新型冠状病毒病(现在称为COVID-19)是一个致命的和非常新颖的冠状病毒引起的传染性呼吸道疾病,现在命名为严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2) [
在埃塞俄比亚,报道了第一例COVID-19 2020年3月13日(
以社区为基础的横断面研究从7月1日到2020年8月31日在埃塞俄比亚东北部。研究领域包括三个地区:南罗区,远处区域国家东北地区(最近的),和Oromia特区东北部埃塞俄比亚。有两个COVID-19在这个地区的国家考试中心:罗大学COVID-19实验室测试中心和阿姆哈拉公共卫生研究所(APHI) Dessie分支。此外,每个斯吉尔特区和城市COVID-19筛查、样本收集、检疫和隔离中心。地理位置的流域人口参与这项研究估计超过1000万人。
源人口包括埃塞俄比亚东北部地区的社区。研究参与者选择使用一个简单的随机抽样技术从那些疑似COVID-19,曾接触过已知COVID-19情况下,急性呼吸道疾病的症状,他显然是健康人的埃塞俄比亚东北部地区的社区监测在研究期间。
标准化的检查表是用来获取信息的研究参与者与社会人口特征、临床和风险因素数据(
收集到的样本被放置在管架和存储在一个冷却箱保持2 - 8°C维持三包装过程。妥善包装口咽标本之后被运送到罗大学COVID-19实验室收集的网站。当有可能不可避免的延迟标本被测试在实验室里,标本保持冷藏2 - 8°C到正在处理。
约200
实时荧光聚合酶链反应(rt - pcr)工具包用于检测新型冠状病毒(COVID-19)。它是基于一个定性体外核酸扩增试验旨在检测ORF1ab基因COVID-19使用逆转录PCR结合荧光探测。引物和sequence-specific荧光探针设计量身定做的高COVID-19基因组保守的地区。探针是寡核苷酸连接荧光团的5′末端与家人记者和3′末端淬火。同时,特定的引物和探针开发作为内部参考的荧光团维克附加在5′末端的记者。后立即从−20°C存储、工具包内容彻底融化在环境温度除酶混合。约20
生成质量和可靠的数据,所有质量控制检查整个数据采集过程中进行。样本收集、运输协议和特殊安全措施提供必要的工作艾滋病研究设施在监控过程质量。此外,实验室化验都是由维护质量控制程序。标准操作程序(sop)严格遵守通过数据收集的所有方面包括标本收集、处理、测试和感染控制策略。没有模板控制(NTC),这是由nuclease-free水,是包含在每次运行监控试剂和RNA提取过程中系统的污染。
消极的控制和积极控制被用于每次运行验证样本处理、放大和检测步骤进行正确。执行病毒RNA基因组提取在二级生物安全柜(BSL-2)。消除污染,样品制备(BSC II, A2型)和放大仪器定期清洗消毒和清洁协议发现基于内部的操作手册。标准化的数据检查表检查其完整性和准确性。和数据清洗和双数据输入用于确保数据的质量。
数据输入Microsoft Excel和SPSS版本22日出口软件(美国IBM)和分析。综述了描述性统计的表和图。卡方检验的依赖和独立变量之间的关系。二元逻辑回归来显示每个变量与因变量的协会。此外,多元分析计算确定独立因素影响因变量的发生。水平的重要性设置为0.05 (
伦理批准获得的医学实验室科学,医学和健康科学学院罗大学。此外,从每个参与者获得知情同意或从父母/监护人为参与者不能同意。这项研究的目标是向参与者解释数据收集器。这项研究是根据表达的原则进行《赫尔辛基宣言》。研究参与者意识到关于流感大流行的威胁和被测试的重要性。参与者也被告知,阳性结果与区域和区域卫生办公室沟通,以便进一步追踪接触者积极的个人以及适当的管理积极的个人包括检疫、隔离,或关键病人护理已执行。
大约8752实验室检测人包括在这项研究在2020年7月1日和2020年8月31日之间。均值(±SD)研究参与者的年龄是31.6 (±13.6)。百分之六十(60%)的被调查者年龄之间的36和52年。性别比例是偏向男性。超过百分之五十(52.2%)的人永远生活在南罗区,几乎所有参与者都来自阿姆哈拉地区的不同部分(表状态
社会人口特征研究参与者在埃塞俄比亚的东北地区,2020年。
| 类别 | 个人(8752) |
|---|---|
| 年龄、年 | |
| 意思是(SD) | 31.6 (13.6) |
| 范围 | 1 - 104 |
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| 年龄段, |
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| 队 | 30 (0.4) |
| 19-35 | 862 (9.8) |
| 36-52 | 5236 (59.8) |
| 53 - 69 | 1880 (21.5) |
| 70 - 86 | 585 (6.7) |
| 87 - 104 | 159 (1.9) |
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| 性, |
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| 男性 | 5568 (63.6) |
| 女 | 3184 (36.4) |
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| 民族起源 | |
| 埃塞俄比亚 | 8747 (99.9) |
| 其他(中国、阿曼和台湾) | 5 (0.1) |
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| 永久居留权(地区) | |
| 阿姆哈拉 | 8728 (99.7) |
