | 5 |
|
|
||||||
|
|
0 | 5 | 0 | 0 | 0 | 6 |
|
|
||||||
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||||
| 不。的 |
|
|
|
|||
|
|
||||||
| 不。的 |
|
|
|
|||
|
|
||||||
| 不。的 |
|
|
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|||
|
|
||||||
| 不。的 |
|
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仔细评估和比较分析两个数据库的输出显示,10岁和24岁
输出的比较从MycoMass获得结核分枝杆菌与LipidDB (MS-LAMP)“控制”和“INH-treated Mtb样本(见部分
完全的观察研究加强我们的假设,结核分枝杆菌异烟肼治疗改变的脂质组成,这种变化不仅限于FAs孤单。变化与gl指出,,gpl和PKs结核分枝杆菌的异烟肼治疗确实可以打开新的视角进行进一步的调查,从而帮助解剖耐药性的进化机制并探索新的药物靶点(图
模型描述,结核分枝杆菌异烟肼治疗改变的脂质组成不限于FAs。变化与gl指出,gpl, PKs结核分枝杆菌的异烟肼治疗可能会打开新的视角去探索新的药物靶点(✓表示已知的脂类(FA) ?表示可能的额外的脂类(gl, gpl和PKs)受到异烟肼作为从本研究提出)。
使用的数据来支持本研究的发现可以从相应的作者。
作者宣称没有利益冲突。
拉胡尔Pal,赛义夫Hameed Varatharajan Sabareesh贡献同样这项工作。
Zeeshan法蒂玛由于科学与工程研究委员会(塞尔维亚),新德里(SR /英尺/ LS-173/2010)的财政援助形式的青年科学家奖。作者感谢博士(Sanjeev Kanojiya,科学与工业研究理事会(CSIR),中央药物研究所(CDRI),勒克瑙,印度,协助他们在质谱实验。Varatharajan Sabareesh希望Sheetal Gandotra博士承认,科学家,CSIR-Institute基因组学和综合生物学(IGIB),新德里,印度为通知关于MycoMass数据库。
数字S1-S6:质谱通过UPLC-MS(见实验/材料和方法)的提取从“结核分枝杆菌治疗细胞”。那些