夜间额叶癫痫(NFLE)是一种癫痫的发作主要发生在睡眠中。在其他形式的癫痫,常用的临床方法主要包括手动检查脑照相术(EEG)信号,一个费力而费时的过程,通常需要不止一个的贡献有经验的神经学家。在过去的几十年里,众多自动化这个检测方法已经提出,最近,机器学习已经显示出非常有前途的性能。本文原创卷积神经网络(CNN)的体系结构提出了开发针对病人的癫痫检测模型三个病人NFLE影响。方面的表演,准确性、敏感性和特异性,超过了几个百分点的最新文献。的能力获得特定的模型一直还测试了比较癫痫发病时间与所提供的神经病学家,令人鼓舞的结果。此外,相同的CNN架构已经被用于开发一个cross-patient癫痫检测系统,诉诸transfer-learning范式。从一个特定的模型,很少有数据从一个新的病人足够的自定义他的模型。这贡献旨在减轻神经学家的任务,他们可能有一个健壮的迹象证实了临床的结论。
夜间额叶癫痫(NFLE)是一种罕见的癫痫,一般继承,影响两性从1到60年,并与认知能力下降有关。危机的特点是频繁而短暂hypermotor睡眠发作,可能从一个简单的从睡眠觉醒到更有针对性的运动运动,通过体位矛盾的补剂,愁眉苦脸,尖叫和呻吟,情景夜间漫游,和刻板的激动梦游病(
EEG信号的使用是证实大多数关于癫痫发作的文献发现,确实认为金本位脑电图分析大脑的电活动(
在文献中,有一个广泛的建议一般癫痫发作的识别(
尽管有这些很好的结果,引用文献表明,功能工程阶段对机器学习的成功是至关重要的预测模型和适当的识别癫痫指标是一个初步尽职调查。事实上,它高度影响分类器的性能,通常习惯于一个特定知识和能力下的病理生理学研究。此外,提取特征通常是由手,非常耗时,需要大量的场景模拟,以选择最佳组合的特性。为了避免这种具有挑战性的阶段,在本文中,cnn已经使用。事实上,cnn能够自动学习相关的高维数据的低维特征先后应用卷积和将采样操作。
cnn,属于所谓的“深层神经网络(
见引用的引用、培训CNN模型需要大量的脑电图记录由技术熟练的神经病学家手动贴上标签,这可能是一个冗长而耗时的任务。因此,正如大多数的作者强调的,这些深度学习发作的主要问题限制了性能检测方法的训练数据量,这可能还不够,和癫痫的特征空间,这可能会发生显著的变化在不同的患者脑电图记录,甚至同样的耐心。为了克服这些限制,在本文,transfer-learning策略,可显著降低训练所需的数据量,采用。转移学习调查报告(
在本文中,cnn已经首先用于构建特定病人的癫痫检测系统受NFLE三个病人。检测问题被建模为癫痫发作和nonseizure分类问题,获得性能,克服了其他方法了(
本文的其余部分组织如下。使用的数据库,数据增强模式,CNN模型架构中讨论部分
深度学习和转移学习已经被用于构建特定的和cross-patient癫痫检测系统。检测问题被正式为两分类问题,两类对应于癫痫(深圳)或nonseizure (NS)州在睡眠和培训已与卷积神经网络模型与长期脑电图记录包括癫痫发作。
这项研究的数据来自两个癫痫中心:Unidade de Monitorizacao em Epilepsia e园子做Centro Hospitalar e大学de Coimbra的葡萄牙,Epilepsiezentrum, Universitatsklinikum弗莱堡,德国代表EPILEPSIAE项目(
癫痫患者从欧洲数据库。
| 病人 | 性 | #的深圳 | 深圳时间(平均)(s) | 深圳总时间(年代) | 总记录时间(s) | 癫痫中心 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 帕特# 5 | 米 | 5 | 38.00 | 190.00 | 3190.00 | Coimbra的 |
| 帕特# 6 | F | 8 | 89.66 | 717.29 | 5517.29 | 弗莱堡 |
| 帕特# 9 | 米 | 15 | 84.38 | 1265.75 | 10265.75 | 弗莱堡 |
最初和最后一次发作(深圳)已确定基于神经学家至少两个专家之间的协议。nonseizure录音,没有可用的信息对病人睡眠或清醒状态。在[