| 阿法尔 | 19日(0.2) |
| 其他(亚的斯亚贝巴,Benishangul-Gumuz) | 5 (0.1) |
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| 永久居留权(区) | |
| 南罗 | 4572 (52.2) |
| Dessie镇 | 1175 (13.4) |
| Oromia特区 | 1893 (21.6) |
| 摇Hemra | 980 (11.2) |
| 其他(北罗,昭和,Gojam、贡德尔和远处) | 132 (1.5) |
实验室确诊COVID-19感染人数是高年龄段的男性和36-52几年,但感染个体中更普遍在87 - 104年的年龄类别(5%)。33个研究参与者有旅行史的邻国,吉布提,但所有人都为COVID-19感染阴性。的总COVID-19筛选参与者,大多数社区的阳性病例监测占据2.2%。233/291 COVID-19感染被发现在研究期间的最后一个季度,占绝大多数(2.7%)的总感染率3.3%(表
COVID-19感染的患病率研究参与者在埃塞俄比亚的东北地区,2020年。
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积极的 | 负 |
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|---|---|---|---|---|
| 性 | ||||
| 女 | 97 (1.1) | 97 (3.0) | 3087 (97.0) | 0.272 |
| 男性 | 194 (2.2) | 194 (3.5) | 5374 (96.5) | |
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| 年龄、年 | ||||
| 1-35 | 27日(0.31) | 27日(2.7) | 965 (97.3) | 0.053 |
| 36-52 | 174 (2.0) | 174 (3.3) | 5062 (96.7) | |
| 53 - 69 | 60 (0.7) | 60 (3.2) | 1820 (96.8) | |
| 70 - 86 | 22日(0.3) | 22日(3.8) | 563 (96.2) | |
| 87 - 104 | 8 (0.1) | 8 (5.0) | 151 (95) | |
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| 时间的筛选 | ||||
| 2020年7月1日7月15日 | 0 (0) | 0 (0) | 179 (100) | < 0.005 |
| 2020年7月16日7月31日 | 8 (0.1) | 8 (1.1) | 717 (98.9) | |
| 2020年8月1日8月15日 | 50 (0.6) | 50 (2.1) | 2352 (97.9) | |
| 2020年8月16日8月31日 | 233 (2.7) | 233 (4.3) | 5213 (95.7) | |
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| 旅游的历史 | ||||
| 是的(吉布提) | 33 (0.4) | 0 | 33 (100) | 0.286 |
| 没有 | 291 (3.3) | 291 (3.3) | 8428 (96.7) | |
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| 个人分类测试 | ||||
| 新 | 256 (2.9) | 256 (3.0) | 8310 (97.0) | < 0.005 |
| 后续 | 35 (0.4) | 35 (18.8) | 151 (81.2) | |
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| 原因测试(新测试和后续) | ||||
| 社区监测 | 189 (2.2) | 189 (2.7) | 6808 (97.3) | < 0.005 |
| 怀疑 | 37 (0.4) | 37 (3.9) | 919 (96.1) | |
| 联系 | 28日(0.3) | 28日(5.1) | 516 (94.9) | |
| 医疗机构调查 | 2 (0.1) | 2 (2.9) | 67 (97.1) | |
| 后续 | 35 (0.4) | 35 (18.8) | 151 (81.2) | |
COVID-19感染开始越来越流行在研究期间的第四周,从7月24日到7月31日,2020年,在过去两周患病率达到顶峰。没有发现阳性病例在前三周的大规模测试期间COVID-19感染。然而在4到6周,积极性的感染率是男性高于女性研究参与者。女性研究对象,另一方面,COVID-19感染有较高的患病率比男性在过去两周(图
埃塞俄比亚COVID-19感染的趋势在东北地区从7月1日至8月31日,2020年。
下表
埃塞俄比亚COVID-19感染的趋势在东北地区从7月1日2020年8月31日,2020年,每周不同变量(
| 参数 | 星期1 | 星期2 | 星期3 | 星期4 | 星期5 | 第6周 | 星期7 | 第八周 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 年龄、年 | |||||||||
