水生生态系统在热带森林具有较高的微生物的多样性,包括真菌、重要的分解者的水下木头。尽管分解其角色的重要性,研究有关淡水真菌的多样性从巴西亚马逊环境稀缺。这项工作的目的是描述组成和真菌的多样性呈现在巴西亚马逊河的两个湖泊水下木材(Para状态)。腐烂的木头的碎片(30样品/湖)从湖泊Jua和Maica收集。木材样本检查6个月的真菌生殖结构。真菌中观察到的木材被确定形态。23类群被确定在湖里Jua性和13无性(10)和26个类群在湖里Maica(17性,9无性)。其序列得到14类群来帮助识别。在湖泊Jua和Maica,多样性指数H: 2.6514和H: 2.8174,分别。Sørensen指数的真菌群落研究湖泊是0.3673。 This study is the first to describe the fungal biodiversity of two important aquatic environments in Pará, Brazil.
淡水真菌包括物种栖息在水的全部或部分生命周期或任何物种适应殖民主要水生或半水生基质性质(
淡水真菌的子囊菌是一组已知积极参与淹没伍迪碎片的分解
亚马逊盆地可以说是地球上最复杂的网络水生栖息地(
水下样品收集木材Jua湖(2′25°57”年代,54°46′39”W)和湖Maica(2°27′29.0”年代,54°40′10.8”W),从本质上讲,低的湾Tapajos和亚马逊河流,分别。湖Jua接收水从流和Tapajos下水道。湖Maica表面流域和白色的水的亚马逊河
地图的位置湖泊Jua和Maica属于低的盆地Tapajos河,圣塔伦,巴西帕拉(来源:利马,j . L)。
收集网站Jua湖(a)。收集网站Maica湖(b)。木材样品(c)。Ascomata木材表面(d)。水的子囊Dothideomycetes sp (e)。殖民地MEA 14天后在25°c (f)。文化PYG琼脂(g)。
物理化学变量测量使用ProfiLine 197我WTW多参数探测(Wellheim,德国)。温度(°C)、pH、电导率(
一个集合是在每个位置Jua湖2017年10月和2017年11月在Maica湖。在每个站点上,30淹没木头碎片显示收集活动分解的迹象。样品的长度范围从6 - 22厘米,直径范围从6到15厘米(图
每十天,六个月,Stemi DV4立体显微镜(蔡司)被用来寻找真菌结构上收集到的木材样品。被发现的结构与解剖针,包含蒸馏水的显微镜载玻片。性子囊菌的鉴定进行了基于微观形态学ascomata, hamathecium,子囊,子囊孢子使用Axioskop 40显微镜(蔡司)如前所述
根据协议执行DNA提取的费雷尔et al。
分子测序rDNA其地区收集的数据是根据程序的白色et al。
测序反应都使用了BigDye®工具(应用生物系统公司)。基因测序进行3130年Seq分析仪(应用生物系统公司)。在这项研究中使用的序列比较和数据库(表存入基因库
病毒代码和相似性(条形码)14类群隔绝淹没木材样品收集在湖泊Jua Maica,圣塔伦,对位,巴西。
| 代码/基因库 | 分类单元 | 加入不。 | 相似度(%) |
|---|---|---|---|
| MT017512 |
|
KJ653823.1 | One hundred. |
| MT017513 |
|
MF038179.1 | 99.15 |
| MT017519 |
|
MF038179.1 | One hundred. |
| MT017518 |
|
NR_158448.1 | 97.15 |
| MT017514 |
|
MN826823.1 | 97.84 |
| MT017515 |
|
NR_164383.1 | 91.3 |
| MT017516 |
|
KT823783.1 | 90.46 |
| MT017517 |
|
EU770223.1 | 90.32 |
| MT017520 |
|
GU827483.1 | 99.41 |
| MT017523 |
|
MH857954.1 | 98.34 |
| MT017524 |
|
JN882257.1 | 99.12 |
| MT017525 |
|
KP637162.1 | 90.02 |
