DM 疾病标记 1875 - 8630 0278 - 0240 Hindawi 10.1155 / 2020/6723487 6723487 研究文章 联系lncRNA GAS5、MEG3 PCAT-1多态性和癌症风险:一个荟萃分析 https://orcid.org/0000 - 0001 - 7610 - 3119 越南盾 小燕 1 高 闻堰 2 https://orcid.org/0000 - 0002 - 5883 - 3094 LV 小玲 3 https://orcid.org/0000 - 0002 - 7759 - 0219 王 亚真 3 https://orcid.org/0000 - 0002 - 3205 - 2222 吴 清 3 https://orcid.org/0000 - 0001 - 9559 - 2640 杨 Zhouxin 3 https://orcid.org/0000 - 0001 - 7061 - 4479 毛 Genxiang 3 https://orcid.org/0000 - 0003 - 3980 - 2011 兴 Wenmin 3 Kosmas Ioannis 1 药学和医学药店 姜愫护理学院 Huian 223003年 中国 jscn.edu.cn 2 研究所的药物学 浙江医学科学院 杭州310013 中国 zjams.com.cn 3 浙江省老年病学的重点实验室 美国老年病学 浙江医院 杭州310013 中国 zjhospital.com.cn 2020年 28 3 2020年 2020年 27 06 2019年 15 10 2019年 28 11 2019年 28 3 2020年 2020年 版权©2020晓燕盾等。 这是一个开放的文章在知识共享归属许可下发布的,它允许无限制的使用,分布和繁殖在任何媒介,提供最初的工作是正确的引用。

目的。长非编码rna (lncRNAs)已被广泛研究,和单核苷酸多态性(snp) lncRNAs被认为是影响癌症易感性的遗传因素。的lncRNA GAS5、MEG3 PCAT-1多态性是可能与癌症风险有关。本荟萃分析的目的是系统地评估这个协会。 方法。研究选择PubMed、网络科学、Embase,谷歌学者,Cochrane图书馆、中国国家知识基础设施(CNKI),和中国生物医学文献数据库(CBM)通过包含和排除标准。优势比(ORs)和95%置信区间(CIs)用的随机影响模型计算或固定后果模型来评估lncRNA多态性和癌症易感性之间的关系。Metaregression和发表偏倚分析也同时进行。所有使用占据12.0软件分析。 结果。十六岁的文章(包括13750例和17194例对照)包含在这个荟萃分析。一个重要SNP rs145204276和观察胃癌风险之间的联系( 德尔与ins: 或 = 0.79 , 95年 % CI = 0.72 量 0.86 ; 德尔德尔与ins / ins + del / ins: 或 = 0.74 , 95年 % CI = 0.59 量 0.91 ; 德尔/ ins与ins / ins: 或 = 0.84 , 95年 % CI = 0.67 量 1.05 )。观察rs16901904,降低癌症风险三个基因模型( C与T: 或 = 0.79 , 95年 % CI = 0.70 量 0.90 ; CC与CT + TT: 或 = 0.49 , 95年 % CI = 0.37 量 0.65 ; CC和TT: 或 = 0.49 , 95年 % CI = 0.37 量 0.66 )。没有发现统计学意义在metaregression分析。包括所有的单核苷酸多态性,没有发表偏倚在所有基因型模型被发现。 结论。的rs145204276 SNP lncRNA GAS5可能与胃癌风险有关,而rs16901904 SNP在lncRNA PCAT-1熊与降低患癌症的风险。

 浙江省科技项目 2017年zb002 卫生局的浙江省 2017年ky189 2017年ky188 2019年rc093 2019年ky263 2019年rc091 2019年ky257 2015年kya001 2015年dta001 wkj2011 - 2 - 014 浙江省自然科学基金 LQ16H020006 LY16H20002 浙江省科学技术厅 2016年c34002 中国国家自然科学基金 31702144 31700307 31201040 81771520 1。介绍

