JPATHgydF4y2B一个 杂志的病原体gydF4y2B一个 2090 - 3065gydF4y2B一个 2090 - 3057gydF4y2B一个 HindawigydF4y2B一个 10.1155 / 2018/1018694gydF4y2B一个 1018694gydF4y2B一个 研究文章gydF4y2B一个 构象建模和分子对接一些活性化合物的分析gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个受体(Mtb CYP121)gydF4y2B一个 http://orcid.org/0000 - 0002 - 7750 - 8174gydF4y2B一个 阿德尼吉gydF4y2B一个 绍拉以利亚gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 非洲联合银行gydF4y2B一个 萨尼gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 UzairugydF4y2B一个 达姆gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 VanittanakomgydF4y2B一个 NongnuchgydF4y2B一个 化学系gydF4y2B一个 Ahmadu贝罗大学gydF4y2B一个 ZariagydF4y2B一个 尼日利亚gydF4y2B一个 abu.edu.nggydF4y2B一个 2018年gydF4y2B一个 10gydF4y2B一个 5gydF4y2B一个 2018年gydF4y2B一个 2018年gydF4y2B一个 28gydF4y2B一个 01gydF4y2B一个 2018年gydF4y2B一个 26gydF4y2B一个 02gydF4y2B一个 2018年gydF4y2B一个 13gydF4y2B一个 03gydF4y2B一个 2018年gydF4y2B一个 10gydF4y2B一个 5gydF4y2B一个 2018年gydF4y2B一个 2018年gydF4y2B一个 版权©2018绍拉以利亚阿德尼吉等。gydF4y2B一个 这是一个开放的文章在知识共享归属许可下发布的,它允许无限制的使用,分布和繁殖在任何媒介,提供最初的工作是正确的引用。gydF4y2B一个

定量结构活性关系(构象)研究了开发一个模型,与50个化合物的结构对他们的活动gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个。化合物优化采用密度泛函理论(DFT) B3LYP / 6 -gydF4y2B一个 31日gydF4y2B一个 GgydF4y2B一个 ⁎gydF4y2B一个 。遗传算法函数(GFA)被用来选择相关的描述符和生成相关模型结构特点的生物活性化合物。最优模型相关系数平方(gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 0.9202),调整方相关系数(gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 0.91012),分析(厕所)交叉验证系数(gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 )值为0.8954。外部验证测试用于确定建立模型的预测能力gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 pred值为0.8842。这些参数确认模型的稳定性和鲁棒性。对接对接亲和力高的分析显示最好的复合−14.6千卡/摩尔形成氨基酸残基的疏水作用和氢键gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个细胞色素(Mtb CYP121)。构象和分子对接研究为制药和药物化学家提供有价值的方法来设计和合成新的反gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个化合物。gydF4y2B一个

 1。介绍gydF4y2B一个

结核分枝杆菌gydF4y2B一个是一种细菌物种负责导致肺结核(TB)。它主要影响肺和身体的其他部位,如脊椎,肾脏和大脑,除非紧急治疗。结核病仍然是最流行的传染性细菌疾病,导致全球140万人的死亡gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个]。有药物异烟肼、利福平、环丙沙星、乙胺丁醇可作为治疗肺结核。gydF4y2B一个

然而,由于耐多药(MDR)的出现和广泛耐药结核病(XDR),这带来了一个巨大的挑战的成功治疗肺结核(gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个]。这导致对不同菌株的新疗法的发展gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个(gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个]。新合成的1、2、4-Triazole衍生化合物展示肺结核抑制活动(gydF4y2B一个 4gydF4y2B一个]。合成的新型分子通常是使用试错的方法,开发耗时和昂贵的。gydF4y2B一个

定量结构活性关系(构象)在小说中扮演着一个重要的角色。通过ligand-based药物设计方法(gydF4y2B一个 5gydF4y2B一个]。定量构效关系方法的关键的成功的可能性预测新化合物的性质,而不需要合成和测试它们。这种技术被广泛用于预测化学、物理化学性质的工业,制药、生物和环境领域gydF4y2B一个 6gydF4y2B一个]。定量构效关系策略,此外,节省资源,加快开发新的分子用作药物的过程,材料,添加剂或为任何目的gydF4y2B一个 7gydF4y2B一个]。同时分子对接是一个计算方法用于确定活性位点残基之间的结合强度和特定分子(s) (gydF4y2B一个 8gydF4y2B一个]。分子对接是有利的工具用于药物发现领域探讨绑定目标兼容性(配体)的分子(受体)gydF4y2B一个 9gydF4y2B一个]。gydF4y2B一个

本研究的目的是定量构效关系模型来预测开发的活动1,2,4-Triazole衍生品作为强有力的反gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个化合物和阐明抑制剂分子之间的相互作用gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个目标站点。gydF4y2B一个

 2。材料和方法gydF4y2B一个 2.1。数据收集gydF4y2B一个

五十分子1 2 4-Triazole衍生品作为有效的抗结核的药物被用于这项研究从文献[获得gydF4y2B一个 4gydF4y2B一个]。gydF4y2B一个

 2.2。生物活性(BA)gydF4y2B一个

生物活性的1、2、4-Triazole衍生品gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个在有氧活动阶段最初用百分比表示(%),然后转换为对数使用单位(gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个)为了增加活动的线性和方法正态分布值。观察到的结构和这些化合物的生物活性在桌子上gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个。gydF4y2B一个 (1)gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 BgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 日志gydF4y2B一个 ⁡gydF4y2B一个 分子量gydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 ogydF4y2B一个 lgydF4y2B一个 DgydF4y2B一个 ogydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 egydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 ogydF4y2B一个 lgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 egydF4y2B一个 %gydF4y2B一个 One hundred.gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 egydF4y2B一个 %gydF4y2B一个 。gydF4y2B一个

分子结构的1、2、4-Triazole衍生品和他们的活动。gydF4y2B一个

S / NgydF4y2B一个 分子gydF4y2B一个 实验gydF4y2B一个活动gydF4y2B一个(pBA)gydF4y2B一个
1gydF4y2B一个 4.925gydF4y2B一个
2gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 5.0345gydF4y2B一个
3gydF4y2B一个 5.0064gydF4y2B一个
4gydF4y2B一个 5.7386gydF4y2B一个
5gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 5.5994gydF4y2B一个
6gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 5.4543gydF4y2B一个
7gydF4y2B一个 4.7441gydF4y2B一个
8gydF4y2B一个 6.1674gydF4y2B一个
9gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 6.3456gydF4y2B一个
10gydF4y2B一个 7.4134gydF4y2B一个
11gydF4y2B一个 5.7441gydF4y2B一个
12gydF4y2B一个 5.9258gydF4y2B一个
1gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 5.6754gydF4y2B一个
14gydF4y2B一个 6.3793gydF4y2B一个
15gydF4y2B一个 6.1667gydF4y2B一个
1gydF4y2B一个 6gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 5.8765gydF4y2B一个
17gydF4y2B一个 6.4171gydF4y2B一个
18gydF4y2B一个 5.9413gydF4y2B一个
19gydF4y2B一个 7.6397gydF4y2B一个
20.gydF4y2B一个 8.0899gydF4y2B一个
21gydF4y2B一个 6.3981gydF4y2B一个
22gydF4y2B一个 5.8131gydF4y2B一个
23gydF4y2B一个 6.2878gydF4y2B一个
24gydF4y2B一个 5.7268gydF4y2B一个
25gydF4y2B一个 7.366gydF4y2B一个
2gydF4y2B一个 6gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 7.0123gydF4y2B一个
27gydF4y2B一个 6.5267gydF4y2B一个
28gydF4y2B一个 5.7405gydF4y2B一个
2gydF4y2B一个 9gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 5.6533gydF4y2B一个
3gydF4y2B一个 0gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 6.1923gydF4y2B一个
31日gydF4y2B一个 7.3233gydF4y2B一个
32gydF4y2B一个 6.0097gydF4y2B一个
33gydF4y2B一个 6.0928gydF4y2B一个
34gydF4y2B一个 7.3279gydF4y2B一个
35gydF4y2B一个 6.8568gydF4y2B一个
3gydF4y2B一个 6gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 6.2234gydF4y2B一个
37gydF4y2B一个 7.3079gydF4y2B一个
38gydF4y2B一个 7.314gydF4y2B一个
3gydF4y2B一个 9gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 8.5854gydF4y2B一个
40gydF4y2B一个 8.0615gydF4y2B一个
41gydF4y2B一个 8.0615gydF4y2B一个
4gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 6.8494gydF4y2B一个
43gydF4y2B一个 7.9432gydF4y2B一个
4gydF4y2B一个 4gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 7.4535gydF4y2B一个
45gydF4y2B一个 7.9759gydF4y2B一个
46gydF4y2B一个 7.9759gydF4y2B一个
47gydF4y2B一个 7.9294gydF4y2B一个
4gydF4y2B一个 8gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 6.1213gydF4y2B一个
49gydF4y2B一个 5.4406gydF4y2B一个
5gydF4y2B一个 0gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 4.9074gydF4y2B一个