| MT017522 |
|
NR_111278.1 | 99.46 |
| MT017521 | Calosphaeriales sp。 | KR817246.1 | 99.04 |
个人决定的数量为每个块木头一个物种的存在与否。在这项研究中,一个人是量化per-substrate基础上。一个人是计算被发现在一个木头。然而,多个分类单元通常是发现在单独的基板。频率、丰富(物种数量),α多样性(
此外,解释Shannon-Weaver指数、均匀度指数(
评估不同的真菌群落,样本之间的相似性计算使用Sørensen指数(
为了确定样本量是否足够描述集合地点的多样性,累积曲线的类群样本中发现以下两个湖泊水下木材分解的研究分析了新分类群的数量之间的比例和数量的木材样品。
为了描述水生环境在这项研究中,理化分析湖泊Jua和Maica水域进行抽样时木材样品。表
表征湖泊的水的物理化学参数Jua Maica,圣塔伦,对位,巴西,在集合。
| 参数 | 湖Jua | 湖Maica |
|---|---|---|
| pH值 | 4.9±0.2 | 6.7±0.2 |
| 电导率( |
9.3±0.2 | 42±0.2 |
| 水温(°C) | 30±0.1 | 30±0.1 |
| 总啊,2(毫克/升) | 7.8±0.1 | 6.5±0.1 |
| 浊度(南大) | 30±0.1 | 26.9±0.1 |
积累曲线获得的样本湖泊Jua和Maica表明类群的数量不渐近线,充分表明我们没有了淡水真菌物种(图
累积曲线真菌类群的数量发现与抽样努力收集水下的碎片分解木材的湖泊Jua Maica,圣塔伦,对位,巴西。
形态,确定了23种不同类群Jua湖,与43.5% (
频率的类群中观察到的样本淹没在湖泊Jua和Maica木材收集,圣塔伦,对位,巴西。
| 分类单元 | 湖Jua | 湖Maica | ||
|---|---|---|---|---|
| 工厂 | FRE (%) | 工厂 | FRE (%) | |
|
|
18 | 15 | 0 | 0 |
|
|
13 | 11 | 0 | 0 |
| Teratosphaeriaceae MT017515 |
11 | 9 | 0 | 0 |
| Pleosporaceae MT017518 |
11 | 9 | 0 | 0 |
|
|
11 | 9 | 0 | 0 |
|
|
9 | 7 | 1 | 1 |
|
|
7 | 6 | 0 | 0 |
|
|
7 | 6 | 0 | 0 |
|
|
5 | 4 | 5 | 6 |
|
|
4 | 3 | 0 | 0 |
|
|
4 | 3 | 0 | 0 |
|
|
3 | 2 | 6 | 7 |
|
|
3 | 2 | 2 | 2 |
| Morosphaeriaceae MT017525 |
2 | 2 | 6 | 7 |
| Microascaceae MT017512 |
2 | 2 | 0 | 0 |
| Diaporthales sp.1 MT017516;MT017517 |
2 | 2 | 0 | 0 |
|
|
2 | 2 | 0 | 0 |
|
|
2 | 2 | 0 | 0 |
| 身份不明的Pleosporales 3 | 1 | 1 | 5 | 6 |
|
|
1 | 1 | 1 | 1 |
|
|
1 | 1 | 0 | 0 |
|
|
1 | 1 | 1 | 1 |
|
|
1 | 1 | 0 | 0 |
| Dothideomycetes sp。 | 0 | 0 | 3 | 4 |
| Dothideomycetes sp.1 | 0 | 0 | 3 | 4 |
|
|
0 | 0 | 9 | 11 |
|
|
0 | 0 | 7 | 8 |
|
|
0 | 0 | 6 | 7 |
|
|
0 | 0 | 5 | 6 |
| Savoryellales sp。 | 0 | 0 | 3 | 4 |
|
|
0 | 0 | 2 | 2 |
|
|
0 | 0 | 2 | 2 |
| Annulatascaceae-like sp。 | 0 | 0 | 2 | 2 |
|
|
0 | 0 | 2 | 2 |
| Sordariomycetes sp。MT017521 |
