JPATH 杂志的病原体 2090 - 3065 2090 - 3057 Hindawi出版公司 10.1155 / 2015/374354 374354年 研究文章 没有多态性 恶性疟原虫K13螺旋桨在临床分离株基因从加尔各答,印度 Chatterjee Moytrey 1 Ganguly Swagata 1、2 2 萨哈 Pabitra 1、3 3 bhabi mahato Biswabandhu 4 巴苏 Nandita 5 达斯 马 4 古哈 Subhasish K。 6 Maji Ardhendu K。 1 塞古拉 马列拉。 1 原生动物学单位 微生物学系 加尔各答热带医学学院 Chittaranjan大街108号 加尔各答700 073 印度 stmkolkata.org 2 微生物学系 NRS医学院 AJC Bose路138号 加尔各答700 014 印度 nrsmch.org 3 生态学系 APC罗伊政府大学 Himachal比哈尔邦 Matigara 西里古里 西孟加拉734 010 印度 apcrgc.org 4 生态学系 Ballygunge科学大学 加尔各答大学 35 Ballygunge环形道路 加尔各答700 019 印度 caluniv.ac.in 5 加尔各答热带医学学院 Chittaranjan大街108号 加尔各答700 073 印度 stmkolkata.org 6 美国热带医学 加尔各答热带医学学院 Chittaranjan大街108号 加尔各答700 073 印度 stmkolkata.org 2015年 25 11 2015年 2015年 19 08年 2015年 11 11 2015年 25 11 2015年 2015年 版权©2015 Moytrey Chatterjee et al。 这是一个开放的文章在知识共享归属许可下发布的,它允许无限制的使用,分布和繁殖在任何媒介,提供最初的工作是正确的引用。

分子标记与青蒿素耐药性有关 恶性疟原虫尚未定义。最近的研究表明,多态性 K13基因与青蒿素耐药性有关。本研究旨在了解多态性的模式在螺旋桨的地区 K13基因在临床分离株来自城市加尔各答经过五年的实施行动。我们收集59个城市加尔各答和测序螺旋桨地区临床分离菌 K13基因成功51隔离。我们并没有发现任何孤立的突变。所有患者回应,青蒿琥酯+周效磺胺的组合。药物疗法仍然是有效的研究区域,没有迹象的出现就是明证野生基因型对青蒿素的耐药性 K13基因的分离进行了研究。

 1。介绍

对不同的抗疟药的耐药性的出现(amd)特别是在 恶性疟原虫是一个严重的问题在抗击疟疾。在1990年代 恶性疟原虫获得抗氯喹(CQ)和周效磺胺(SP)在所有疟疾流行国家。世界卫生组织(WHO)推荐的青蒿素联合疗法治疗(ACT)为第一行的代理都不复杂 恶性疟原虫疟疾在世界各地。引入后的行为和增加使用经杀虫剂处理过的蚊帐(ITBNs)引起的死亡率和发病率 恶性疟原虫全球疟疾减少( 1)包括印度( 2, 3]。不幸的是,几年之内 恶性疟原虫发达国家对青蒿素的耐药性。青蒿素耐药性已定义的寄生虫在体内功效研究间隙时间,在体外环阶段生存分析( 4- - - - - - 6]。首次报道青蒿素耐药性从柬埔寨西部[ 7, 82009年)。现在已经遍布东南亚国家( 6, 9- - - - - - 13]。