上标gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 代表了测试集。gydF4y2B一个

 2.3。几何优化gydF4y2B一个

分子的化学结构是用ChemDraw超12.0版。每个分子首次preoptimized分子力学(MMFF)和进一步再优化利用B3LYP密度泛函理论(DFT)和6 -gydF4y2B一个 31日gydF4y2B一个 GgydF4y2B一个 ∗gydF4y2B一个 基础设置(gydF4y2B一个 10gydF4y2B一个,gydF4y2B一个 11gydF4y2B一个)借助斯巴达14版本1.1.0软件。gydF4y2B一个

 2.4。分子描述符计算gydF4y2B一个

分子描述符是一个分子的数学描述属性值。所有50个分子描述符计算1,2,4-Triazole衍生品是使用PaDEL-Descriptor 2.20版本软件完成的。共有1876个分子描述符计算。gydF4y2B一个

 2.5。规范化和数据预处理gydF4y2B一个

描述符的值规范化使用(gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个)为了给每个变量同样的机会的影响模式gydF4y2B一个 12gydF4y2B一个]。gydF4y2B一个 (2)gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 是每个描述符的值对于一个给定的分子gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 和gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 每一列的最大和最小值的描述符gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 。规范化数据受到预处理使用数据预处理软件为了消除噪音和冗余数据。gydF4y2B一个

 2.6。训练集和测试集gydF4y2B一个

数据集分为训练集和测试集采用Kennard和石头的算法。训练集由70%的数据集是用于构建模型,而剩下的30%的数据集(测试集)是用于验证构建模型。gydF4y2B一个

 2.7。每个描述符在模型的相对重要性gydF4y2B一个

的绝对值均值的影响每个描述符是用来评估的相对重要性和贡献对模型描述符。被定义为平均效应gydF4y2B一个 (3)gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 βgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 DgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 βgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 DgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 我的平均效应是一个描述符在哪里gydF4y2B一个 jgydF4y2B一个在一个模型中,gydF4y2B一个 βgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 系数是描述符吗gydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 在这个模型中,gydF4y2B一个 DgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 每个描述符的数据的值是矩阵中的每一个分子训练集,gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 描述符的数量出现在模型中,然后呢gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 在训练集分子的数目(gydF4y2B一个 13gydF4y2B一个]。gydF4y2B一个

 2.8。的贡献程度选择描述符gydF4y2B一个

模型中的每个描述符的贡献来衡量计算标准化回归系数(gydF4y2B一个 bgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 )使用(gydF4y2B一个 6gydF4y2B一个)。gydF4y2B一个 (4)gydF4y2B一个 bgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 bgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 ygydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 bgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 的回归系数是描述符gydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 。gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 和gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 ygydF4y2B一个 每个描述符的标准差和活动,分别。统计特性gydF4y2B一个 bgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 允许一个人分配一个更大的重要性,那些表现出更大的绝对的标准化系数的分子描述符gydF4y2B一个

 2.9。内部的验证模型gydF4y2B一个

内部模型的验证进行了使用材料工作室Version 8软件采用遗传函数近似(GFA)方法。使用LOF模型估计。LOF测量使用原始弗里德曼的微小的变化公式,所以,最好的健身分数可以收到。LOF表示如下(gydF4y2B一个 14gydF4y2B一个]:gydF4y2B一个 (5)gydF4y2B一个 lgydF4y2B一个 OgydF4y2B一个 FgydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 CgydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 ×gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在上交所的平方和错误,gydF4y2B一个 CgydF4y2B一个 是在模型中,的数量gydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 是一个用户定义的平滑参数,gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 的总数是描述符包含在模型中,然后呢gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 在训练集的数据量。看到被定义为(gydF4y2B一个 15gydF4y2B一个]gydF4y2B一个 (6)gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 NgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 PgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 。gydF4y2B一个 相关系数的平方(gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 )定义了总数的比例变化归因于模型。的值越接近gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 至1.0,模型生成的就越好。gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 表示为gydF4y2B一个 (7)gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 ¯gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 ¯gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 实验活动,预测活动,平均训练集样本的实验活动,分别。gydF4y2B一个

的价值gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 直接与不同数量的增加描述符。因此,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 不可靠的测量模型的拟合优度。因此,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 调整的数量模型中解释变量。的调整gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 被定义为gydF4y2B一个 (8)gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 kgydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 kgydF4y2B一个 是独立变量的模型和数量吗gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 描述符的数量。gydF4y2B一个

定量构效关系方程的强度预测化合物的生物活性测定使用分析交叉验证方法。交叉验证回归系数修正公式(gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 )是gydF4y2B一个 (9)gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 ¯gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 ¯gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 预测,实验和实验活动训练集的平均值。gydF4y2B一个

 2.10。外部验证的模型gydF4y2B一个

外部评估验证模型gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 价值。的值越接近gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 至1.0,模型生成的就越好。gydF4y2B一个 (10)gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ∑gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 ¯gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 和gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 测试集预测和实验活动,而gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 ¯gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 ggydF4y2B一个 代表的意思是训练集的值的实验活动。gydF4y2B一个

 2.11。< inline-formula > < mml:数学xmlns: mml = " http://www.w3.org/1998/Math/MathML " id = " M73 " > < mml: mrow > < mml: mi > Y < / mml: mi > < / mml: mrow > < / mml:数学> < / inline-formula >随机测试gydF4y2B一个

YgydF4y2B一个 随机测试是另一个有用的外部验证参数确认定量构效关系模型建立强大而不是偶然的。的gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 随机测试是在训练集上执行数据gydF4y2B一个 16gydF4y2B一个]。通过建立模型gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 随机测试,gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 应该超过0.5。gydF4y2B一个 (11)gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 ×gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 是确定系数gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 随机化,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 是相关系数gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 随机化,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 是平均”gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 “随机模型。gydF4y2B一个