癌症已经成为全世界范围内导致死亡的首要原因不仅在高收入也在中等收入国家( 1, 2]。由于人口老龄化的发展,在很多国家癌症负担扩大;大约有1810万2018年[新癌症病例和960万例癌症死亡 3]。许多研究人员花了许多努力降低癌症死亡率和发病率。例如,在临床治疗,手术切除是一种有效的局部治疗肿瘤,但是这种疾病仍然可以表现出潜在的地区或远处转移,或高电阻对传统的化疗和放疗。因此,研究人员关注潜在的癌症发展的分子生物学机制,如基因生物标记物可以用作癌症患者预后因素( 4]。

高通量测序技术发现了大量的非编码rna基因组中,可分为小(18 - 200元)和长期(200元> 100 kb)非编码rna (lncRNAs) [ 5]。尽管lncRNAs曾经被视为“转录噪音”或“暗物质”基因组异常表达lncRNAs几乎在癌症发病机理中起着至关重要的作用,如癌症启动、进展、转移( 6]。研究表明,遗传变异也扮演了重要的角色在许多类型的癌症的发展。单核苷酸多态性(SNPs),常见的遗传变异,出现在lncRNAs被发现能够影响到结构、表达水平、功能lncRNAs通过干扰相应目标mrna ( 7]。证据表明在lncRNA基因单核苷酸多态性与多种疾病的发生有关,特别是癌症( 8]。因此,lncRNA多态性被认为是潜在的癌症易感性相关的机制。

最近,研究显示,GAS5超表达可以抑制肝癌细胞的入侵能力影响epithelial-mesenchymal过渡(EMT)过程,这是非常重要的在早期肿瘤细胞的转移性传播的事件,可以使细胞更加活跃和入侵 9]。同时,结直肠癌(CRC)细胞生长和集落形成也抑制诱导的细胞周期G0 / G1逮捕和细胞凋亡 10),增加casp9 mRNA和pho-Casp9蛋白质和减少extracellular-regulated蛋白激酶(ERK) Casp3 mRNA, p-Akt, p-ERK, pho-Casp3蛋白质( 11]。GAS5表达的差别但是,对这些YBX1加速损耗的蛋白质和p21的表达减少,从而消除G1逮捕控制胃癌扩散( 12]。一双功能底(AGGCA / -)插入/删除(indel)多态性(rs145204276)存在于启动子区域lncRNA增长arrest-specific 5 (lncRNA GAS5)一直在研究多种癌症类型( 13- - - - - - 23]。删除(del)等位基因似乎增强基因转录活动相比,一个插入(ins)等位基因 15]。郑等人进行了两级,病例对照研究探讨关联lncRNA GAS5多态性(rs145204276)和CRC的风险,和结果表明,rs145204276 del等位基因的CRC的风险大大降低21% ( 21]。然而,logistic回归分析显示,删除等位基因的rs145204276显著增加肝细胞癌(HCC)的风险在两个独立的情况下控制集(1034肝癌和1054名对照)( 18]。

此外,lncRNAs如GAS5、段H19 MEG3,和TUSC7致癌或肿瘤抑制作用与肿瘤抑制蛋白P53或相关肿瘤蛋白原癌基因,分别为( 24]。Balci等人发现PCAT-1 ANRIL,段H19可以抑制胶质母细胞瘤(GBM)细胞增殖,入侵和迁移。相反,在本研究显示肿瘤恶化主要肿瘤的特点是增加MEG3和热空气表达水平 25]。snp lncRNA前列腺癌症相关的lncRNA成绩单1 (PCAT-1),如rs1902432 rs16901904, rs4871771,和rs710886,也一直在研究癌症发展( 26- - - - - - 28]。元等人调查之间的关系lncRNA PCAT-1 rs1902432, rs16901904, rs4871771, rs710886和中国人口患前列腺癌的风险,但只有rs1902432被发现与前列腺癌的风险增加相关 28]。相比之下,没有联系lncRNA PCAT-1 rs1902432两级和膀胱癌,病例对照研究由林et al。 27]。同样,公布的结果之间的关系lncRNA母亲般地表达基因3 (lncRNA MEG3)多态性和癌症的风险也不同 29日- - - - - - 32]。因此,我们进行了一项荟萃分析,以总结所有符合条件的研究和评估总体癌症风险之间的关系和lncRNA (GAS5、PCAT-1 MEG3)多态性。