数据集包括十一个头皮脑电图渠道,根据国际10 - 20系统[
国际10 - 20体系(
数据,来自连续11个录音,每一个对应于一个脑电图频道,已经分割使用的滑动窗口重叠5秒。通过这种方式,每个时间窗口,或
为了提高原材料的质量EEG信号,一个预处理步骤已经完成。与缺失的数据丢弃窗户后,一个标准的潜在价值已经完成的阈值。在这里,数据被贴上了工件如果试验中的任何数据点的绝对值超过一个固定的阈值。这种方法是目前使用最广泛的工件在社区EEG检测方法。这是最有效的检测严重眨眼或眼球运动的构件。因为即使少量的这些极端值可能会导致不准确的结果,部分包括这些极端值已经被抛弃了。此外,过滤是一个必要步骤由于50 Hz线路噪声的存在和直流偏置(删除0赫兹)。因此,陷波滤波器在50赫兹的带宽1 Hz已经应用于去除50 Hz线路噪声,和每个电极的平均值作为直流偏置preseizure阶段被移除。清理数据集对每个病人然后分区,以随机分配不同的癫痫训练,验证集和测试集。
CNN的发展架构,深层残留网络(ResNet)结构
CNN的架构,我是图像输入层;铜k是
第一次卷积单元(铜0),由三层组成,大小1280×11的输入图像转换成4-channels图像大小为320×11。负责任的大小是卷积层,减少过滤器的大小5 4×1×1和进步。马克斯池层(MP),池大小5×1和4×1大步,遵循第一个回旋的单位,减少再次4-channel图像的图像尺寸大小80×11。第二个回旋的单元(铜1)由七层过滤器4-channel图像大小为80×11通过剩余的连接。两个卷积后单位(铜2和铜3),每一个由九层,过滤掉4-channel图像大小为80×11通过剩余的连接,减少了图像尺寸先的16通道图像大小20×11,然后以64 -图像大小为5×11频道。平均池层(美联社),池大小5×1,减少了图像尺寸64 -通道图像的大小是1×11日生产704年一组特性。最后,一个完全连接层(FC)处理704特性,输出的平均池层和提要SoftMax层(SM)分类(CO)。
在此体系结构中,每个通道单独输入图像的过滤,获得一组64特性/电极。来自不同电极的特性相结合的完全连接层,即。只有在回旋的单位,分类。
辍学层与辍学概率内包含20%的铜1、铜2,铜3卷积单位为了减少过度拟合训练集和提高泛化。该算法用于训练网络的随机梯度下降势头(
深的性能模型已经使用一些指标用于评估大多数癫痫和文献,一般来说,在机器学习分类,如准确性、特异性、敏感性,和Gmean:
首先,针对病人的癫痫检测系统开发的三个病人。表
数据集作文的训练、验证和测试。
| 病人 | #的深圳 | #深圳的火车 | #深圳有效 | #深圳测试 | #段火车 | #段的有效 | #段测试 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 帕特# 5 | 5 | 3 | 1 | 1 | 1205年 | 421年 | 645年 |
| 帕特# 6 | 8 | 4 | 2 | 2 | 1193年 | 710年 | 1319年 |
| 帕特# 9 | 15 | 7 | 3 | 5 | 1009年 | 486年 | 3313年 |
作为一个例子,图
精度在培训、验证和测试集对训练时期病人# 9。
表
测试性能(%)的特定的模型。
| 病人 | 帕特# 5 | 帕特# 6 | 帕特# 9 | 平均值 |
|---|---|---|---|---|
| 精度 | 94.42 | 99.77 | 94.99 | 96.39 |
| 特异性 | 94.12 | One hundred. | 96.32 | 96.81 |
| 灵敏度 | 98.00 | 97.67 | 83.94 | 93.20 |
值大于94%已经实现了所有的性能指标平均值高于93%的患者,除了敏感性相关病人# 9等于83.94%。从表
对于每一个病人,获得的结果,几何平均数的特异性和灵敏度(Gmean),在(与
比较Gmean(%)和一些先进的技术。
| 方法 | 耶鲁大学管理学院 | 支持向量机 | 美国有线电视新闻网 |
|---|---|---|---|
