CRIG
遗传学病例报告
2090 - 6552
2090 - 6544
Hindawi
10.1155 / 2019/2836263
2836263
病例报告
起始密码子变异
木钉 影响砧骨和镫骨的symphal畸型和听骨链畸形
https://orcid.org/0000-0001-9015-4895
林奎斯特
内森·R。
1
Appelbaum
埃里克·N。
1
阿查里雅
Anushree
2
Vrabec
杰弗里·T。
3.
忠实的
苏珊娜。
2
https://orcid.org/0000-0001-7310-6082
Schrauwen
伊莎贝尔
2
Paracchini
西尔维亚
1
耳鼻咽喉部
头颈外科
贝勒医学院
休斯顿
德州
美国
bcm.edu
2
统计遗传学中心
神经学部门
Gertrude H. Sergievsky中心
哥伦比亚大学医学中心
纽约
纽约
美国
columbia.edu
3.
耳鼻咽喉部
休斯顿卫理公会医院
休斯顿
德州
美国
houstonmethodist.org
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版权所有©2019 Nathan R. Lindquist等人。
这是一篇在知识共享署名许可下发布的开放存取的文章,它允许在任何媒体上无限制地使用、传播和复制,只要原始作品被适当地引用。
我们进行了外显子组测序,以评估一位双侧传导性听力损失患者的潜在分子原因,该患者是由于多个听骨异常以及五指共管。这导致了一个新的杂合起始密码子变异在
木钉 基因(C . 2t >C:p.Met1?)变异的
木钉 导致一系列的耳科,手指和关节异常,建议合并称为
木钉 相关的手足系谱系障碍(
木钉 SSD)。此类变异引起的传导性听力损失可能是由于镫骨踏板强直、锤骨包关节固定或砧骨短突固定所致。在本病例中,镫骨和砧骨固定,镫骨上结构异常高,砧骨长突增厚,砧骨体增大,导致在耳科手术中提高听阈的明显挑战。本病例突出显示在一个患者的听骨链的多种异常开始密码子变异
木钉 .我们提供详细的影像资料,这些畸形以及手术考虑和结果。
美国听力研究基金会
国家耳聋和其他沟通障碍研究所
R01 DC011651
DC003594
1.介绍
的
木钉 基因编码了分泌的脑蛋白,它对正常的骨骼和关节发育至关重要。Noggin拮抗骨形态发生蛋白(BMPs)信号,BMPs是一种多功能生长因子,属于转化生长因子超家族,在包括骨和软骨在内的各种组织的发育中具有重要作用[
1 ].
常染色体显性遗传的或
新创 变异的
木钉 导致一系列伴有或不伴有传传性听力损失的关节/手指异常疾病,包括B2型短指(BDB2)、多关节早闭综合征1 (SYN1)、宽拇指和脚趾镫骨强直(Teunissen-Cremers综合征)、近端symphalangism 1A (SYM1A)和跗骨-腕关节联合综合征(TCC)。总的来说,这可以被称为
木钉 相关的手足系谱系障碍(
木钉 ‐SSD)在单一统一诊断术语中[
2 ].导电性听力损失通常是由于镫骨强直引起的。听骨链的其他异常也可能发生,但频率较低[
2 ].杂合子Nog+/−小鼠由于镫骨固定表现出轻度传导性听力损失[
3. ].
在此,我们描述了一种新的变异
木钉 基因导致NOG symphalangism综合征(NOG- ssd),包括砧骨畸形,并报告其临床和分子表型,以及患者传导性听力损失的手术考虑和结果。
2.材料和方法
2.1.病人
在贝勒医学院的IRB批准(H-17566)后,对患者的完整病史和家族史进行了审查,注意到symphalism和传导性听力损失。研究参与者提供书面的知情同意。术前和术后测听包括纯音测听和鼓室测听,以及同侧和对侧镫骨反射测试。颞骨高分辨率计算机断层扫描(CT)采用轴位片冠状面和矢状面重建来评估中耳和内耳。
2.2.外显子组测序
使用Oragene OG-500采集试剂盒从患者处获得唾液样本,通过prepIT纯化试剂盒(DNA Genotek, Ontario, Canada)提取DNA。使用sureelect Human All Exon V6试剂盒制备Exomic文库,并在HiSeq(2500/4000)仪器上进行测序。使用Burrows-Wheeler Aligner (BWAv0.7.15)将Reads与人类参考基因组进行比对[
4 ].通过基因组分析工具包(GATKv3.7)和Picard工具进行插入/删除(InDels)周围的局部重组、基础质量评分重新校准、重复读删除以及单核苷酸和InDel变异调用[
5 ].其次,使用ANNOVAR (v2018Apr16)进行注释,并根据数据库中的频率筛选变异[Genome Aggregation Database (gnomAD) minor等位基因频率<0.005][
6 ].各种生物信息学预测被用来评估变异(从dbnsfp33a和ANNOVAR获得)[
7 ].桑格测序以验证在
木钉 .简而言之,纯化的PCR产物(引物:Forward: 5 ' -GCCAACTTGTGTGCCTTTCT-3 ';反向5 ' -GTCTGGGTGTTCGATGAGGT-3 ')使用BigDye终止子v3.1周期测序试剂盒测序,然后在ABI 3730 DNA分析仪(福斯特市应用生物系统公司,CA)上进行毛细管电泳。
3.结果
3.1.临床特征