 2。材料和方法 2.1。搜索策略

两个独立调查人员进行电子文献检索(4月20日之前,2019年出版)使用PubMed、网络科学、Embase,谷歌学者,Cochrane图书馆、中国国家知识基础设施(CNKI),和中国生物医学文献数据库(CBM)。限制在出版语言被选为英语和中文。在我们的搜索过程中,使用以下关键词:“lncRNA GAS5,”“lncRNA MEG3,”“lncRNA PCAT-1,”“多态”,“单核苷酸多态性,”“基因变异,”“癌症”,“肿瘤”,“癌”,和“恶性肿瘤,肿瘤。“所有显然无关的研究案例报告和评论文章等被排除在外。相关研究中所引用的评论文章也手动寻找额外的符合条件的研究。

 2.2。研究选择

两位研究者独立评估确定文章的标题和摘要来决定他们是否符合研究的标准。差异解决的共识。横向和纵向研究单核苷酸多态性的关系lncRNAs GAS5, MEG3,包括PCAT-1和癌症的风险。在这个荟萃分析中研究只有当他们满足下列标准:(1)单核苷酸多态性的研究评估协会lncRNAs GAS5, MEG3, PCAT-1与癌症风险;(2)研究发表在中文或英文语言;(3)研究了原始病例对照设计或者是cohort-designed研究人类;(4)基础研究提供足够的数据来估计口服补液盐CIs 95%;(5)基因型的频率控制受试者按照哈迪温伯格平衡(HWE);(6)所有癌症病例在任何阶段的病理诊断,但只能参与原发性肿瘤。如果有一个平行的出版物,我们选择研究与一个更大的样本量。

研究被排除在外,如果(1)他们没有病例对照研究;(2)案例报告,评论,荟萃分析,或评论文章;(3)他们先前的研究重复;(4)他们不符合HWE的对照组;(5)基因分型结果没有足够的数据来计算口服补液盐和独联体95%;(6)细胞系和基因表达的研究。如果只有一个研究调查一个特定lncRNA基因不适合荟萃分析,也排除在外。此外,当研究人员没有报告关于每组基因型分布的详细信息,相应的研究的作者为未发表的数据联系。

 2.3。数据提取

由两位研究者独立执行数据提取,包括以下信息从每个研究:第一作者,出版,种族,癌症类型,来源控制,病例数和控制,基因型的分布情况和控制,基因分型方法 P 价值的HWE控制。任何矛盾都解决了三分之一的研究员,直到达成共识。

 2.4。统计分析

目前的荟萃分析调查之间的关系lncRNA GAS5, lncRNA MEG3,和lncRNA PCAT-1 SNPs和各种类型的癌症与CIs口服补液盐和95%。对于每一个SNP,五个基因模型的口服补液盐和95% CIs(加性模型、主导模式和隐性模型以及纯合子和杂合的模型)估计。亚组分析是根据种族,源的控制,和癌症。

卡方检验( P > 0.05 )是应用于计算 P HWE控制组织的价值。每个SNP和癌症易感性之间的关系估计集中优势比(ORs)和95%置信区间(CIs)在五个不同的遗传模型。在整个研究结果的异质性是评估使用 我 2 统计,描述了全变差的百分比在归因于异质性的研究,而不是机会。的 我 2 25%和75%的值对应于截止点低和高程度的异质性。池效应时用的随机影响模型计算 我 2 值> 75%。否则,使用一个固定后果模型的显著的异质性研究。进行灵敏度分析来评估每个研究总体估计的影响。贝格和食叶蛾的测试是用来评估潜在的发表偏倚。统计分析都是由占据软件版本12.0(美国TX占据公司LP)。一个 P 值< 0.05被认为是具有统计学意义。

 3所示。结果 3.1。包括研究和学科的特性

共有365个相关研究初步检索系统发布后搜索。排除重复的文献后,我们独立读这篇文章的摘要和参考评估资格的荟萃分析,以及出版的荟萃分析的相关基因。随后,25项研究有可能包含在目前的分析来进一步评估。考虑到这些文章的全文后,九个研究被排除在外的原因如下:两篇文章没有对照组;三篇文章没有足够数据;三篇文章不符合HWE;只有一项研究关于rs55829688和rs1951625。最后,16篇文章(13750例病例和17194例对照)包含在定量合成。研究选择过程的流程图如图 1。