 2.12。评价模型的应用领域gydF4y2B一个

定量构效关系模型的适用性评估领域的一个重要方法,证实该模型建立中能够很好地预测化学空间的开发(gydF4y2B一个 16gydF4y2B一个]。杠杆的方式来描述定量构效关系模型的适用性域(gydF4y2B一个 17gydF4y2B一个]。利用给定的化合物被定义如下:gydF4y2B一个 (12)gydF4y2B一个 hgydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 TgydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 TgydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 hgydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 每个化合物的利用,gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 描述符查询的行向量复合吗gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 是gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 ×gydF4y2B一个 kgydF4y2B一个 描述符阵的训练集化合物用于构建模型。作为预测工具,警告杠杆(gydF4y2B一个 hgydF4y2B一个 ∗gydF4y2B一个 )是限制正常的值gydF4y2B一个 XgydF4y2B一个 离群值,定义为gydF4y2B一个 (13)gydF4y2B一个 hgydF4y2B一个 ∗gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 在哪里gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 是数量的化合物和培训gydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 在模型中是描述符的数目。威廉姆斯的阴谋,阴谋标准化剩余和利用价值,来说明模型的相关区域的化学空间。数据被认为是一个异类,如果标准旨在剩余大于产生的模型gydF4y2B一个 ±gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 。gydF4y2B一个

 2.13。模型的质量保证gydF4y2B一个

拟合能力、稳定性、健壮性、可靠性和开发模型的预测能力进行了评估,内部和外部验证参数。验证参数与最小推荐值的定量构效关系模型(通常可接受的gydF4y2B一个 17gydF4y2B一个表所示)gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个。gydF4y2B一个

验证参数的最小推荐值定量构效关系模型一般可以接受的。gydF4y2B一个

验证参数gydF4y2B一个 的名字gydF4y2B一个 价值gydF4y2B一个
RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 确定系数gydF4y2B一个 ≥0.6gydF4y2B一个
PgydF4y2B一个 (gydF4y2B一个 95年gydF4y2B一个 %gydF4y2B一个 )gydF4y2B一个 置信区间在95%置信水平gydF4y2B一个 < 0.05gydF4y2B一个
问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 交叉验证系数gydF4y2B一个 > 0.5gydF4y2B一个
RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 −gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 之间的区别gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 和gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 ≤0.3gydF4y2B一个
NgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 。gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 egydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 egydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 外部测试集的最小数量gydF4y2B一个 ≥5gydF4y2B一个
RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 测试gydF4y2B一个 确定系数为外部测试集gydF4y2B一个 ≥0.6gydF4y2B一个
cgydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 确定系数为gydF4y2B一个 YgydF4y2B一个 随机化gydF4y2B一个 > 0.5gydF4y2B一个
2.14。对接研究gydF4y2B一个

分子对接研究是为了说明1、2,4-Triazole衍生品对Mtb CYP121最好的亲和力。CYP121用于研究结核分枝杆菌的结构从蛋白质数据银行PDB代码获得51 bg。准备配体和受体被显示在图gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个。优化结构的1、2、4-Triazole衍生品最初保存为自卫队文件转换为使用斯巴达14 V 1.1.4 PDB文件。准备的配体与准备停靠Mtb CYP121结构使用AutoDock七弦琴纳入PyRx软件。对接结果编译、可视化和分析使用可视化工具发现工作室。gydF4y2B一个

(一)准备Mtb CYP121结构。(b)的3 d结构的配体。gydF4y2B一个

 3所示。结果与讨论gydF4y2B一个

构象进行了探讨构效关系的50个化合物作为有效的抗结核的药物。定量构效关系研究模型的本质是其表达的拟合能力,稳定、健壮性、可靠性、和预测能力。gydF4y2B一个

实验和预测活动1 2 4-Triazole衍生品被展示在表gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个。实验和预测之间的低剩余价值活动表明,高可预见性的模型。gydF4y2B一个

实验,预测和剩余价值为1,2,4-Triazole衍生品。gydF4y2B一个

S /数量gydF4y2B一个(分子)gydF4y2B一个 实验gydF4y2B一个活动gydF4y2B一个(pBA)gydF4y2B一个 预测gydF4y2B一个活动gydF4y2B一个(pBA)gydF4y2B一个 剩余gydF4y2B一个
1gydF4y2B一个 4.925gydF4y2B一个 4.8922gydF4y2B一个 0.0328gydF4y2B一个
2gydF4y2B一个 5.0345gydF4y2B一个 4.8716gydF4y2B一个 0.1629gydF4y2B一个
3gydF4y2B一个 5.0064gydF4y2B一个 5.0941gydF4y2B一个 −0.0877gydF4y2B一个
4gydF4y2B一个 5.7386gydF4y2B一个 5.8308gydF4y2B一个 −0.0922gydF4y2B一个
5gydF4y2B一个 5.5994gydF4y2B一个 5.5803gydF4y2B一个 0.0191gydF4y2B一个
6gydF4y2B一个 5.4543gydF4y2B一个 5.6969gydF4y2B一个 −0.2426gydF4y2B一个
7gydF4y2B一个 4.7441gydF4y2B一个 4.8047gydF4y2B一个 −0.0606gydF4y2B一个
8gydF4y2B一个 6.1674gydF4y2B一个 6.2999gydF4y2B一个 −0.1325gydF4y2B一个
9gydF4y2B一个 6.3456gydF4y2B一个 6.5053gydF4y2B一个 −0.1597gydF4y2B一个
10gydF4y2B一个 7.4134gydF4y2B一个 7.1548gydF4y2B一个 0.2586gydF4y2B一个
11gydF4y2B一个 5.7441gydF4y2B一个 6.0862gydF4y2B一个 −0.3421gydF4y2B一个
12gydF4y2B一个 5.9258gydF4y2B一个 5.6383gydF4y2B一个 0.2875gydF4y2B一个
13gydF4y2B一个 5.6754gydF4y2B一个 5.4834gydF4y2B一个 0.192gydF4y2B一个
14gydF4y2B一个 6.3793gydF4y2B一个 6.3443gydF4y2B一个 0.035gydF4y2B一个
15gydF4y2B一个 6.1667gydF4y2B一个 6.5432gydF4y2B一个 −0.3765gydF4y2B一个
16gydF4y2B一个 5.8765gydF4y2B一个 6.8765gydF4y2B一个 −1.000gydF4y2B一个
17gydF4y2B一个 6.4171gydF4y2B一个 6.1354gydF4y2B一个 0.2817gydF4y2B一个
18gydF4y2B一个 5.9413gydF4y2B一个 6.02517gydF4y2B一个 −0.08387gydF4y2B一个
19gydF4y2B一个 7.6397gydF4y2B一个 7.6055gydF4y2B一个 0.0342gydF4y2B一个
20.gydF4y2B一个 8.0899gydF4y2B一个 7.8436gydF4y2B一个 0.2463gydF4y2B一个
21gydF4y2B一个 6.3981gydF4y2B一个 6.2094gydF4y2B一个 0.1887gydF4y2B一个
22gydF4y2B一个 5.8131gydF4y2B一个 6.4308gydF4y2B一个 −0.6177gydF4y2B一个
23gydF4y2B一个 6.2878gydF4y2B一个 6.30457gydF4y2B一个 −0.01677gydF4y2B一个
24gydF4y2B一个 5.7268gydF4y2B一个 5.9933gydF4y2B一个 −0.2665gydF4y2B一个
25gydF4y2B一个 7.366gydF4y2B一个 7.5444gydF4y2B一个 −0.1784gydF4y2B一个
26gydF4y2B一个 7.0123gydF4y2B一个 6.8471gydF4y2B一个 0.1652gydF4y2B一个
27gydF4y2B一个 6.5267gydF4y2B一个 5.9850gydF4y2B一个 0.5417gydF4y2B一个
28gydF4y2B一个 5.7405gydF4y2B一个 6.0962gydF4y2B一个 −0.3557gydF4y2B一个
29日gydF4y2B一个 5.6533gydF4y2B一个 6.4796gydF4y2B一个 −0.8263gydF4y2B一个
30.gydF4y2B一个 6.1923gydF4y2B一个 6.0426gydF4y2B一个 0.1497gydF4y2B一个
31日gydF4y2B一个 7.3233gydF4y2B一个 6.5095gydF4y2B一个 0.8138gydF4y2B一个
32gydF4y2B一个 6.0097gydF4y2B一个 6.3151gydF4y2B一个 −0.3054gydF4y2B一个
33gydF4y2B一个 6.0928gydF4y2B一个 5.9501gydF4y2B一个 0.1427gydF4y2B一个
34gydF4y2B一个 7.3279gydF4y2B一个 7.3990gydF4y2B一个 −0.0711gydF4y2B一个
35gydF4y2B一个 6.8568gydF4y2B一个 6.8761gydF4y2B一个 −0.0193gydF4y2B一个
36gydF4y2B一个 6.2234gydF4y2B一个 8.6487gydF4y2B一个 −2.4253gydF4y2B一个
37gydF4y2B一个 7.3079gydF4y2B一个 7.2405gydF4y2B一个 0.0674gydF4y2B一个
38gydF4y2B一个 7.314gydF4y2B一个 7.5050gydF4y2B一个 −0.191gydF4y2B一个
39gydF4y2B一个 8.5854gydF4y2B一个 5.6969gydF4y2B一个 2.8885gydF4y2B一个
40gydF4y2B一个 8.0615gydF4y2B一个 8.1009gydF4y2B一个 −0.0394gydF4y2B一个
41gydF4y2B一个 8.0615gydF4y2B一个 7.8073gydF4y2B一个 0.2542gydF4y2B一个
42gydF4y2B一个 6.8494gydF4y2B一个 7.6746gydF4y2B一个 −0.8252gydF4y2B一个
43gydF4y2B一个 7.9432gydF4y2B一个 7.9352gydF4y2B一个 0.008gydF4y2B一个
44gydF4y2B一个 7.4535gydF4y2B一个 7.6946gydF4y2B一个 −0.2411gydF4y2B一个
45gydF4y2B一个 7.9759gydF4y2B一个 7.8569gydF4y2B一个 0.119gydF4y2B一个
46gydF4y2B一个 7.9759gydF4y2B一个 8.2103gydF4y2B一个 −0.2344gydF4y2B一个
47gydF4y2B一个 7.9294gydF4y2B一个 7.9408gydF4y2B一个 −0.0114gydF4y2B一个
48gydF4y2B一个 6.1213gydF4y2B一个 5.9165gydF4y2B一个 0.2048gydF4y2B一个
49gydF4y2B一个 5.4406gydF4y2B一个 5.2695gydF4y2B一个 0.1711gydF4y2B一个
50gydF4y2B一个 4.9074gydF4y2B一个 4.8495gydF4y2B一个 0.0579gydF4y2B一个