| 帕特# 5 | 86.02 | 87.05 | 96.04 |
| 帕特# 6 | 90.57 | 89.84 | 98.83 |
| 帕特# 9 | 82.92 | 82.13 | 89.92 |
这些特定的模型可以用于支持神经学家的耗时的识别癫痫发作的时间。特别是,在脑电图记录的演变,条件来自CNN模型用于触发报警(即。滑动窗口时,癫痫发作)归类为深圳至少
区别
| 深圳# | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
−4 | −2 | 17 | −3 | −7 | 14 | 1 | −3 | 10 | 0 | 5 | −3 | −1 | −5 | 0 |
累积报警时间分布为病人# 9。垂直虚线是指癫痫发作时间由神经学家提供。
图
的病人的测试发作# 14 # 9。三大阴谋:原始信号的频道FP2, F4, C4彩色的基础上NS和深圳状态;底部情节:条形图的回答CNN模型,在蓝色酒吧代表一个模式分类为NS,而红酒吧是深圳模式。绿色垂直虚线标识开始发作的时间由CNN (
CNN的这些结果,显示出良好的性能,得到了从模型被训练使用数量的癫痫发作。然而,在一个新病人,而不是收集足够数量的癫痫定制从头开始一个新的不同的模型(有时是困难的)transfer-learning功能可以使用。从一个模型已经训练了其他病人,这可能是与新的癫痫发作的病人重新训练,获得cross-patient癫痫检测系统与转移患者中学习。
学习技术转移pretraining模型组成的一组数据,然后在另一个微调。在这种情况下,深cross-patient转移学习框架应用于病人的脑电图数据分类使用EEG的CNN训练另一个话题。特别是,从一个特定的CNN模型,其权重的初始值的第二阶段培训使用另一个病人的癫痫发作。这可以提供很多优势当一些癫痫是可用的。
作为一个例子,病人的特定的CNN模型# 9 (CNN9)被认为是初始模型。做了这个选择,因为一方面病人# 9最高的癫痫和其他模型达到最低性能Gmean。
表
测试性能的cross-patient癫痫检测系统(%)病人# 5。
| 深圳# 1 | 深圳# 2 | 深圳# 3 | 深圳# 4 | 深圳# 5 | |
|---|---|---|---|---|---|
| 精度 | 41.57 | 93.47 | 90.97 | 91.44 | 98.32 |
| 特异性 | 28.03 | 85.92 | 95.70 | 85.56 | 98.22 |
| 灵敏度 | One hundred. | One hundred. | 81.69 | 97.47 | One hundred. |
| Gmean | 52.94 | 92.69 | 88.42 | 91.32 | 99.11 |
cross-patient癫痫检测过程的结果的特异性灵敏度(a)和(b),从病人的癫痫检测模型为病人# 5 # 9和微调。图中显示的趋势特异性和敏感性的时间发生在5癫痫患者# 5。蓝线:训练集上的趋势;红线:趋势验证组;绿色方块:结果的测试集。
从CNN9模型,第一个癫痫发作的病人# 5的作为测试用例。正如所料,性能很低,因为模型还没有定制的新病人。特别是CNN9模型执行特异性较低(约28%),而灵敏度很高的价值(100%)。这表明炼油起始模型通过使用特定的信息。
因此,在下一步中,三分之二的脑电图的第一次发作被用作训练集,另三分之一作为验证集,而定制的模型的性能测试第二次发作,表现出特异性的提高,会增加到85.92%,而灵敏度不退化。在随后的步骤,最后发作已被用于测试模型定制前发作。它可以指出,在测试之后的癫痫,特异性和灵敏度值波动总是保持在80%以上,提供越来越高Gmean价值高达约99%的价值在过去发作进行测试。
每一步的过程,表
步骤cross-patient癫痫检测过程的病人# 5。
| 深圳培训 | 验证深圳 | 深圳测试 | #时代 | CPU时间(s) | |
|---|---|---|---|---|---|
| 步骤0 | - - - - - - | - - - - - - | 1 | 0 | 0 |