流程图包括选拔过程的研究。

在这个荟萃分析中研究的特点,提出了在桌子上 1。在这些文章中,11 rs145204276参与lncRNA GAS5 [ 13- - - - - - 23]。在这11篇文章,10调查了亚洲和一个白人种族(伊朗),调查和源的控制主要是基于人口的研究(9)。三项研究认为胃癌,三是参与CRC。此外,郑et al。 21]rs145204276调查在两个独立的阶段,所以我们把学习当作两个独立的调查。四篇文章也认为不仅rs7158663 rs4081134 lncRNA MEG3 [ 29日- - - - - - 32]。两篇文章涉及rs1902432、rs16901904 rs4871771, rs710886 lncRNA PCAT-1 [ 27, 28]。这些研究大多数的病例对照研究。各种基因分型方法,如聚合酶链reaction-restriction片段长度多态性(PCR-RFLP),实时PCR, TaqMan化验,MALDI-TOF质谱分析,在这些研究中使用。

在这个荟萃分析中特征的研究。

lncRNA 第一作者 一年 种族 源的控制 单核苷酸多态性 基因分型方法 癌症类型 情况下 控制 控制HWE P 价值
GAS5 Jupeng元 2018年 亚洲 乙肝 rs145204276 MassArray系统 神经胶质瘤 404年 820年 0.14
Keyvan Aminian 2018年 高加索人 PB rs145204276 聚合酶链反应 胃癌 130年 230年 0.27
Qianjun李 一个 2018年 亚洲 PB rs145204276 rt - pcr 胃癌 853年 954年 0.47
Qianjun李 b 2018年 亚洲 PB rs145204276 rt - pcr 胃癌 1253年 1354年 0.37
公司道 2015年 亚洲 PB rs145204276 rt - pcr 肝细胞癌 1034年 1054年 0.07
Yiyin唐 2018年 亚洲 乙肝 rs145204276 聚合酶链反应 乳腺癌 575年 602年 0.93
Yongbin郑我 2016年 亚洲 PB rs145204276 聚合酶链反应 结肠直肠癌 600年 600年 0.76
Yongbin ZhengII 2016年 亚洲 PB rs145204276 聚合酶链反应 结肠直肠癌 800年 800年 > 0.05
Weihao李 2017年 亚洲 PB rs145204276 rt - pcr 肺癌 600年 600年 0.07
磊哥许 2018年 亚洲 PB rs145204276 rt - pcr 骨肉瘤 132年 1270年 0.56
Zhansheng朱 一个 2016年 亚洲 PB rs145204276 rt - pcr 结肠直肠癌 813年 926年 0.11
Zhansheng朱 b 2017年 亚洲 PB rs145204276 rt - pcr 宫颈鳞状细胞癌 920年 1018年 0.17
PCAT1 Qinbo元 2018年 亚洲 乙肝 rs1902432 T > C TaqMan 前列腺癌 850年 860年 0.75
rs16901904 T > C 0.01
rs4871771 T > 0.32
rs710886 > G 0.49
雅迪林我 2017年 亚洲 乙肝 rs1902432 T > C rt - pcr 膀胱癌 578年 1006年 1.00
rs16901904 T > C 0.60
rs4871771 T > 0.02
rs710886 > G 0.12
雅迪林二世 2017年 亚洲 乙肝 rs710886 > G rt - pcr 膀胱癌 1028年 1381年 0.77
MEG3 Zhenjian卓 2018年 亚洲 PB rs7158663 G > rt - pcr 神经母细胞瘤 392年 783年 0.72
rs4081134 G > 0.76
Zitai杨 2018年 亚洲 PB rs7158663 G > rt - pcr 肺癌 526年 526年 0.71
rs4081134 G > 0.59
七张 2018年 亚洲 PB rs7158663 G > TaqMan 胃癌 172年 224年 0.91
rs4081134 G > 0.17
Xiangming曹 2016年 亚洲 乙肝 rs7158663 G > MALDI-TOF质谱 结肠直肠癌 518年 517年 0.81