遗传algorithm-multiple线性回归(GA-MLR)调查选择了六个描述符是用来组装线性模型计算预测活动gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个。定量构效关系模型五个使用遗传算法(GFA)函数,但由于统计学意义,模型1被选中并报告如下考虑:gydF4y2B一个 (14)gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 BgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.307001458gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 TgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 7gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 1.528715398gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 HgydF4y2B一个 BgydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 3.976720227gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 HgydF4y2B一个 CgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 ugydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 0.016199645gydF4y2B一个 TgydF4y2B一个 DgydF4y2B一个 BgydF4y2B一个 9gydF4y2B一个 egydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 0.089381479gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 DgydF4y2B一个 FgydF4y2B一个 90年gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.107407822gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 DgydF4y2B一个 FgydF4y2B一个 110年gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 4.057082751gydF4y2B一个 。gydF4y2B一个

NgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 35gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 0.92023900,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 0.91017400gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 = 0.89538600,和外部验证测试集被发现gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 pred = 0.8842。gydF4y2B一个

这种模式被报道在所有验证参数表gydF4y2B一个 4gydF4y2B一个和都在协议参数表gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个实际上,这证实了模型的鲁棒性。gydF4y2B一个

验证基因功能近似的材料工作室。gydF4y2B一个

S /数量gydF4y2B一个 方程gydF4y2B一个
1gydF4y2B一个 弗里德曼LOFgydF4y2B一个 0.40847300gydF4y2B一个
2gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 平方gydF4y2B一个 0.92023900gydF4y2B一个
3gydF4y2B一个 调整gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 平方gydF4y2B一个 0.91017400gydF4y2B一个
4gydF4y2B一个 旨在gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 平方(gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 )gydF4y2B一个 0.89538600gydF4y2B一个
5gydF4y2B一个 显著的回归gydF4y2B一个 是的gydF4y2B一个
6gydF4y2B一个 Significance-of-regressiongydF4y2B一个 FgydF4y2B一个 价值gydF4y2B一个 58.41835200gydF4y2B一个
7gydF4y2B一个 临界转速gydF4y2B一个 FgydF4y2B一个 价值(95%)gydF4y2B一个 2.45854700gydF4y2B一个
8gydF4y2B一个 复制点gydF4y2B一个 0gydF4y2B一个
9gydF4y2B一个 计算实验误差gydF4y2B一个 0.00000000gydF4y2B一个
10gydF4y2B一个 Lack-of-fit点gydF4y2B一个 28gydF4y2B一个
11gydF4y2B一个 分钟expt.误差无意义的LOF (95%)gydF4y2B一个 0.24688800gydF4y2B一个

定量构效关系模型的生成与模型相比,本研究在文献中获得(gydF4y2B一个 18gydF4y2B一个,gydF4y2B一个 19gydF4y2B一个如下所示:gydF4y2B一个 (15)gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 CgydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 4.77374gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.03903gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.18609gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.04924gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 TgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 4gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 0.50382gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.05235gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 CgydF4y2B一个 HgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.44712gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.06573gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 VgydF4y2B一个 PgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.22376gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.05623gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 xgydF4y2B一个 HgydF4y2B一个 CgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.18403gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 /gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 0.04374gydF4y2B一个 PgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 。gydF4y2B一个

NgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 16gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 0.9184gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 0.84987gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 pred = 0.79343 (gydF4y2B一个 18gydF4y2B一个]。gydF4y2B一个 (16)gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 CgydF4y2B一个 50gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 2.040810634gydF4y2B一个 ∗gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 CgydF4y2B一个 lgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 19.024890361gydF4y2B一个 ∗gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 TgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 1.855704759gydF4y2B一个 ∗gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 DgydF4y2B一个 FgydF4y2B一个 140年gydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 +gydF4y2B一个 6.739013671gydF4y2B一个 。gydF4y2B一个

NgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 我gydF4y2B一个 ngydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 27gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 0.9480gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 一个gydF4y2B一个 dgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 0.9350gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 vgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 0.87994gydF4y2B一个 ,gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 pred = 0.76907 (gydF4y2B一个 19gydF4y2B一个]。gydF4y2B一个

从上面的模型,它可以看到maxHCsats和3 d-radial分布函数(RDF)描述符生成模型中也观察到在这个研究。这表明这些描述符的活动有很大的影响对抑制化合物gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个。验证参数在这项工作报告和文献中报道的都同意参数表中给出gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个实际上,这证实了模型的鲁棒性。gydF4y2B一个

活动的描述性统计值训练集和测试集的数据表gydF4y2B一个 5gydF4y2B一个显示测试集值范围(8.2854 - 4.9074)在训练集值范围内(8.0899 - 4.7441)。此外,测试集活动的平均值和标准偏差值(6.4989和0.93)大约类似的训练集值(6.6222和0.96)。这表明测试组中添入的培训。因此,Kennard和石头的算法用于本研究能够生成一个测试集,是一个很好的反映了训练集。gydF4y2B一个