| 1-35 | 负 | 48 (0.8) | 54 (0.9) | 186 (3.1) | 386 (6.5) | 521 (8.8) | 1317 (22.2) | 2508 (42.3) | 907 (15.3) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 6 (3.0) | 17 (8.5) | 20 (10) | 104 (51.7) | 54 (26.9) | |
| 36-52 | 负 | 14 (0.7) | 14 (0.7) | 21日(1.1) | 124 (6.8) | 108 (5.9) | 330 (18.1) | 819 (45.0) | 390 (21.4) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (1.7) | 3 (5.0) | 5 (8.3) | 29 (48.3) | 22日(36.7) | |
| 53 - 69 | 负 | 6 (1.0) | 9 (1.5) | 2 (0.3) | 25 (4.4) | 29 (5.0) | 79 (14.0) | 243 (43.2) | 170 (30.2) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (4.5) | 0 (0) | 3 (13.6) | 9 (40.9) | 9 (40.9) | |
| 70 - 86 | 负 | 2 (1.3) | 4 (2.7) | 0 (0) | 1 (0.7) | 8 (5.4) | 28日(19.6) | 52 (36.4) | 48 (33.6) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (16.7) | 4 (66.7) | 1 (16.7) | |
| 87 - 104 | 负 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (12.5) | 2 (25.0) | 5 (62.5) | 0 (0) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50.0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50.0) | |
|
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|||||||||
| 永久居留权的区 | |||||||||
| Dessie镇 | 负 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 28日(2.5) | 527 (46.9) | 668 (50.6) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (5.8) | 9 (17.3) | 40 (76.9) | |
| 南罗 | 负 | 47 (1.0) | 42 (0.9) | 189 (4.2) | 352 (7.9) | 487 (10.9) | 1147 (25.7) | 1723 (38.6) | 473 (10.6) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (1.8) | 15 (13.4) | 8 (7.1) | 73 (65.2) | 14 (12.5) | |
| Oromia区 | 负 | 5 (0.3) | 10 (0.6) | 20 (1.1) | 88 (4.9) | 119 (6.6) | 201 (10.5) | 947 (52.6) | 422 (23.4) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 3 (3.3) | 6 (6.5) | 11 (12.0) | 42 (45.7) | 30 (32.6) | |
| 摇Hemra | 负 | 18 (1.8) | 29 (3.0) | 0 (0.0) | 83 (8.7) | 61 (6.2) | 388 (40.6) | 373 (39.0) | 4 (0.4) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (4.2) | 0 (0) | 7 (29.2) | 16 (66.7) | 0 (0) | |
| 其他人 | 负 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 13 (10.7) | 0 (0) | 3 (2.5) | 57 (47.1) | 48 (39.7) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (18.2) | 0 (0) | 0 (0) | 6 (54.5) | 3 (27.3) | |
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|||||||||
| 分类COVID-19筛查的研究对象 | |||||||||
| 新 | 负 | 70 (0.8) | 80 (1.0) | 209 (2.5) | 536 (6.5) | 667 (8.0) | 1708 (20.6) | 3564 (42.9) | 1476 (17.8) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 8 (3.1) | 21日(8.2) | 28日(10.9) | 132 (51.6) | 67 (26.2) | |