| 步骤1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 14 |
| 步骤2 | 1 | 2 | 3 | 0 | 454年 |
| 步骤3 | 1、2 | 3 | 4 | 0 | 960年 |
| 步骤4 | 1、2、3 | 4 | 5 | 2 | 1528年 |
表
测试性能(%)的cross-patient癫痫检测系统对病人# 6。
| 深圳# 1 | 深圳# 2 | 深圳# 3 | 深圳# 4 | 深圳# 5 | 深圳# 6 | 深圳# 7 | 深圳# 8 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 精度 | 88.53 | 99.26 | 97.75 | 99.63 | 95.94 | 98.82 | 92.07 | 96.37 |
| 特异性 | 97.65 | 98.82 | One hundred. | One hundred. | One hundred. | One hundred. | One hundred. | 94.71 |
| 灵敏度 | 83.22 | One hundred. | 95.04 | 99.01 | 89.11 | 97.63 | 81.82 | One hundred. |
| Gmean | 90.14 | 99.41 | 97.49 | 99.50 | 94.40 | 98.81 | 90.45 | 97.32 |
cross-patient癫痫检测过程的结果的特异性灵敏度(a)和(b),从病人的癫痫检测模型# 9:特异性和敏感性的趋势在时间发生8癫痫的病人# 6。蓝线:训练集上的趋势;红线:趋势验证组;绿色方块:结果的测试集。
在这种情况下,cross-patient癫痫检测系统执行很好自从第一次发作,尤其是关于特异性,总是值约95%以上。
这种波动的趋势,特别是关于灵敏度,表明癫痫的多样性不仅患者也在同一个病人,挑战所有分类器,不管他们可能。
在表
步骤cross-patient癫痫检测过程的病人# 6。
| 深圳培训 | 验证深圳 | 深圳测试 | #时代 | CPU时间(s) | |
|---|---|---|---|---|---|
| 步骤0 | - - - - - - | - - - - - - | 1 | 0 | 0 |
| 步骤1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 17 |
| 步骤2 | 1 | 2 | 3 | 1 | 12 |
| 步骤3 | 1、2 | 3 | 4 | 1 | 622年 |
| 步骤4 | 1、2、3 | 4 | 5 | 0 | 817年 |
| 步骤5 | 1、2、3、4 | 5 | 6 | 3 | 1206年 |
| 步骤6 | 1、2、3、4、5所示 | 6 | 7 | 1 | 32 |
| 步骤7 | 1、2、3、4、5、6所示 | 7 | 8 | 5 | 415年 |
CNN架构已经部署,ResNet结构适应的问题从脑电图癫痫检测的痕迹在夜间额叶癫痫(NFLE)。架构的调整主要是在使用一维卷积层过滤器,过滤信息分别来自不同的电极,和包括辍学层以减少过度拟合训练集和提高泛化。深度学习方法的一个优势是,工程步骤不需要复杂而耗时的特性。此外,开发针对病人的检测系统已经证明优于文献中对所有的性能指标,精度高于94%的认为病人。在我们所知,这是第一个应用程序的深度学习NFLE癫痫检测。此外,使用转移学习的潜力,缺乏广泛的脑电图数据库已经克服,可能开发cross-patient癫痫检测系统已被证明。事实上,病人自身系统可以调整到一个新的病人一些数据和有限的计算工作。
数据记录代表EPILEPSIAE项目。
在入学之前,所有患者了解学习和每一个对知情同意。
作者确认还没有已知的利益冲突与此相关刊物和没有重大的金融支持这项工作,可能会影响其结果。
作者要感谢欧盟FP 7项目EPILEPSIAE拨款211713。这项工作得到了卡利亚里,大学的开放获取出版基金的资助Regione德拉Sardegna-L.R自治。n。7/2007。