法,结合青蒿琥酯+周效磺胺(+ SP)在2009年首次引入印度治疗无并发症 恶性疟原虫用例。以前法案建议只在一些高危地区像发自亚杰尔拜古里西孟加拉邦。功效的一些研究表明,这种组合仍然是有效的在不同地区( 14, 15)除了东北部( 13]而+ SP蒿甲醚+ lumefantrine所取代。抗疟药物疗效监测每两年可以预测耐药的出现,如果任何。虽然体内疗效研究仍然是黄金标准的目的、分子标记也被作为替代工具进行验证。K76单一突变 T在 pfcrtCQ耐药性的基因,是一个标志( 16, 17和五倍的突变 pfdhfr和 pfdhps基因强烈与SP电阻( 18]。最近在螺旋桨的多态性 恶性疟原虫Kelch蛋白( K13发现了基因)与青蒿素耐药性有关( 19]。多态性在 K13来自不同国家的基因已报告( 9, 19- - - - - - 26),但这样的报告从印度是稀缺的。最近的一份报告显示,突变 K13基因是有限的( 27)菌株从东北地区分离的国家。本研究涉及的模式在螺旋桨的多态性 K13基因在临床分离收集从加尔各答,印度,经过五年的实施行动。

 2。材料和方法 2.1。学习网站和血液样本的集合

这项研究是疟疾诊所进行附加到原生动物学加尔各答热带医学学院的单位,加尔各答,从1月到12月,2014年。在日常实践中诊断是由染色染色后显微镜厚和薄血的电影。报告和药物分布在同一天。所有的治疗 恶性疟原虫例建议参加复审的诊所天1、2、3、7、14、21、28、35、42。2 - 3毫升EDTA从显微镜下收集血液样本 恶性疟原虫积极病人分布在报告和医学在获得知情同意或同意从病人/ 14岁以下儿童的监护人。综述了研究方案,通过机构伦理委员会的加尔各答热带医学学院的加尔各答。

 2.2。DNA隔离

恶性疟原虫基因组DNA分离从全血样品使用QIAamp DNA血液迷你包(试剂盒、希尔登,德国),遵循制造商的指示。中提取DNA的所有样品保存在−20°C和一个整除作为进一步研究的DNA来源。

 2.3。嵌套PCR和测序的<斜体> K13 < /斜体>基因螺旋桨

的螺旋桨领域 K13基因是由嵌套PCR扩增方法描述Ariey et al ., 2014。所有放大反应进行了最后的20倍 μL为初级PCR和50 μL为嵌套PCR。总结了寡核苷酸引物PCR条件表 1。

基本和嵌套PCR引物PCR条件 K13基因。

引物名称 引物序列(5′3′) 毫克2 + 聚合酶链反应计划
浓缩的。 变性 退火 伸长 数量的周期
(毫米) Temp。 时间 Temp。 时间 Temp。 时间 1日 2日
(°C) (分钟) (°C) (分钟) (°C) (分钟) 聚合酶链反应 聚合酶链反应
K13_PCR_FK13_PCR_R CGGAGTGACCAAATCTGGGAGGGAATCTGGTGGTAACAGC 3 94年 破发 60 下午1:30 72年 下午1:30 40 - - - - - -
K13_N1_FK13_N1_R GCCAAGCTGCCATTCATTTGGCCTTGTTGAAAGAAGCAGA 2。5 94年 破发 60 下午1:30 72年 下午1:30 - - - - - - 40

PCR产物的质量和浓度是确定溴化乙锭染色后1.5%琼脂糖凝胶电泳。嵌套PCR产物纯化使用QIAquick PCR净化设备(试剂盒)。测序从羊膜生物科学公司外包,班加罗尔,印度。

 2.4。序列的分析

分析了序列使用自由软件Bioedit序列比对编辑器版本7.0.5.2和与序列PF3D7_1343700 Kelch蛋白质螺旋桨使用在线序列比对工具ClustalW域。

 3所示。结果

在研究期间共8877例发热病人参加了临床诊断和治疗疟疾。其中1223是积极的 间日疟原虫和107是积极的 恶性疟原虫。混合感染的存在 间日疟原虫和 恶性疟原虫不能排除的分子诊断方法没有执行。107 恶性疟原虫病例收集血液样本来自59个病人答应了。虽然不是所有治疗随访疗效研究临床和寄生虫学的如前所述。发现所有患者59 + SP疗法,也就是说,没有复发的情况记录在六周后治疗期间。