| 后续 | 负 | 0 (0) | 1 (0.7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 48 (31.8) | 63 (41.7) | 39 (25.8) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (2.9) | 14 (40.0) | 20 (57.1) | |
|
|
|||||||||
| 测试的原因 | |||||||||
| 社区监测 | 负 | 10 (0.1) | 25 (0.4) | 63 (0.9) | 394 (5.8) | 546 (8.0) | 1618 (23.8) | 3182 (46.7) | 970 (14.2) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 6 (3.2) | 9 (4.8) | 19日(10.1) | 108 (57.1) | 47 (24.9) | |
| 怀疑 | 负 | 24 (2.5) | 41 (4.3) | 146 (15.3) | 29 (3.0) | 61 (6.6) | 28日(3.0) | 275 (29.9) | 315 (34.3) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 6 (16.2) | 9 (24.3) | 14 (37.8) | 8 (21.6) | |
| 联系 | 负 | 36 (7.0) | 14 (2.7) | 0 (0) | 46 (8.9) | 60 (11.6) | 62 (12.0) | 107 (20.7) | 191 (37.0) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 6 (21.4) | 0 (0) | 10 (35.7) | 12 (42.9) | |
| 医疗机构调查 | 负 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 69 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
| 后续 | 负 | 0 (0) | 1 (0.7) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 49 (31.8) | 63 (41.7) | 39 (25.8) |
| 积极的 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (2.9) | 14 (40.0) | 20 (57.1) | |
除了性别参数,其余的变量在当前的研究中被发现有显著关联的实验室测试结果COVID-19筛选。87 - 104岁的参与者是6倍(AOR = 6.03, 95% CI -30.4 = 1.19,
COVID-19感染及相关因素研究参与者在埃塞俄比亚的东北地区,2020年。
| 积极的 | 负 | 软木(95%置信区间) |
|
优势(95%置信区间) |
|
|
|---|---|---|---|---|---|---|
| 性 | ||||||
| 女 | 97 (3.0) | 3087 (97.0) | 1.00 | 1.00 | ||
| 男性 | 194 (3.5) | 5374 (96.5) | 1.15 (0.9 - -1.47) | 0.272 | 1.17 (0.91 - -1.50) | 0.230 |
|
|
||||||
| 年龄、年 | ||||||
| 1-35 | 27日(2.7) | 965 (97.3) | 1.00 | 1.00 | ||
| 36-52 | 174 (3.3) | 5062 (96.7) | 0.14 (0.03 - -0.64) | 0.012 | 1.02 (0.76 - -1.38) | 0.871 |
| 53 - 69 | 60 (3.2) | 1820 (96.8) | 0.13 (0.03 - -0.63) | 0.011 | 1.19 (0.75 - -1.87) | 0.466 |
| 70 - 86 | 22日(3.8) | 563 (96.2) | 0.16 (0.03 - -0.78) | 0.024 | 1.15 (0.49 - -2.67) | 0.749 |
| 87 - 104 | 8 (5.0) | 151 (95) | 0.17 (0.03 - -0.97) | 0.046 | 6.03 (1.19 - -30.4) | 0.030 |
|
|
||||||
| 永久居留权的区 | ||||||
| Dessie镇 | 52 (4.4) | 1123 (95.6) | 1.00 | 1.00 | ||
| 南罗 | 112 (2.4) | 4460 (97.6) | 0.54 (0.39 - -0.76) | < 0.005 | 0.56 (0.39 - -0.79) | 0.001 |
| 特区的Oromia | 92 (4.9) | 1801 (95.1) | 1.10 (0.779 - -1.56) | 0.580 | 0.98 (0.68 - -1.41) | 0.92 |
| 摇Hemra | 24 (2.4) | 956 (97.6) | 0.54 (0.33 - -0.87) | 0.015 | 0.59 (0.36 - -0.99) | 0.044 |
| 其他人 | 11 (8.3) | 121 (91.7) | 1.96 (0.998 - -3.86) | 0.051 | 2.03 (1.03 - -3.99) | 0.041 |
|
|
||||||
| 分类COVID-19筛查的研究对象 | ||||||