抑制的描述性统计数据。gydF4y2B一个

统计参数gydF4y2B一个 活动gydF4y2B一个
训练集gydF4y2B一个 测试集gydF4y2B一个
采样点数量gydF4y2B一个 35gydF4y2B一个 15gydF4y2B一个
范围gydF4y2B一个 3.3458gydF4y2B一个 3.678gydF4y2B一个
最大gydF4y2B一个 8.0899gydF4y2B一个 8.2854gydF4y2B一个
最低gydF4y2B一个 4.7441gydF4y2B一个 4.9074gydF4y2B一个
的意思是gydF4y2B一个 6.622234gydF4y2B一个 6.498873gydF4y2B一个
中位数gydF4y2B一个 6.3981gydF4y2B一个 6.1213gydF4y2B一个
方差gydF4y2B一个 0.924712gydF4y2B一个 0.866467gydF4y2B一个
标准偏差gydF4y2B一个 0.96162gydF4y2B一个 0.93084gydF4y2B一个
平均绝对偏差gydF4y2B一个 0.871588gydF4y2B一个 0.703515gydF4y2B一个
偏态gydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 8.48gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 04gydF4y2B一个 0.87066gydF4y2B一个
峰度gydF4y2B一个 −1.24682gydF4y2B一个 0.153415gydF4y2B一个

的名称和符号定量构效关系优化模型中所使用的描述符被报道在表gydF4y2B一个 6gydF4y2B一个。存在的三个2 d和3个3 d描述符的模型表明,这些类型的描述符能够描述更好的反gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个活动的化合物。皮尔森相关矩阵和统计的六个定量构效关系模型描述符用于报告在表gydF4y2B一个 7gydF4y2B一个,这清楚地表明,每一对描述符之间的相关系数非常低;因此,可以推断,不存在显著的组间关联的描述符用于构建模型。绝对的gydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 每个描述符大于2的统计值在95%显著水平,这表明所选择的描述符是好的。估计方差膨胀因子(VIF)所有的描述符的值小于4,这意味着所生成的模型具有统计学意义,描述符是正交的。gydF4y2B一个

列出了一些描述符用于构象优化模型。gydF4y2B一个

S /数量gydF4y2B一个 描述符的符号gydF4y2B一个 描述符的名称(s)gydF4y2B一个 类gydF4y2B一个
1gydF4y2B一个 AATS7sgydF4y2B一个 我平均Moreau-Broto Autocorrelation-lag 7 /加权gydF4y2B一个 二维gydF4y2B一个
2gydF4y2B一个 nHBint3gydF4y2B一个 E-state描述符的计算潜在的氢键强度的路径长度3gydF4y2B一个 二维gydF4y2B一个
3gydF4y2B一个 minHCsatugydF4y2B一个 最低atom-type H E-state: H C C sp3键不饱和gydF4y2B一个 二维gydF4y2B一个
4gydF4y2B一个 TDB9egydF4y2B一个 基于三维拓扑距离autocorrelation-lag 9 /加权桑德森电负性gydF4y2B一个 3 dgydF4y2B一个
5gydF4y2B一个 RDF90igydF4y2B一个 径向分布函数- 090 /加权相对第一电离势gydF4y2B一个 3 dgydF4y2B一个
6gydF4y2B一个 RDF110sgydF4y2B一个 径向分布函数- 110 /加权相对的我gydF4y2B一个 3 dgydF4y2B一个

皮尔森相关矩阵和统计的定量构效关系优化模型描述符中使用。gydF4y2B一个

组间关联gydF4y2B一个 统计数据gydF4y2B一个
描述符gydF4y2B一个 AATS7sgydF4y2B一个 nHBint3gydF4y2B一个 minHCsatugydF4y2B一个 TDB9egydF4y2B一个 RDF90igydF4y2B一个 RDF110sgydF4y2B一个 tgydF4y2B一个 统计gydF4y2B一个 VIFgydF4y2B一个
AATS7sgydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 −3.9153gydF4y2B一个 1.8931gydF4y2B一个
nHBint3gydF4y2B一个 −0.29824gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 11.6469gydF4y2B一个 1.2779gydF4y2B一个
minHCsatugydF4y2B一个 0.196097gydF4y2B一个 0.269067gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 10.0386gydF4y2B一个 3.6622gydF4y2B一个
TDB9egydF4y2B一个 0.446768gydF4y2B一个 −0.19131gydF4y2B一个 −0.14868gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 5.66824gydF4y2B一个 1.3493gydF4y2B一个
RDF90igydF4y2B一个 0.097382gydF4y2B一个 −0.13902gydF4y2B一个 −0.39183gydF4y2B一个 0.144839gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 9.45783gydF4y2B一个 3.0968gydF4y2B一个
RDF110sgydF4y2B一个 0.116862gydF4y2B一个 −0.25217gydF4y2B一个 −0.66819gydF4y2B一个 0.208747gydF4y2B一个 0.227911gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 −5.5848gydF4y2B一个 3.0275gydF4y2B一个

平均效应(我)值和标准回归系数(gydF4y2B一个 bgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 年代gydF4y2B一个 )gydF4y2B一个 报道在表gydF4y2B一个 8gydF4y2B一个提供重要的信息分子描述符的作用和贡献在发达的程度模型。这些描述符的符号和大小结合均值的影响表明个人的力量和方向影响化合物的活性。零假设说没有重要关系描述符和抑制剂化合物的活动。的gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 描述符的值在95%置信上限表所示gydF4y2B一个 8gydF4y2B一个都是小于0.05。这意味着接受备择假设。因此,有一个描述符用于生成之间的关系模型和抑制剂化合物带偏好的活动在零假设。gydF4y2B一个

规范基因algorithm-multiple回归模型的输入描述符。gydF4y2B一个

描述符gydF4y2B一个 标准回归系数(gydF4y2B一个 bgydF4y2B一个 jgydF4y2B一个 )gydF4y2B一个 意味着效果(我)gydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 价值gydF4y2B一个(置信区间)gydF4y2B一个
AATS7sgydF4y2B一个 −0.2769gydF4y2B一个 −0.31421gydF4y2B一个 0.000527gydF4y2B一个
nHBint3gydF4y2B一个 0.67675gydF4y2B一个 0.153246gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 12gydF4y2B一个
minHCsatugydF4y2B一个 0.987436gydF4y2B一个 0.58264gydF4y2B一个 8.84gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 11gydF4y2B一个
TDB9egydF4y2B一个 0.338438gydF4y2B一个 0.351968gydF4y2B一个 4.48gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 06gydF4y2B一个
RDF90igydF4y2B一个 1.097495gydF4y2B一个 0.34097gydF4y2B一个 3.25gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 10gydF4y2B一个
RDF110sgydF4y2B一个 −0.49948gydF4y2B一个 −0.11461gydF4y2B一个 5.62gydF4y2B一个 EgydF4y2B一个 - - - - - -gydF4y2B一个 06gydF4y2B一个

YgydF4y2B一个 随机参数测试报告在表gydF4y2B一个 9gydF4y2B一个。低gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 和gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 值几个试验证实定量构效关系模型是健壮发达,虽然gydF4y2B一个 cgydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 值大于0.5申明创建的模型是强大而不是偶然的。gydF4y2B一个