59个样本,测序的螺旋桨的地区 K13基因是在51做隔离。与PF3D7_1343700对齐后,发现所有51从核苷酸序列完全一致数量1327到1998码(443 - 666),也就是说,螺旋桨叶片叶片1到5的区域 K13基因。在叶片6部分序列进行了研究。所有的压力都是野生型没有在这个区域的基因多态性。的核苷酸序列 K13基因的 恶性疟原虫孤立的研究网站已提交在基因库加入KR779827.1数量。

 4所示。讨论

与氯喹和周效磺胺阻力,青蒿素耐药性 恶性疟原虫尚未定义良好的,没有确立明确的表型除了延迟化疗后寄生虫间隙和环阶段生存分析(RSA) [ 7, 9]。这些参数的迹象出现寄生虫对青蒿素的耐药性衍生品。谁( 28]怀疑部分定义如下:青蒿素耐药性持久寄生虫血症通过显微镜在治疗后3天/ 10%青蒿琥酯单药治疗更多的病人或resistance-associated突变的存在 K13基因在至少5%的患者或寄生虫清除半衰期是超过5小时后治疗。确认部分青蒿素耐药性的定义是存在的 K13resistance-associated突变至少有5%的患者持续parasitaemia通过显微镜在3天或寄生虫清除半衰期≥5小时后与行为或青蒿琥酯单一疗法治疗。为了节省青蒿素衍生物的功效,这单药已经停了下来,与另一个代理合作伙伴推荐的药物。所以功效的研究行为并不单独处理青蒿素的功效。明确的表型的阻力是非常罕见的,协会的多态性标记基因很难与疗效结果。Ariey et al ., 2014 19),最近表明,四个多态性C580 Y,Y493 H,R539 T,M476 l在螺旋桨的地区 K13基因与青蒿素耐药性密切相关。下面这个发现一些工人报道这个基因的snp数量特别是在螺旋桨从世界各地的地区 9, 19- - - - - - 26]。

在目前的研究中,我们发现寄生虫了53例1天,其余6例在2天。我们没有找到任何的螺旋桨部分基因的突变和报告从这个国家也罕见突变的 27]。然而突变A578 年代毗邻C580是哪一个 Y,主要的变异导致延迟寄生虫间隙,据报道从邻国孟加拉国 22]在F446和变异 我从缅甸 26]。

 5。结论

引入了行为在加尔各答5年前。我们没有考虑到这种寄生虫清除半衰期或环阶段生存试验研究和样本容量也小,所以很难评论出现抵抗。如果确定了单核苷酸多态性与青蒿素耐药性的协会是真的,那么这表明在城市加尔各答的基线信息 恶性疟原虫人口仍对青蒿素敏感。相似的研究来自不同地区的国家和他们的协会与延迟寄生虫间隙和RSA将有助于确定青蒿素耐药性的出现,如果任何。四和五倍的突变 pfdhfr和 pfdhps基因已经被报道来自不同地区的( 29日]。SP是作为伙伴药物的行为,这种组合的体内药效研究应该定期进行监控两年。

 利益冲突

作者没有利益冲突有关的工作报告。

 作者的贡献

Ardhendu k Maji Swagata Ganguly设计研究;Moytrey Chatterjee、Swagata Ganguly Pabitra萨哈,Subhasish k·古和Nandita Basu临床检查,招募,并随访患者和收集血液样本;Swagata Ganguly提供了治疗;Moytrey Chatterjee、Swagata Ganguly Pabitra萨哈评估实验室诊断和分子研究。Moytrey Chatterjee Pabitra萨哈,Biswabandhu bhabi mahato,马Das进行数据分析和解释。Ardhendu k . Maji Swagata Ganguly Moytrey Chatterjee和Nandita Basu准备。

 确认

作者感谢所有患者参与本研究,科技部,西孟加拉邦政府财政支持这项研究。

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