0 | 0 | 2 | 2 |
| Nectriaceae sp。MT017520 |
0 | 0 | 2 | 2 |
| Cladosporiaceae MT017514 |
0 | 0 | 2 | 2 |
| Nectriaceae MT017524 |
0 | 0 | 1 | 1 |
|
|
0 | 0 | 2 | 2 |
|
|
0 | 0 | 1 | 1 |
|
|
0 | 0 | 3 | 4 |
| 总 | 121年 | One hundred. | 84年 | One hundred. |
在湖里Jua多样性(
多样性的比较(指数:
| 抽样 | 2017年10月Jua湖 | 2017年11月Maica湖 |
|---|---|---|
| 样本大小 | 30. | 30. |
| 子囊菌(性) | 51 | 67年 |
| 数量的子囊菌(无性繁殖) | 70年 | 14 |
| 平均每个样本的类群数 | 4.0 | 2。8 |
| 单分类单元 | 15 | 18 |
| 重叠的湖泊 | 8 | |
| 五种最常见的分类单元 |
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|
|
||
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|
||
| Pleosporaceae MT017518 11 (9%) |
|
|
|
|
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| Teratosphaeriaceae MT017515 11 (9%) | Morosphaeriaceae MT017525 6 (7%) | |
| 物种丰富度( |
23 | 26 |
| Shannon-Weaver ( |
2.65 | 2.82 |
| 均匀度( |
0.616255 | 0.643588 |
| Sørensen ( |
0.3673 |
在目前的研究中,我们描述了真菌多样性与木材分解的湖泊属于Tapajos河(PA、巴西)。这是一个重要的研究,因为它是第一次描述的这些生物多样性Tapajos河地区的湖泊。在实验条件下,湖泊呈现多样性和高一些类群之间的相似性。
湖Jua pH值很低(4.9±0.2)和低导电率(9.3±0.2
收集后的累积曲线显示近似稳定20到25样品从每个湖(分别Jua和Maica)进行了研究。罗等。
在湖泊Jua和Maica,我们观察到23和26个类群,分别。独特的类群的数量是15和18湖泊Jua Maica,分别(表
湖Jua呈现更丰富的无性繁殖的真菌(56.5%)和Maica性真菌(65.4%)。Jua湖,这可能与一个流,流入的影响这个环境中,支持这个湖里分类单元的增加(
五个最常见类群在湖里Jua
湖泊Jua和Maica提出了多样性指数H′= 2.65和2.82,分别。胡锦涛et al。(
Sørensen相似性指数(0.3673)显示低相似性研究湖泊之一。这可能是由于研究中发现的结构和物理化学差异负责真菌界在水生生态系统的组成
研究真菌分解淹没了木材在水生环境中缺乏亚马逊地区。因此,目前的工作是积极为水生真菌的多样性的知识在这一地区。结果表明,有一个富人和平衡的多样性。本研究提供更多的洞察淡水真菌的动态清水栖息地和表明社区是如何分布在亚马逊的湖泊。值得注意的是这方面的研究还需要进一步的研究来加强和增加信息生物地理学、生态学、淡水和分类法子囊菌纲物种在巴西亚马逊河。
使用的数据来支持本研究的发现可以从相应的作者。
作者宣称没有利益冲突。
作者要感谢大学联邦Oeste Para-UFOPA做和Laboratorio de Micologia /西班牙德尽管da Amazonia-INPA提供实验室设备。Laboratorio de Tecnologias de DNA-UFAM DNA测序样品负责。我们感谢卡洛斯·伊万Vildoso博士和教授Huzefa拉贾的协作。这项研究的部分资金由Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de含量Superior-Brasil(披肩)(财务代码001 d)。