YgydF4y2B一个 ——随机参数测试。gydF4y2B一个

模型gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个
原始gydF4y2B一个 0.962302gydF4y2B一个 0.926026gydF4y2B一个 0.895386gydF4y2B一个
随机1gydF4y2B一个 0.387394gydF4y2B一个 0.150074gydF4y2B一个 −0.28301gydF4y2B一个
随机2gydF4y2B一个 0.534646gydF4y2B一个 0.285847gydF4y2B一个 −0.15518gydF4y2B一个
随机3gydF4y2B一个 0.357333gydF4y2B一个 0.127687gydF4y2B一个 −0.43633gydF4y2B一个
随机4gydF4y2B一个 0.509588gydF4y2B一个 0.25968gydF4y2B一个 −0.08884gydF4y2B一个
随机5gydF4y2B一个 0.231807gydF4y2B一个 0.053735gydF4y2B一个 −0.60188gydF4y2B一个
随机6gydF4y2B一个 0.140884gydF4y2B一个 0.019848gydF4y2B一个 −0.61556gydF4y2B一个
随机7gydF4y2B一个 0.513288gydF4y2B一个 0.263465gydF4y2B一个 −0.11043gydF4y2B一个
随机8gydF4y2B一个 0.548099gydF4y2B一个 0.300412gydF4y2B一个 −0.062gydF4y2B一个
随机9gydF4y2B一个 0.36673gydF4y2B一个 0.134491gydF4y2B一个 −0.25601gydF4y2B一个
随机10gydF4y2B一个 0.505524gydF4y2B一个 0.255554gydF4y2B一个 −0.12398gydF4y2B一个
随机模型参数gydF4y2B一个
平均gydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 0.409529gydF4y2B一个
平均gydF4y2B一个 rgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 0.185079gydF4y2B一个
平均gydF4y2B一个 问gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 −0.27332gydF4y2B一个
cgydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 pgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 0.837983gydF4y2B一个
3.1。解释选择的描述符gydF4y2B一个

AATS7s平均Moreau-Broto Autocorrelation-lag 7 /加权我自相关描述符。基于空间自相关函数的依赖,措施的强度关系的观察(原子或分子属性)和空间(滞后)分离他们。这个描述符是通过分子原子获得的离散点集的空间和一个原子属性为这些点的函数值。当这个描述符计算分子图,滞后伴随着拓扑任何一对顶点之间的距离。AATS7s定义在分子图使用原子质量(gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 电负性),桑德森(gydF4y2B一个 egydF4y2B一个 7)和诱导效应的双原子债券加权方案分开。这些观察结果表明,原子质量和电子组成分子的原子分布对数据集的抗结核的活动显著影响。此外,回归系数的符号为每个描述符表示的方向的影响模型的描述符,这样积极的回归系数与描述符将增加活动概要文件相关的化合物,而负的系数会降低化合物的活动。gydF4y2B一个

Electrotopological atom-type状态描述符nHBint3代表E-state描述符的计算潜在的氢键强度的路径长度3。它是依赖于一个空间的二维自相关描述符结合了莫兰系数(指数)之间的强度关系的观察和测量空间分离他们。这个莫兰自相关描述符包含在本研究中报道的模型上定义的分子图使用原子质量(gydF4y2B一个 米gydF4y2B一个 电负性),桑德森(gydF4y2B一个 egydF4y2B一个 ),诱导效应对原子相距债券加权方案。这些观察支持索赔,原子质量和电子分布有显著影响的抗结核的活动分子正意味着这个描述符的效果表明,抑制活动1,2,4-Triazole衍生品与氢键的路径长度将增加3。gydF4y2B一个

minHCsatu(最低atom-type H E-state: H C sp3连着不饱和C)是一个2 d electrotopological状态(E-state指数)atom-type描述符。一般来说,E-state指标编码每个原子的内在电子态电子摄动的影响所有其他分子中原子分子的拓扑特征的上下文中。maxHCsatu支持ch3不饱和C原子的增加,例如,在苯环。minHCsatu表明抑制活动的积极贡献1,2,4-Triazole衍生品将会增加增加分子描述符。gydF4y2B一个

TDB9e(基于3 d拓扑距离autocorrelation-lag 9 /加权桑德森电负性)呈正相关,抗惊厥的活动,这意味着增加其价值增加的活动研究的化合物。原子之间的连接的强度的描述符措施费用9债券。戒指在分子系统的数量会增加这个描述符的值作为分子的观察。这可能是由于增加的数量gydF4y2B一个 πgydF4y2B一个 电子在分子系统中,原子电荷差异带来增加9债券。积极意味着效应表明积极影响的活动抑制化合物,这意味着增加这个描述符的值会产生更高的这些化合物的活性。gydF4y2B一个

RDF90i和RDF110s 3 d径向分布函数在2.5和7.0原子间距离加权原子质量。径向分布函数概率分布,发现一个原子在一个球面的半径。RDF描述符是独立于整个分子的大小和旋转。他们描述了位阻或结构活性分子的性质。RDF描述符提供了有价值的信息关于债券距离,环类型、平面和空间的系统,和原子类型。这些描述符的存在的模型显示之间的线性关系的发生抗结核的活动和原子质量的3 d分子分布在分子计算半径的2.0和7.0每个分子的几何中心。RDF90i积极意味着效果(MF)表示对活动产生积极的影响,而RDF110s负平均效应(MF)表示负贡献的活动。gydF4y2Ba

预测活动与实验活动的培训和测试设置如图gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个和gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个。的gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 0.9202对训练集和价值gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 值为0.8842的测试集与GFA-derived记录在本研究协议gydF4y2B一个 RgydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 价值报告在表gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个。这证实了稳定性、可靠性和模型的鲁棒性。情节的标准化剩余与实验活动如图gydF4y2B一个 4gydF4y2B一个表示对称分布或随机散射点上方和下方的数据标准化剩余等于零。同时,所有数据点都在±2的标准化定义的边界残留。因此,这意味着没有系统性误差模型残差的传播是务实的两侧零(gydF4y2B一个 20.gydF4y2B一个]。gydF4y2B一个

情节训练集的预测活动与实验活动。gydF4y2B一个

预测活动的情节对测试集的实验活动。gydF4y2B一个

情节的标准化剩余活动与实验活动。gydF4y2B一个

数据集的标准化残差绘制反对他们利用每一个化合物,导致发现的异常值和有影响力的分子模型。威廉姆斯标准化残差的情节与杠杆值如图gydF4y2B一个 5gydF4y2B一个。从我们的结果,很明显,没有发现异常,因为所有的化合物为训练集和测试集是正方形区域的适用性域内除了三个化合物结构影响的分子(即。化合物50,39岁,36)。这三个化合物结构有影响的分子,因为他们的杠杆值大于警告杠杆(gydF4y2B一个 hgydF4y2B一个 ∗gydF4y2B一个 =gydF4y2B一个 0.60gydF4y2B一个 )。其高杠杆值负责摇曳的性能模型。这是由于强烈的差异在他们的化学结构与其他化合物的数据集。gydF4y2B一个

标准化残差的威廉姆斯情节和利用价值。gydF4y2B一个

 3.2。分子对接gydF4y2B一个

之间的分子对接研究进行了目标(Mtb CYP121)和1,2,4-Triazole衍生品。所有的化合物被发现抑制受体通过占据靶蛋白的活性区域(Mtb CYP121)。gydF4y2B一个

靶蛋白,所有化合物亲和力值的范围从5.1−−14.6千卡/摩尔报道在表gydF4y2B一个 10gydF4y2B一个。然而,四个配体(化合物7、8、13和14)有更高的约束力的分数,范围从10.0−14.6千卡/摩尔,是大于co-ligands。gydF4y2B一个

亲和力的1、2、4-Triazole衍生品gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个目标(Mtb CYP121)。gydF4y2B一个

