抗腐树种提取物是未来木材防腐剂发展的重要研究对象。了解其抗真菌作用机制
木材是一种经济且环保的材料,可用于多种最终用途,如家具、人造板和木结构。然而,一些木材容易受到外部因素的损坏或破坏,从而降低其商业价值。特别是,生物腐烂,包括木腐菌和腐霉这是对木材最严重、最有害的威胁[
目前的研究表明,不同耐腐性的树种具有不同的抗真菌化学成分,不同的提取方法和溶剂可获得不同的抗真菌化学成分。一般来说,抗腐木材提取物可以抑制木腐真菌,而不抗腐的木材浸渍了抗腐心材提取物可以变得抗腐[
蛋白质是由特殊的氨基酸组成的,这些氨基酸是生物体的基本组成部分,参与细胞内的每一个过程[
总之,研究人员探索了多种植物提取物的抗真菌和抗腐性能,并报告了在许多领域的大量应用,例如抗真菌(白腐真菌和褐腐真菌)和杀虫活性[
pH标准(pH 3–10,
使用pH梯度等电聚焦(IPG) Ettan™-IPGphor™III IEF系统垂直凝胶板电泳仪。该研究使用了Ettan™Dalt II垂直系统、ImageScanner III扫描密度计(GE Healthcare)图像分析系统、5800 MALDI-TOF/TOF-MS仪器、THY-111B持续振荡培养箱和制备型超离心机(BECKMANCOULTER OPTIMAL)。
实验树(
含25 mL 4% (
抗真菌活性
将菌丝用液氮研磨,用20ml TCA /丙酮混合,并均化。然后将混合物在-20℃下沉淀12小时。沉淀后,将样品以4℃和11000rpm离心15分钟。除去上清液,然后除去20mL丙酮,在-20℃下预冷,并含有0.07%
等电点聚焦进行了使用Ettan™-IPGphor™能源论坛第三合作系统陶瓷盘上使用以下协议:13 h 30 V, 1.0 h在500 V, 6 h在1000 V, 8 h在8000 V(梯度),4 h 8000 V(步骤),并在1000 V 30 h。然后在平衡缓冲液I (10 mL平衡液与100 mg DTT)中平衡15分钟,随后在平衡缓冲液II (10 mL平衡液与250 mg碘乙酰胺)中平衡15分钟。然后用滤纸吸收带上多余的平衡缓冲液。将条带冲洗后置于10%聚丙烯酰胺凝胶板上,加入相对质量标准蛋白。最后进行第二次垂直电泳实验[
将平衡的IPG条固定在玻璃凝胶板上,1 加入mL琼脂糖密封胶。然后,将玻璃凝胶板放置在Ettan的缓冲罐中™ DALT II垂直系统。电泳在16°C水循环条件下进行,恒功率为4 W·胶-1. 当示踪剂溴酚蓝到达凝胶底部边缘时,停止电泳,并移除凝胶并染色。
采用图像扫描仪进行图像扫描。图像母版™ 2D Platinum 7.0用于实现2-DE指纹分析[
人工从ccb染色凝胶中切除感兴趣的蛋白点,并进行凝胶内胰蛋白酶消化。经消化后,用0.1%三氟乙酸(TFA)在50% ACN中提取多肽两次。提取液被集中在一起,完全用SpeedVac设备干燥。肽混合物在0.1%的TFA和0.8
在AB SCIEX MALDI-TOF / TOF-MS™5800分析仪(AB SCIEX,FOSTE CITY,CA)上进行蛋白质鉴定,配备钕:钇 - 铝石榴石激光器(激光波长:349nm)。TOF / TOF校准混合物(AB SCIEX)用于将质谱仪校准到100ppm以内的质量耐受性。对于MS模式,在正反射模式下获得肽质量映射,700-3600 m·z-1质量范围为每光谱1000次激光射击。以环境空气为碰撞气体,介质压力为10,每点最多选取50个前体,最小信噪比为25,进行MS/MS分析-6 托尔。MS/MS分析排除了源自人类角蛋白、胰蛋白酶自动消化或基质的污染m/z峰。2的能量 KV用于碰撞诱导离解(CID),每个MS/MS谱累积2500次采集。使用GPS Explorer TM软件按照以下标准处理原始MS和MS/MS光谱:真菌(1757520个序列;762750636个残基)、释放日期(2016.03.11)、胰蛋白酶作为消化酶、一次缺失切割、100 ppm前体耐受性,MS/MS离子耐受性为0.6 Da和蛋氨酸氧化作为可变修饰。蛋白质得分置信区间(C.Is.)大于95%的蛋白质(
甲醇提取物
2D-GE图显示的结果
蛋白质的双向电泳凝胶图
使用软件匹配每个蛋白质的二维电泳图,发现41蛋白质表现出丰富的变化具有良好的重现性和明显的2倍以上的变化表达式,其中21个蛋白质斑点是调节和20个蛋白质点表达下调(图
蛋白质组学是指对基因组编码的所有蛋白质进行大规模分析,分为表达蛋白质组学和功能蛋白质组学
通过对生理功能的推断,蛋白质可分为以下几类[
差异表达斑点
| 现场编号。 | 蛋白质描述 | 加入不。 | 肽 | MW/pI | 蛋白质评分 | 序列覆盖范围 | 有机体 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13. | 类似于含有UBA/TS-N结构域的蛋白质 | Gi | 312216952 | 2. | 152573/5.69 | 65 | 3% |
|