我们的患者是一位35岁的白人男性,自儿童早期因双侧进行性传导性听力损失而被转介。10岁时的评估包括测听,但没有影像学检查。据报道,这表明了一定程度的听力损失,但不能用于审查。病史包括腹部脂肪瘤,心内直视手术对主动脉瓣异常5岁,和多个整形手术包括神经节切除囊肿的手腕,以及修复的肩膀和脚踝骨折injury-appropriate与体育运动有关的创伤不认为是他的表型相关。值得注意的是,患者否认眼科病史。他的父亲和祖父有听力损失的家族史。据报道,他的祖父也有类似的五指畸形,而他的父亲没有。两者都无法进行基因测试或检查。双手的体格检查显示只有两个食指有指征。他没有其他手指的近端指节或明显的短指。 Imaging of the hands was not performed at our institution due to prior work-up with his primary physicians. Binocular microscopy demonstrated bilateral normal tympanic membranes and well-aerated middle ear spaces, and pneumatic otoscopy displayed mobility of the malleus bilaterally. Pure tone audiometry revealed bilateral moderate rising to mild conductive hearing loss bilaterally (Figure
1 )。右耳语音识别阈值为45 dB,左耳语音识别阈值为40 dB,在70 dB HL下,安静条件下单词理解的单词识别得分分别为90%和100%。声学阻抗结果显示耳膜活动正常,双侧同侧和对侧镫骨反射缺失。颞骨CT显示增大的砧骨,右侧两侧可能有固定(图)
2(一个) )和左边(图
2 (b) )的耳朵。冠状重构显示镫骨上部结构右侧约4.5 mm,左侧约4.8 mm,两侧砧骨长突增厚(图)
2 (c) )。双侧被盖乳突处被盖裂开或变薄,无脑膜突出(图)
2 (d) )。
图1
术前纯音测听显示右侧(a)和左侧(b)双侧中度至轻度传导性听力损失。双侧同侧和对侧镫骨反射缺失。
(一)
(b)
图2
颞骨的轴向CT骨窗显示显著扩大砧骨可能固定在右(a)和左耳朵(a)。日冕将左边(c)演示了一个细长的镫骨上层建筑约4.8毫米(虚线)和增厚砧骨长过程(箭头)。右侧(d)为4.5 mm。右耳冠状面显示乳突被膜骨裂或变薄,无脑膜突出。左侧也有类似的发现。
(一)
(b)
(c)
(d)
3.2.外科干预措施
在适当的咨询后,患者接受手术治疗,以解决他的右侧传导性听力损失。术中证实听骨异常,包括增大的固定砧骨和固定的镫骨。温和固定砧骨,并通过身体和胸骨之间的轻微牵引来移动砧骨。患者行右侧镫骨切开术,CO2激光并在卵圆形窗筋膜封闭处用5毫米Richards活塞重建。术后病程无明显变化。患者术后纯音和语音识别阈值在术后明显改善(图)
3. )。5个月后,他接受了左耳间隔手术。术中发现完全相同,包括异常高的镫骨和加厚的砧骨长突。起初,我们选择了罗宾逊假肢;然而,它不能正确地位于扩大的透镜状突起上。因此,选用5.5 mm cause活塞进行改造,效果良好。不幸的是,患者在第二次手术后没有获得术后听力学图,但在最近的临床随访中报告双侧主观听力改善,对称。
图3
术后纯音测听显示空气传导阈值改善至轻度传导性听力损失,右侧气骨间隙接近闭合。遗憾的是,该患者在第二次手术后没有随访术后听力,但主观上报告听力改善和对称。
3.3.基因分析
外显子组测序显示,该基因的起始密码子变异为杂合子
木钉 基因(NM_005450: C . 2t >C:p.Met1?), Sanger测序证实。这种变异在gnomAD数据库中不存在,并被dbnsfp33a中包括的各种生物信息学工具(如VariantTaster, FATHMM, SIFT)预测为有害的[
7 ].该变异导致起始密码子(蛋氨酸)丢失,阻碍野生型Noggin蛋白的翻译,并被归类为可能的致病性(根据美国医学遗传学学院(ACMG)序列变异解释指南)[
8 ].
4.讨论
患者的
木钉 变异,传导性听力损失主要被描述为镫骨强直的结果。然而,在少数病例中也观察到其他听骨链异常,如踝包关节固定、砧骨短突固定和砧骨长突伸长[
2 ].此病例术前影像显示镫骨上部结构较高(砧骨到前庭的距离增加),砧骨长突增厚,砧骨体增大。术中镫骨和砧骨均被固定。在调动砧骨、镫骨切开术和在卵形窗放置筋膜移植物后,考虑到这些解剖异常,术中主要的挑战是选择合适的镫骨假体。砧骨较厚,过程较长,使夹式假体放置困难,使标准的压接工具不太有用。由于砧骨透镜状突的周长,桶柄假体也很困难。本病例的CT表现为巨大的砧骨,其他病例未见
木钉 变体。因此,我们认为CT成像是有用的术前计划,以预测假体安置的困难。
镫骨切除术后不同的听力结果报告
木钉 变异(
9 - - - - - -
11 ].Brown等人指出,足板骨再生的高发生率导致复发性导电损失[
9 ].所有的作者都认识到需要比平均长度更长的假体。颞骨组织病理学未显示内耳异常[
8 ].
综上所述,我们利用外显子组测序技术鉴定了一种新的突变体
木钉 基因(C . 2t >C:p.Met1?)这种变体导致了翻译起始点的丢失
木钉 基因,并预计导致头蛋白功能的完全丧失。我们强调在中耳听骨链中可以存在多种畸形
木钉 变体。
的利益冲突
作者没有任何经济利益或需要申报的信息。
致谢
这项研究得到了美国听力研究基金会Isabelle Schrauwen (http://american-hearing.org/)和美国耳聋和其他沟通障碍研究所R01 DC011651和DC003594资助Suzanne M. Leal的支持。
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