注:PB:人口基础;HB:基于医院的。

 3.2。荟萃分析结果 3.2.1之上。的rs145204276 SNP lncRNA GAS5和癌症易感性

之间的关系rs145204276 SNP在lncRNA GAS5基因和所有类型的癌症的风险如表所示 2。在整体分析中,我们不能获得rs145204276多态性与癌症风险之间的关联没有五遗传模型。然而,癌症类型的分层分析表明rs145204276与胃癌的风险下降德尔与ins遗传模型( 德尔与ins: 或 = 0.79 , 95年 % CI = 0.72 量 0.86 ; 德尔德尔与ins / ins + del / ins: 或 = 0.74 , 95年 % CI = 0.59 量 0.91 ; 德尔/ ins与ins / ins: 或 = 0.84 , 95年 % CI = 0.77 量 0.98 )(表 2,图 2)。类似的结果是获得使用del /德尔和德尔/ ins + ins / ins遗传模型和德尔/ ins与ins / ins遗传模型(表 2)。尽管结果显示没有明显的协会之间的任何基因模型rs145204276和CRC风险,减少风险的趋势仍在德尔与ins和德尔/ del + del / ins与ins / ins遗传模型( 德尔与ins: 或 = 0.96 , 95年 % CI = 0.65 量 2.48 ; 德尔/ del + del / ins与ins / ins: 或 = 0.94 ),如表所示 2和图 2(一个)。然而,我们没有发现一个协会rs145204276多态性与肺癌的风险,宫颈鳞状细胞癌、神经胶质瘤,肝癌,乳腺癌或骨肉瘤。分析是由种族时,没有明显的相关性被发现在亚洲和白人种族遗传模型(表 2补充材料)。此外,我们进一步进行亚组分析的源控制,结果表明,也没有rs145204276与癌症风险之间的联系在PB或HB子组。然而,rs145204276的功能多态性是截然不同的癌症I + II和III期+第四阶段。详细风险增加趋势可以看到所有遗传模型在癌症阶段I +二世和降低风险趋势可以看到所有遗传模型在癌症III期+ IV(表 2补充材料)。

荟萃分析的结果rs145204276与癌症风险之间的联系。

变量 许多研究 德尔vs 。ins ▽/▽vs 。ins / ins 德尔/ del + del / ins与ins / ins 德尔德尔与ins / ins + del / ins 德尔/ ins与ins / ins
或(95%置信区间) P 或(95%置信区间) P 或(95%置信区间) P 或(95%置信区间) P 或(95%置信区间) P
整体 12 0.95 (0.80,1.13)r 0.54 1.09 (0.75,1.57)r 0.67 0.97 (0.79,1.19)b 0.78 1.02 (0.76,1.38)r 0.88 0.94 (0.80,1.100)r 0.43
癌症类型
胃癌 3 0.79 (0.72,0.86)r 0.00 0.90 (0.35,2.31)r 0.82 0.88 (0.53,1.44)r 0.60 0.74 (0.59,0.91)一个 0.005 0.84 (0.77,0.98)r 0.03
结肠直肠癌 3 0.96 (0.65,1.40)r 0.82 0.96 (0.43,2.16)r 0.93 0.94 (0.60,1.45)r 0.77 0.99 (0.52,1.87)r 0.98 0.93 (0.65,1.34)r 0.71
其他人 6 1.06 (0.82,1.36)r 0.68 1.24 (0.72,2.14)r 0.93 1.03 (0.76,1.40)r 0.84 1.25 (0.81,1.91)r 0.31 1.07 (0.97,1.17)r 0.16
种族
中国 11 0.98 (0.82,1.17)r 0.79 1.15 (0.79,1.68)r 0.47 1.01 (0.82,1.24)r 0.94 1.06 (0.79,1.44)r 0.69 0.96 (0.82,1.13)r 0.63
伊朗 1 0.61 (0.42,0.89)r - - - - - - 0.43 (0.17,1.11)r - - - - - - 0.58 (0.37,3.91)r - - - - - - 0.51 (0.20,1.30)r - - - - - - 0.61 (0.38,0.99)r - - - - - -
源的控制
PB 10 0.92 (0.76,1.11)r 0.38 1.05 (0.70,1.57)r 0.80 0.95 (0.76,1.17)r 0.62 0.99 (0.71,1.36)r 0.93 0.91 (0.78,1.08)r 0.28
乙肝 2 1.10 (0.57,2.15)r 0.77 1.30 (0.34,4.97)r 0.71 1.12 (0.49,2.53)r 0.79 1.23 (0.45,3.36)r 0.68 1.09 (0.54,2.20)r 0.82
癌症的阶段
阶段I +二世 7 1.05 (0.86,1.28)r 0.62 1.16 (0.80,1.66)r 0.44 1.06 (0.81,1.37)r 0.68 1.18 (0.89,1.56)r 0.24 1.01 (0.75 - 1.36)vr 0.94
阶段III +四世 7 0.75 (0.50,1.11)r 0.15 0.76 (0.35,1.61)r 0.47 0.70 (0.44,1.13)r 0.14 0.94 (0.54,1.63)r 0.82 0.68 (0.43,1.08)r 0.10