| 15. | 蛋白磷酸酶 | 胃肠道| 320591516 | 14. | 48259/4.69 | 182 | 24% |
|
| 24. | ATP合酶链,线粒体前体 | Gi | 114193514 | 23. | 59832/9.14 | 406 | 34% |
|
| 33. | 假设蛋白质SNOG_12700 | gi | 169619014 | 17. | 28025/8.83 | 60 | 49% |
|
| 36. | Remname:Full =磷酸性激酶 | Gi | 400757 | 9 | 44353 / 6.16 | 182 | 22% |
|
| 37. | 死亡/死亡盒螺旋酶 | gi | 310790877. | 27. | 44680/5.02 | 642 | 40% |
|
| 49. | ATP合酶-链,线粒体前体 | gi | 46116940 | 23. | 54852/5.40 | 393. | 38% |
|
| 56 | 甘油醛-3-磷酸脱氢酶 | Gi | 228551660 | 13. | 36053/6.46 | 263 | 23% |
|
| 58 | 预测蛋白质 | gi | 302918373. | 5. | 15925/5.84 | 209 | 24% |
|
| 59 | 假设蛋白SMAC_03111 | 胃肠道| 336269525 | 19. | 44437/8.70 | 447 | 34% |
|
| 114. | 预测蛋白质 | 胃肠道| 302914537 | 17. | 37541/9.48 | 320. | 30% |
|
| 168 | 假设蛋白FG00036.1 | 胃肠道| 46102664 | 32. | 176621/5.75 | 75 | 19% |
|
| 175 | 预测蛋白质 | gi | 302918373. | 6. | 15925/5.84 | 188 | 24% |
|
| 186 | 假设蛋白SERLADRAFT_468747 | GI | 336383691. | 15. | 35195/9.83 | 74 | 39% |
|
| 190 | 丙二酰辅酶a -酰基载体蛋白转酰基酶 | Gi | 32268339 | 9 | 47145/9.33 | 68 | 28% |
|
| A. | 天冬氨酸转氨酶 | Gi | 295669158 | 16. | 47022/9.25 | 176 | 31% |
|
| B | 假设蛋白质NECHADRAFT_91822 | Gi | 302920406 | 7. | 21737/6.71 | 134. | 19% |
|
| C | 液泡ATP合酶亚单位E | Gi | 322705501 | 7. | 25896/6.69 | 110. | 23% |
|
| D | 五功能AROM多肽,推定 | Gi | 218724284 | 19. | 74261/6.72 | 61 | 27% |
|
可以发现质谱鉴定的14种差异蛋白质与细胞定位相关(图1)
蛋白质差异的细胞定位
从图中可以看出
不同蛋白质的生物学过程
每个类别中蛋白质功能的百分比如图所示
蛋白质的官能团
天冬氨酸转氨酶是一种催化活性高的酶,广泛存在于动物、植物和微生物中。这种酶在细胞的氮和碳代谢中起着非常重要的作用[
ATP合成酶α链是一种与能量代谢相关的酶。这种酶在质子梯度穿过膜的情况下从ADP产生ATP[
甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)是一种高度保守的蛋白质,在中央碳代谢中起作用。GAPDH是为支持生活提供能源活动的最基本酶之一[
线粒体前体ATP合酶β链是一种与能量代谢相关的酶,目前尚无相关文献报道该酶的详细信息。
空泡ATP合酶亚基E的功能主要是ATP水解质子交换膜偶联,ATPase也参与质子的转运和旋转机制[
解旋酶广泛存在于几乎所有的原核生物和真核生物中,是一类分解氢键的酶。这些酶的功能主要包括核酸结合、解旋酶活性和ATP结合[
磷酸甘油酸激酶(PGK)是糖酵解过程中的关键酶,几乎存在于所有生物体内,是生物体依赖的重要酶[
该研究揭示了次生代谢物的抗真菌机制
本研究未使用任何数据。
作者声明他们没有利益冲突。
该项目得到了中国自然科学基金的补助金(第31760191号;第21966015号),在生化产业中的福建省主要材料的开放题目(FJKL_FBCM202005),以及绿色重点实验室的开放题目能量和环境催化(FJ-GEEC202005)。
以下内容可在网上找到。图S1:与对照组比较的差异蛋白表达水平(a)蛋白斑点数6-40;(b)蛋白斑点数44-114;(c)蛋白斑点数128-192。图S2: 24号蛋白点(ATP合酶α链,线粒体前体)的质谱图((a) ATP合酶α链,线粒体前体的肽质量指纹图;(b) 1332肽的MS/MS图谱,离子评分为82;(c) 1553肽段的MS/MS图谱,离子评分为78)。