| 新 | 256 (3.0) | 8310 (97.0) | 7.52 (5.1 - -11.1) | < 0.005 | 7.63 (5.07 - -11.5) | < 0.005 |
| 后续 | 35 (18.8) | 151 (81.2) | 1.00 | 1.00 | ||
|
|
||||||
| 测试的原因 | ||||||
| 社区监测 | 189 (2.7) | 6808 (97.3) | 1.00 | 1.00 | ||
| 怀疑 | 17 (3.9) | 919 (96.1) | 1.45 (1.01 - -2.08) | 0.042 | 1.38 (0.33 - -5.7) | 0.657 |
| 联系 | 28日(5.1) | 516 (94.9) | 1.96 (1.3 - -2.94) | 0.001 | 1.65 (1.09 - -2.51) | 0.018 |
| 医疗机构调查 | 2 (2.9) | 67 (97.1) | 1.07 (0.26 - -4.42) | 0.920 | ||
| 后续 | 35 (18.8) | 151 (81.2) | 8.35 (5.62 - -12.4) | < 0.005 | 1.32 (0.91 - -1.90) | 0.145 |
在目前的以社区为基础的横断面研究从7月1日到2020年8月31日,共有8752名研究参与者都参与其中。总研究参与者,291(3.3%)被发现感染了病毒的总患病率为3.3%,这是符合Ataye医疗机构研究,东北埃塞俄比亚(3.3%)(
在当前的研究中,感染的速度显示增加的时间。没有任何实验室确诊阳性病例的第一个15天研究期间(2020年7月1 - 15日),然后,它达到了1.1%,2.1%,4.3%,第二,第三,第四15天,分别。这一发现不一致在冰岛人口筛查报告感染参与者的比例保持稳定在检查期间在中国(
在巴基斯坦进行的一项研究报告说,男性研究参与者,85(70.25%),比女性更大流行的影响和36例(29.8%)观察到显著差异(
COVID-19的患病率增加跨年龄类别在目前的研究。其患病率研究参与者中年龄类别1-35年,36-52年53 - 69年,70 - 86年和87 - 104年27岁(2.7%)、174年(3.3%),60例(3.2%),22(3.8%),8例(5.0%),分别为。同样,老年研究参与者被发现更受COVID-19,和积极性率被发现高
总数的研究参与者,33(0.38%)有从吉布提,但是没有一个被发现被确认的(积极的)COVID-19病例。第一个确诊病例在吉布提是2020年3月18日报道;确诊病例的总数在这个国家截至2020年4月18日是732年,虽然只有96在埃塞俄比亚(
COVID-19确诊病例的数量在新诊断个人,256(2.9%),高于研究参与者在后续,35 (0.4%)。这可能表明一个不好的印象,病毒已经在我们的测试区域的社区传播,也可能表明一个好的回收率的已知阳性病例。类似的场景发生在一个研究在吉布提很少数量的主要情况下能够传播病毒大量的社区成员
四集水区研究在当前研究Dessie镇南罗区,Oromia特区,摇Hemra区。研究参与者的永久居留权是外面这些集水区和提供样品的四个领域被认为有一个城际旅行史。因此,研究参与者的关系永久居留权Dessie镇收购COVID-19感染的可能性高出2倍以上研究参与者之间的城际旅游历史(优势比= 2.03,95% CI -3.99 = 1.03,
这个监测进行了检查流行病的传播模式在社区中疑似病例,在那些有一个接触历史,那些工作在不同的设施,以及后续情况。在当前的研究中,那些被医生怀疑发展COVID-19感染没有显著关联的积极性。由于相似的症状和体征COVID-19肺炎和其他类型的呼吸道疾病,医生(医生)可以怀疑个人与其他COVID-19感染发病率和送他们的标本进行实验室确认。在目前的研究中,有一个历史的接触COVID-19确诊病例获得感染的机率要高出1.65倍。检疫的病人、密切接触似乎是与减少COVID-19在中国传播。相反,如果接触的主要情况下与未感染的个体无法控制,感染的传播将是最重要的。这个事实可以支持的一项研究在吉布提的主要情况下仅为2%,而研究参与者之间的感染率是实质性的接触史
COVID-19感染的流行的趋势在东北部地区,配合测试产能的扩张。病毒被发现的患病率明显高于在个人,一根一根的拔掉城际旅客,那些接触/临床怀疑COVID-19确认。然而,其患病率显著低相对semiurban或密度较低地区的调查。尽管埃塞俄比亚已经采取了一些措施来检测、管理和控制COVID-19的传播,需要更多的努力来扩大测试能力,带来社区的行为变化为了阻止疫情的传播。国家需要制定替代选项来减轻干扰的基本医疗服务和科学研究的重大影响。
本研究采用横断面研究设计,不能得出结论关于因果关系和替代解释这些发现。临床和风险因素的数据并不包括在这项研究。此外,本研究未涉及分子水平上的确诊病例的病毒核酸序列数据也没有包括血液和临床化学参数。
使用的数据来支持本研究的结果包括在本文中。
作者宣称没有利益冲突。
作者想表达他们的感谢卫生部埃塞俄比亚公共卫生机构(EPHI)和罗大学的金融、材料和设备支持这项研究工作。作者特别感谢尤纳Erkihun, Minilik Yitna, Zewdu Mulatie, Fetiya Ahmed Temesgen Fiseha, Hussen Ebrahim,黛米·贝克勒,Aderaw达姆,Yeabsira Asmare, Mihreteab Alebachew, Saleamlak Sebsibe, Mihret Tilahun Habtiye Bisetegn, Habtu Debash,奥斯曼阿卜杜勒,Yeshimebet卡萨岛的专业贡献分析口咽样品在实验室。