注:r:计算基于随机模型。

森林土地rs145204276与癌症风险之间的联系的亚组分析由癌症三种遗传模型。(一) 德尔与ins遗传模型;(b) 德尔德尔和德尔/ ins + ins / ins遗传模型;(c) 德尔/ ins与ins / ins遗传模型;(d)贝格rs145204276的漏斗图 德尔vs。ins遗传模型。或:优势比;95%置信区间:95%置信区间。

 3.2.2。rs7158663和rs4081134 snp lncRNA MEG3基因与癌症易感性

包括研究的四个评估来确定rs7158663与癌症风险之间的联系。然而,结果显示没有明显的协会之间的任何基因模型rs7158663和癌症风险的随机影响模型(图 3 (b))。三项研究被用来检测rs4081134与癌症风险之间的联系。结果表明,没有发现重大协会rs4081134与癌症风险之间的任何基因模型的随机模型。然而,风险降低的趋势可以验证(与G: 或 = 0.97 , 95年 % CI = 0.71 量 1.31 ; AA和GG: 或 = 0.86 , 95年 % CI 0.46 量 1.63 ; AG和GG: 或 = 0.98 , 95年 % CI = 0.73 量 1.33 ; AA + AG和GG: 或 = 0.97 , 95年 % CI = 0.69 量 1.36 ; AA和AG) + GG: 或 = 0.87 , 95年 % CI = 0.51 量 1.47 )(图 3(一个))。

森林块rs7158663之间的关联和rs4081134五基因与癌症风险模型。(一)rs4081134与癌症风险之间的联系;(b) rs7158663与癌症风险之间的联系。或:优势比;95%置信区间:95%置信区间。

 3.2.3。rs1902432、rs16901904 rs4871771, rs710886变化的lncRNA PCAT-1基因与癌症易感性

对于lncRNA PCAT-1多态性,我们调查的影响主要集中在四个lncRNA多态性(rs16901904, rs710886 rs4871771, rs1902432)。如图 4(一)rs16901904,降低癌症风险被固定后果模型(三个遗传模型中观察到的 C与T: 或 = 0.79 , 95年 % CI = 0.70 量 0.90 ; CC与CT + TT: 或 = 0.49 , 95年 % CI = 0.37 量 0.65 ; CC和TT: 或 = 0.49 , 95年 % CI = 0.37 量 0.66 )。在rs710886类似协会发现,尽管不是统计学意义( GG和AA:= 0.99,95% CI = 0.66 - -1.47; GA与AA:= 0.94,95% CI = 0.82 - -1.07; GG + AG)与AA:= 0.96,95% CI -1.15 = 0.79),如图所示 4 (b)。然而,没有明显rs4871771或rs1902432与癌症风险之间的联系在任何遗传模型由固定后果或随机影响模型(见补充材料(可用 在这里))。

森林的情节rs16901904和rs710886与癌症风险之间的联系在5基因模型。(一)rs16901904与癌症风险之间的联系;(b) rs710886与癌症风险之间的联系。或:优势比;95%置信区间:95%置信区间。

