仿真建模已成为常见的估计高度传染性动物疾病的传播。几款开发模仿口蹄疫(FMD)的传播在特定的地区或国家,进行风险评估,分析疫情使用历史数据或假设的场景,协助决策流行期间,制定预案,并评估经济影响。大部分可用口蹄疫仿真模型的设计与应用在无病的国家,虽然是有限的使用这样的模型在手足口病流行国家。本文的目的是研究报告的结果进行审查现有的原始研究文献发表的空间显式随机模拟(税)手足口病传播的模型,重点评估这些模型的潜在使用流行的设置。的目标是识别特定的组件流行手足口病需要适应这些税模型的潜在应用在手足口病流行的设置。这个系统回顾棱镜后的指导方针,和三个数据库搜索,导致1176引用。八十年引文终于遇到了入选标准,包括在定性的合成,确定9独特的税模型。这些税模型评估的潜在应用在流行的设置。税评估模型可以用于手足口病的流行国家通过修改底层代码包括多个cocirculating种血清型,常规预防性疫苗接种(以下),和牲畜种群动态,更实际地模拟手足口病的流行特征。税模型的应用程序特有的设置将帮助评估手足口病控制策略,这将改善牲畜健康,为生产者提供经济收益,帮助减少贫困和饥饿,并将补努力实现可持续发展的目标。
口蹄疫(FMD)流行在世界不同的地方
仿真建模已成为常见的调查高度传染性疾病的传播,帮助决策,作为决策支持工具(
研制了许多模型模拟特定地区或国家的手足口病的传播(
然而,大多数文献报道的口蹄疫仿真模型与应用这些模型无病国家以最小的手足口病的流行现状的国家(
手足口病的流行病学,手足口病流行的税模型设置应该有能力模型口蹄疫多个cocirculating种血清型的发展,一系列的控制选项,例如紧急疫苗接种,以下,铲除,能力将在模拟种群动态(
本文的目的是报告的结果发表的一份研究审查现有的原始研究文献捐手足口病传播的模型,重点评估这些模型的潜在使用流行的设置。的目标是识别特定的组件流行手足口病需要适应税模型用于手足口病流行的设置,这将有助于评价口蹄疫的策略控制,改善牲畜健康,为生产者提供经济收益,帮助减少贫困和饥饿,将补充努力实现可持续发展的目标。
这个系统评价遵循准则建立的系统回顾和荟萃分析的首选报告项目(棱镜)[
系统综述,税模型的定义是为了方便识别的过程开发的搜索项,可以包括在定性合成(
英语语言中的任何原始研究发表在任何描述的时间间隔或税模型用于模拟手足口病传播或评估减排会包括在世界的任何部分。
三个数据库,也就是说。,谷歌学术搜索(GS), PubMed, and Web of Science (WoS), were chosen to identify the relevant literature.
三个数据库都是搜索的主要作者当天,即。2018年10月7日,确定文献。使用的关键词是
通过标识的引文数据库搜索第一次筛选(步骤1 - 3),然后评估确定税模型口蹄疫(步骤4)。最终,创建流程图(图
流程图的文献搜索、筛选和包含/排除标准(改编自
搜索结果筛选在三个步骤。在步骤1中,引用检查跨数据库和数据库中的重复。所有副本从池中被引用。在第二步中,引文出版语言筛选。引用不是英语中被移除。在步骤3中,引用检查他们的文档类型。只保留原始研究出版物,以及所有其他文档类型被排斥在筛选步骤,因为无法评估模型的特点和他们的应用程序。
在步骤4中,标题和摘要的引用进行评估以确定是否包含这个词(s)口蹄疫,手足口病,或者FMDV。如果引用包含这些关键词,他们进行评估以确定他们描述或使用税模型来了解手足口病传播并评估缓解策略。引用,不符合这一标准被排除在外,剩下的引用被选为定性的合成。这种严格的标准的基本原理是将从上述敏感具体感兴趣的疾病,例如手足口病。
剩下的被引用分组基于独特的税模型描述或使用。创建一个额外的引用,而不同的模型来评估替代缓解策略和辅助决策。
每一个独特的税然后评估假设和流行病学设计,强调其应用在流行的设置。具体来说,每个税模型评估的并行模型多个口蹄疫病毒血清型的能力,缓解策略的范围(紧急疫苗接种,以下,铲除),和牲畜种群动态。这些因素是选择,因为他们在流行手足口病流行病学意义。
评估每个捐后,各种特征提取和数据表来比较不同的税。每个捐总结,在每个税和限制被高亮显示。最后,建议为适应他们潜在的税模型的使用在流行设置。
图
数据库搜索结果在1176年访问引用:1011年,39岁和126 GS, PubMed和我们分别。在步骤1中,所有39引用从PubMed和97年引文与GS引用我们被认定为重复。1011 GS引用,四人在GS复制。所有140个重复引用被移除。