配位体gydF4y2B一个 目标gydF4y2B一个 亲和力(BA)gydF4y2B一个千卡每摩尔gydF4y2B一个
1gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.3gydF4y2B一个
2gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.8gydF4y2B一个
3gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −8.5gydF4y2B一个
4gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −9.1gydF4y2B一个
5gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −9.6gydF4y2B一个
6gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −9.8gydF4y2B一个
7gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −10.3gydF4y2B一个
8gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −14.6gydF4y2B一个
9gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −9.6gydF4y2B一个
10gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −9.6gydF4y2B一个
12gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −9.2gydF4y2B一个
13gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −11.2gydF4y2B一个
14gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −11.2gydF4y2B一个
15gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.1gydF4y2B一个
11gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −9.9gydF4y2B一个
16gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.3gydF4y2B一个
17gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.1gydF4y2B一个
18gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.9gydF4y2B一个
19gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7gydF4y2B一个
20.gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.8gydF4y2B一个
21gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.5gydF4y2B一个
22gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.7gydF4y2B一个
23gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.5gydF4y2B一个
24gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.9gydF4y2B一个
25gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.6gydF4y2B一个
26gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.7gydF4y2B一个
27gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.4gydF4y2B一个
28gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.1gydF4y2B一个
29日gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.4gydF4y2B一个
30.gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.5gydF4y2B一个
31日gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.3gydF4y2B一个
32gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.6gydF4y2B一个
33gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.6gydF4y2B一个
34gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6gydF4y2B一个
35gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.3gydF4y2B一个
36gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.8gydF4y2B一个
37gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.8gydF4y2B一个
38gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −8.4gydF4y2B一个
39gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.7gydF4y2B一个
40gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.3gydF4y2B一个
41gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.3gydF4y2B一个
42gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.9gydF4y2B一个
43gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.6gydF4y2B一个
44gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.5gydF4y2B一个
45gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −6.2gydF4y2B一个
46gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.7gydF4y2B一个
47gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.9gydF4y2B一个
48gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.7gydF4y2B一个
49gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −5.2gydF4y2B一个
50gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 −7.8gydF4y2B一个

这四个配体可视化和分析发现工作室可视化工具,如图gydF4y2B一个 6gydF4y2B一个。亲和力、氢键和疏水键配体7日8日,13和14gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个目标(Mtb CYP121)发表在表gydF4y2B一个 11gydF4y2B一个。配位化合物(7)形成疏水相互作用VAL83 PRO285, VAL78, ALA167目标站点。此外,配体7还与GLN385形成氢键(2.16131)。配体8三氢键(2.82894,2.34089,和2.47314)与ALA337 HIS343, ALA233目标,而疏水相互作用与PHE280观察,ALA233, CYS345, MET86 ALA233, PRO346。配体13了两个氢键(2.34218和3.0328)ASN74和GLN385 VAL78, ALA233, PRO285, ALA233, PRO346, ALA167形成疏水作用。配体与LEU164 14形成疏水作用、VAL228 VAL78, ALA233, PRO285, ALA233, PRO346, ALA167,和ALA233,而两个氢键(2.36479和3.03627)之间形成ASN74 GLN385的目标。gydF4y2B一个

亲和力、氢键和疏水键配体7日8日,13和14gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个目标(Mtb CYP121)。gydF4y2B一个

配位体gydF4y2B一个 亲和力(BA)gydF4y2B一个千卡每摩尔gydF4y2B一个 目标gydF4y2B一个 氢键gydF4y2B一个 疏水作用gydF4y2B一个
氨基酸gydF4y2B一个 键长(A)gydF4y2B一个 氨基酸gydF4y2B一个
7gydF4y2B一个 −10.3gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 GLN385gydF4y2B一个 2.16131gydF4y2B一个 VAL83、PRO285 VAL78、VAL78 LA167gydF4y2B一个
8gydF4y2B一个 −14.6gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 ALA337gydF4y2B一个HIS343gydF4y2B一个ALA233gydF4y2B一个 2.82894gydF4y2B一个2.34089gydF4y2B一个2.47314gydF4y2B一个 PHE280、ALA233 CYS345、MET86 ALA233 PRO346gydF4y2B一个
13gydF4y2B一个 −11.2gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 ASN74gydF4y2B一个GLN385gydF4y2B一个 2.34218gydF4y2B一个3.0328gydF4y2B一个 VAL78、ALA233 PRO285、ALA233 PRO346gydF4y2B一个ALA167gydF4y2B一个
14gydF4y2B一个 −11.2gydF4y2B一个 Mtb CYP121gydF4y2B一个 ASN74gydF4y2B一个GLN385gydF4y2B一个 2.36479gydF4y2B一个3.03627gydF4y2B一个 LEU164、VAL228 VAL78、ALA233 PRO285gydF4y2B一个ALA233、PRO346 ALA167 ALA233gydF4y2B一个

(7)和b(7)显示3 d和2 d 7 Mtb CYP121和配体之间的相互作用。8 (8 a)和(b)显示3 d和2 d 8 Mtb CYP121和配体之间的相互作用。13(13)和(b)显示3 d和2 d 13 Mtb CYP121和配体之间的相互作用。14(14)和(b)显示3 d和2 d 14 Mtb CYP121和配体之间的相互作用。gydF4y2B一个

 4所示。结论gydF4y2B一个

2 d和3 d描述符的模式是高等卓越并提出一个令人满意的反相关gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个活动。2 d和3 d描述符的组合产生更好的模型来预测反gydF4y2B一个 结核分枝杆菌gydF4y2B一个这些化合物的活性。定量构效关系模型的生成符合最低的标准推荐值的验证参数定量构效关系模型一般可以接受的。分子对接分析表明,几乎所有的1、2,4-Triazole衍生品可能抑制Mtb CYP121。然而,化合物7、8、13和14绑定更高分数从10.03−−11.02千卡每摩尔。这四个化合物能够停靠深深绑定口袋Mtb CYP121区域内,形成氢键和疏水相互作用与氨基酸的目标。定量构效关系模型的产生为配体基础设计提供了一种有价值的方法,而分子对接研究为结构基础设计提供了一种有价值的方法。这两种方法将很大的帮助制药和药物化学家设计和合成新的反gydF4y2Ba 结核分枝杆菌gydF4y2B一个化合物。gydF4y2B一个