 3.3。Metaregression分析

我们观察到显著的异质性研究的荟萃分析中rs145204276多态性。我们因此执行metaregression分析评估异质性的来源在德尔与ins遗传模型(表中 3)。的癌症类型,来源控制,种族,和pcr方法检测,但没有统计学意义。因此,当明显的异质性( 我 2 价值 > 75年 % )在整体或子群分析,随机模型被用于制造稳定的置信区间。否则,选择固定后果模型进行数据分析。

Metaregression分析GAS5 rs145204276癌症风险(del与ins遗传模型)。

单核苷酸多态性 变量 系数 标准错误 95%可信区间 P
GAS5rs145204276 源的控制 -0.10 0.34 -0.86 - -0.67 0.79
种族 0.55 0.48 -0.49 - -1.59 0.27
癌症类型 0.14 0.15 -0.20 - -0.47 0.38
基因分型方法 0.11 0.20 -0.32 - -0.55 0.57
3.4。发表偏倚

Begg的漏斗图和食叶蛾的测试进行检查在这个荟萃分析发表偏倚。包括单核苷酸多态性,没有发表偏倚的证据被发现在所有基因型模型。发表偏倚的测试结果如图所示 2 (d);在德尔与ins遗传模型, P Begg的漏斗图测试值为0.78。

 4所示。讨论

近年来,lncRNAs已确认在基因表达发挥重要的监管作用,和他们的异常表达被认为是癌症的一个标志特征( 33]。单核苷酸多态性有广泛分布,可以发现在任何基因或mRNA地区,和研究人员日益关注的重要作用lncRNA snp在癌症 6]。因此,有必要确定lncRNA多态性与癌症风险之间的联系。在本文中,我们选择所有的文章发表在PubMed、网络科学、Embase,谷歌学者,Cochrane图书馆、CNKI、煤层气和包括多态性lncRNAs GAS5, MEG3, PCAT-1荟萃分析。结果表明,两种lncRNA多态性(GAS5 rs145204276和PCAT1 rs16901904)可能有助于降低患癌症的风险。

最近,lncRNA GAS5吸引了关注作为一种新型的lncRNA在癌症发展中扮演着重要角色。此外,bp indel 5多态性(rs145204276) lncRNA GAS5启动子区域也被详细研究了不同类型的肿瘤。然而,我们不能获得rs145204276多态性与癌症风险之间的关联没有五基因在整体分析模型。亚组分析的结果通过癌症类型显示rs145204276 del等位基因与胃癌的风险下降( 德尔与ins: 或 = 0.79 , 95年 % CI = 0.72 量 0.86 ; 德尔德尔与ins / ins + del / ins: 或 = 0.74 , 95年 % CI = 0.59 量 0.91 ; 德尔/ ins与ins / ins: 或 = 0.84 , 95年 % CI = 0.77 量 0.98 )。然而,我们没有发现一个协会rs145204276多态性与其他癌症的风险。有趣的是,rs145204276多态性在肿瘤细胞的作用机制还没有完全阐明。一方面,研究者发现del多态性rs145204276可能影响GAS5转录活动影响CpG岛在启动子区域的甲基化状态GAS5,影响其肿瘤抑制功能( 34]。rs145204276 del等位基因也可以诱导启动子活动绑定SP1的表达水平和增强lncRNA GAS5,导致更高的乳腺癌危险因素的发展( 17]。另一方面,进一步的研究表明,GAS5诱导的超表达indel多态性rs145204276可以抑制mir - 221的表达和mir - 182 - 5 - p,从而减少了扩散、迁移和入侵属性的癌症( 19]。总之,这些相互矛盾的结果可能解释的易感性 位点在不同癌症类型是不同的。的作用机制GAS5癌症仍知之甚少,这还需要进一步研究。

lncRNA MEG3已经证明异常表达在多种人类癌症,如膀胱癌、神经胶质瘤、胃癌( 31日]。先前的研究显示,通过感应MEG3显著抑制细胞生长的G2 / M细胞周期阻滞,细胞凋亡,减少宫颈癌miR-21-5p含量( 35]。Braconi等人发现MEG3诱导细胞凋亡的异常表达在肝细胞癌中华人民共和国/脉冲重复频率/ 5细胞( 36]。的差别的另一项研究结果显示,对这些lncRNA MEG3诱导人类支气管上皮细胞恶性转化镍通过PHLPP1转录和HIF-1 α翻译( 37]。此外,单核苷酸多态性在MEG3也参与不同类型的癌症的发展。例如,曹等人发现,在MEG3 rs7158663有着强大的协会CRC的风险增加( 29日]。研究还表明,rs4081134在MEG3与肺癌易感性有关医院病例对照研究( 30.]。然而,关系MEG3 rs7158663多态性与肺癌易感性没有报道( 30.]。无论是rs7158663还是rs4081134风险明显修改神经母细胞瘤( 31日]。结果,只有一个风险降低的趋势观察rs4081134和癌症之间的荟萃分析。

lncRNA PCAT-1是一个长期的基因间的非编码RNA转录从8 q24.21地区 38]。它也被认为是有关各种癌,如胃膀胱( 38, 39]。以前的研究证实,lncRNA PCAT-1可以通过绑定polycomb专制复杂2促进细胞增殖(PCR2)作为转录抑制因子( 40]。我们还证实,转录后的沉默的PCAT-1 mir - 215或PCAT-1 siRNAs显著抑制肝癌细胞增殖,相反,抑制内源性mir - 215调节PCAT-1表达式和促进细胞生存能力 41]。此外,恢复mir - 145 - 5 - p减毒感应PCAT1对前列腺癌进展的影响( 42]。然而,单核苷酸多态性在lncRNA PCAT-1也各不相同,影响对不同类型的癌症。由于我们的分析,降低癌症风险的一个协会rs16901904观察三个遗传模型( C与T, CC与CT + TT, CC和TT)。类似的协会观察rs710886,尽管没有统计学意义。这一发现还需要进一步研究。

虽然重大rs145204276 rs16901904和癌症风险之间的联系被观察到在这个荟萃分析,我们当前的工作仍然存在一些局限性。首先,有一个高度的异质性rs145204276上包含的研究之一。虽然我们分层分析癌症类型,种族,和源的控制,研究异构性仍然是显而易见的。Metaregression还透露,异质性的来源并不是种族,基因分型方法,癌症类型,或源的控制。其次,由于缺乏原始数据包括研究,评估之间的联系的年龄,性别,家庭历史,或环境因素与癌症风险没有进行。第三,只有一个在白人人口研究,这项荟萃分析的结果只能适合中国人口。最后,一些包括研究的样本量小,这可能会影响结果的稳定性。

 5。结论

我们的结果表明,rs145204276 lncRNA GAS5是保护性因素在胃癌的发展,以及rs145204276的作用也不同在不同癌症的阶段。此外,rs16901904 lncRNA PCAT-1还具有保护作用与癌症发展中国的人口。然而,一些限制仍然存在在我们的分析,所以结果应该谨慎。越来越多种族的研究应该被包括在我们的进一步的研究。

 数据可用性

本研究中所有生成的数据或分析包括在发表的这篇文章。

 的利益冲突

我们宣布没有利益冲突的相关研究。

 作者的贡献

晓燕盾和闻堰高了同样的工作。

 确认

这项研究得到了国家自然科学基金(81771520,81771520,81771520,31702144),浙江省科学技术部门(2016 c34002),浙江省自然科学基金(LQ16H020006和LY16H20002),基金从浙江省的卫生局(wkj2011 - 2 - 014, 2015年2015 dta001 kya001, 2019 ky257 2019 rc091 2019 ky263 2019 rc093 ky188 2017和2017 ky189),和浙江省的科技项目(2017 zb002)。Genxiang毛博士是一个厄玛和保罗Milstein项目支持的高级卫生研究员MMAAP基金会( http://www.mmaapf.org)。

 补充材料

补充图1:森林的情节在rs1902432 PCAT1和癌症风险之间的联系在5个基因模型。或:优势比;95%置信区间:95%置信区间。从随机权重分析。补充图2:森林的情节联系PCAT1 rs4871771五基因与癌症风险模型。或:优势比;95%置信区间:95%置信区间。从随机权重分析。

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