 的利益冲突gydF4y2B一个

作者宣称没有利益冲突。gydF4y2B一个

 科尔gydF4y2B一个 圣。gydF4y2B一个 BroschgydF4y2B一个 R。gydF4y2B一个 ParkhillgydF4y2B一个 J。gydF4y2B一个 加尼叶gydF4y2B一个 T。gydF4y2B一个 相遇gydF4y2B一个 C。gydF4y2B一个 哈里斯gydF4y2B一个 D。gydF4y2B一个 戈登gydF4y2B一个 年代。gydF4y2B一个 VgydF4y2B一个 K。gydF4y2B一个 气体gydF4y2B一个 年代。gydF4y2B一个 巴里gydF4y2B一个 c, E。gydF4y2B一个 破译结核分枝杆菌的生物学从完整的基因组序列gydF4y2B一个 自然gydF4y2B一个 1998年gydF4y2B一个 393年gydF4y2B一个 537年gydF4y2B一个 544年gydF4y2B一个 LamichhanegydF4y2B一个 G。gydF4y2B一个 弗伦德里希gydF4y2B一个 j·S。gydF4y2B一个 郑伊健gydF4y2B一个 年代。gydF4y2B一个 WickramaratnegydF4y2B一个 N。gydF4y2B一个 诺兰gydF4y2B一个 s T。gydF4y2B一个 BishaigydF4y2B一个 w·R。gydF4y2B一个 结核分枝杆菌及其模拟的关键代谢物gydF4y2B一个 mBiogydF4y2B一个 2011年gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 10.1128 / mBio.00301-10gydF4y2B一个 2 - s2.0 - 79953700626gydF4y2B一个 MadkourgydF4y2B一个 M . M。gydF4y2B一个 肺结核gydF4y2B一个 2004年gydF4y2B一个 柏林,德国gydF4y2B一个 施普林格gydF4y2B一个 10.1007 / 978-3-642-18937-1gydF4y2B一个 SarkargydF4y2B一个 D。gydF4y2B一个 DeshpandegydF4y2B一个 s R。gydF4y2B一个 MaybhategydF4y2B一个 s P。gydF4y2B一个 LikhitegydF4y2B一个 答:P。gydF4y2B一个 SarkargydF4y2B一个 年代。gydF4y2B一个 汗gydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 乔杜里gydF4y2B一个 p . M。gydF4y2B一个 ChavangydF4y2B一个 s R。gydF4y2B一个 1、2、4-Triazole衍生品及其抗菌活性gydF4y2B一个 2016年gydF4y2B一个 HanschgydF4y2B一个 C。gydF4y2B一个 利奥gydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 取代基的常量化学和生物学的相关分析gydF4y2B一个 1979年gydF4y2B一个 威利gydF4y2B一个 黄gydF4y2B一个 k . Y。gydF4y2B一个 梅gydF4y2B一个 a·G。gydF4y2B一个 萨维德拉gydF4y2B一个 l . M。gydF4y2B一个 HonarparvargydF4y2B一个 B。gydF4y2B一个 RomanelligydF4y2B一个 g . P。gydF4y2B一个 DuchowiczgydF4y2B一个 p R。gydF4y2B一个 构象分析tacrine-related乙酰胆碱酯酶抑制剂gydF4y2B一个 生物医学科学杂志gydF4y2B一个 2014年gydF4y2B一个 21gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 10.1186 / s12929 - 014 - 0084 - 0gydF4y2B一个 2 - s2.0 - 84907914062gydF4y2B一个 LarifgydF4y2B一个 M。gydF4y2B一个 ChtitagydF4y2B一个 年代。gydF4y2B一个 AdadgydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 HmamouchigydF4y2B一个 R。gydF4y2B一个 BouachrinegydF4y2B一个 M。gydF4y2B一个 LakhlifigydF4y2B一个 T。gydF4y2B一个 预测生物活性的抗癌分子3-ary l-4-hydroxyquinolin-2——(1 h)——DFT-QSAR模型gydF4y2B一个 国际临床和实验医学杂志》上gydF4y2B一个 2013年gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 32gydF4y2B一个 42gydF4y2B一个 莉儿gydF4y2B一个 m·A。gydF4y2B一个 能源部gydF4y2B一个 m . L。gydF4y2B一个 计算机辅助药物设计使用PyMOL平台gydF4y2B一个 计算机辅助分子设计杂志》上gydF4y2B一个 2011年gydF4y2B一个 25gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 13gydF4y2B一个 19gydF4y2B一个 10.1007 / s10822 - 010 - 9395 - 8gydF4y2B一个 2 - s2.0 - 78651235334gydF4y2B一个 霍金斯gydF4y2B一个 p c, D。gydF4y2B一个 斯基尔曼gydF4y2B一个 a·G。gydF4y2B一个 尼科尔斯gydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 风靡一时的比较和对接虚拟筛选工具gydF4y2B一个 医药化学杂志gydF4y2B一个 2007年gydF4y2B一个 50gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 74年gydF4y2B一个 82年gydF4y2B一个 2 - s2.0 - 33846212271gydF4y2B一个 10.1021 / jm0603365gydF4y2B一个 贝克gydF4y2B一个 答:D。gydF4y2B一个 贝克的三个参数混合方法使用LYP相关功能gydF4y2B一个 《物理化学》杂志上gydF4y2B一个 1993年gydF4y2B一个 98年gydF4y2B一个 5648年gydF4y2B一个 5652年gydF4y2B一个 李gydF4y2B一个 C。gydF4y2B一个 杨gydF4y2B一个 W。gydF4y2B一个 帕尔gydF4y2B一个 r·G。gydF4y2B一个 发展Colle-Salvetti相关能成有功能的电子密度的公式gydF4y2B一个 物理评论BgydF4y2B一个 1988年gydF4y2B一个 37gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 785年gydF4y2B一个 10.1103 / PhysRevB.37.785gydF4y2B一个 2 - s2.0 - 0345491105gydF4y2B一个 辛格gydF4y2B一个 P。gydF4y2B一个 定量构效关系研究的替代——(1、2、4)恶二唑s1p1受体激动剂gydF4y2B一个 当前化学和制药科学杂志》上gydF4y2B一个 2013年gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 MinovskigydF4y2B一个 N。gydF4y2B一个 ŽuperlgydF4y2B一个 Š。gydF4y2B一个 DrgangydF4y2B一个 V。gydF4y2B一个 NovičgydF4y2B一个 M。gydF4y2B一个 适用性评估领域多元counter-propagation人工神经网络预测模型的最小欧氏距离空间分析:一个案例研究gydF4y2B一个 分析Chimica学报gydF4y2B一个 2013年gydF4y2B一个 759年gydF4y2B一个 28gydF4y2B一个 42gydF4y2B一个 2 - s2.0 - 84871397497gydF4y2B一个 10.1016 / j.aca.2012.11.002gydF4y2B一个 弗里德曼gydF4y2B一个 j . H。gydF4y2B一个 多元自适应回归样条函数gydF4y2B一个 统计年报gydF4y2B一个 1991年gydF4y2B一个 19gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 67年gydF4y2B一个 10.1214 /市场/ 1176347963gydF4y2B一个 MR1091842gydF4y2B一个 Zbl0765.62064gydF4y2B一个 AbdulfataigydF4y2B一个 U。gydF4y2B一个 UzairugydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 非洲联合银行gydF4y2B一个 年代。gydF4y2B一个 定量结构活性关系研究的抗惊厥的活动a_substituted acetamido-N-benzylacetamide衍生品gydF4y2B一个 有说服力的化学gydF4y2B一个 2016年gydF4y2B一个 2gydF4y2B一个 1166538gydF4y2B一个 TropshagydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 GramaticagydF4y2B一个 P。gydF4y2B一个 GombargydF4y2B一个 诉K。gydF4y2B一个 认真的重要性:验证是绝对必不可少的部分模型的成功应用和解释gydF4y2B一个 分子信息学gydF4y2B一个 2003年gydF4y2B一个 22gydF4y2B一个 69年gydF4y2B一个 77年gydF4y2B一个 VeerasamygydF4y2B一个 R。gydF4y2B一个 RajakgydF4y2B一个 H。gydF4y2B一个 耆那教徒的gydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 SivadasangydF4y2B一个 年代。gydF4y2B一个 VarghesegydF4y2B一个 c·P。gydF4y2B一个 AgrawalgydF4y2B一个 r·K。gydF4y2B一个 定量构效关系models-strategies验证和重要性gydF4y2B一个 国际期刊的药物设计和发现gydF4y2B一个 2011年gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 511年gydF4y2B一个 519年gydF4y2B一个 埃里克gydF4y2B一个 g . M。gydF4y2B一个 UzairugydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 MamzagydF4y2B一个 p。gydF4y2B一个 定量结构活性关系(构象)研究抗结核活性的喹诺酮类gydF4y2B一个 《科学研究和报告gydF4y2B一个 2016年gydF4y2B一个 10gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 15gydF4y2B一个 OgadimmagydF4y2B一个 答:我。gydF4y2B一个 达姆gydF4y2B一个 U。gydF4y2B一个 分析选择查耳酮衍生物作为结核分枝杆菌抑制剂gydF4y2B一个 开放图书馆杂志gydF4y2B一个 2016年gydF4y2B一个 3gydF4y2B一个 1gydF4y2B一个 13gydF4y2B一个 Jalali-HeravigydF4y2B一个 M。gydF4y2B一个 KyanigydF4y2B一个 一个。gydF4y2B一个 使用计算机辅助方法建模的多种挥发性有机化合物的保留时间:PCA-MLR-ANN方法gydF4y2B一个 化学信息和计算机科学杂志》上gydF4y2B一个 2004年gydF4y2B一个 44gydF4y2B一个 4gydF4y2B一个 1328年gydF4y2B一个 1335年gydF4y2B一个 2 - s2.0 - 4043174775gydF4y2B一个 10.1021 / ci0342270gydF4y2B一个