在第2步,剩下的1036引用筛选的出版语言,和22被移除,因为他们不是在英语语言。在步骤3中,剩余的1014引用检查他们的文档类型,和287年被排除在外,因为这些没有发表原创性研究。
筛选后剩余的727引用,647被排除在外,因为这些引文不包含这个词(s)口蹄疫,手足口病,FMDV在题目或摘要中没有描述或使用捐手足口病,因此未能满足入选标准。剩下的80引用包含在定性的合成。排除模型不是随机或不包括一个空间组件。
9独特的税模型识别,和相关的引用是分组表
税模型与相应的引用。
| 税模型(引用) | 搜索结果的参考 |
|---|---|
| 沃里克模型(19) | ( |
| 戴维斯动物疾病仿真模型(16) | ( |
| AusSpread模型(10) | ( |
| InterSpread +模型(9) | ( |
| 北美动物疾病传播模型(7) | ( |
| 澳大利亚动物疾病传播模型(3) | ( |
| 中央兽医研究所模型(2) | ( |
| 特劳尔森模型(2) | ( |
| Hayama模型(2) | ( |
| 多个模型(10) | ( |
下面是一个简短的描述的五大税模型(基于引文的数量确定的研究),强调他们是否适合本研究的总体目标。对于这些捐的更详细的描述模型,读者被称为原始引用中指定的表
针对手足口病的爆发,英国在2001年,之间的随机空间模型是模拟开发农场手足口病的传播(
华威模型被用来了解手足口病传播的风险预测因子(
戴维斯动物疾病(爸爸)模型是一种随机模拟空间仿真模型来模拟和评估替代手足口病控制缓解策略指定地理区域(
制定一个最优控制模型是基于爸爸结构评价控制策略手足口病在美国(
AusSpread是一个随机、空间运行的仿真模型在GIS环境中模拟群(之间的手足口病的传播
由于AusSpread模型的发展,它不断被用于FMD-free地区评估其它缓解策略(
InterSpread + (ISP)是一个随机、空间的仿真模型between-farm手足口病等传染病的传播(
ISP模型已被用于手足口病评估替代缓解策略(
北美动物疾病传播模型(NAADSM)是一个随机,空间模型在美国开发模型的between-farm传播传染性动物疾病如手足口病和CSF (
NAADSM是唯一开源税模型与一个用户友好的界面。它被用于FMD-free设置了解手足口病传播和评估其它缓解策略(
显示在表
税模型(表
比较9税模型用于手足口病的特点。
| 税模型 | 多个血清型 | 紧急疫苗接种 | 常规免疫接种 | 铲除 | 种群动态 |
|---|---|---|---|---|---|
| 沃里克 | × |
|
× |
|
× |
| 爸爸 | × |
|
× |
|
× |
| AusSpread | × |
|
× |
|
× |
| ISP | × |
|
× |
|
× |
| NAADSM | × |
|
× |
|
× |
| AADIS | × |
|
× |
|
× |
| CVI | × |
|
× |
|
× |
| 特劳尔森 | × |
|
× |
|
× |
| Hayama | × |
|
× |
|
× |
所有税评估模型的设计和应用FMD-free国家模拟手足口病的传播和评估其它缓解策略面对一个入侵。在这样一个应用程序中,模型假设只有一个血清型传播和使用血清型的过程参数。然而,在流行设置cocirculation多个血清型是手足口病流行病学的一个重要组成部分,它需要被添加作为一个选项为modeler包括过程参数(表并行多个血清型
此外,评估税模型(表
基于税模型的评估通过这个系统综述,很明显,这些模型应该适应合并以下控制策略,模型多个cocirculating种血清型,包括牲畜种群动态模拟过程中模仿流行手足口病现实。
发表原创研究描述或使用税模型(s)在本研究评估流行手足口病的识别特定的组件需要适应税模型的潜在应用在手足口病流行的设置。应该强调,当前的研究并没有审查所有模型,但只有税模型用于手足口病通过数据库搜索确认。尽管所有这些捐的假设模型进行了综述,只对地方的特性被认为是必要的元素。
从限制潜在的偏见可能会出现英文综述,发表的原始研究的文章,包括和特定类别的模型,即。,捐。许多不同类型的模型可以被选中,从确定性到自动机模型对非空间模型。应该强调,只包含税模型,因为它们能够捕捉时空异质性。然而,我们承认所有模型的工作在手足口病,我们决定包含一种类型的模型并不意味着其他模型没有有用的。
口蹄疫是流行在世界的一些地方
所有的税模型综述可以描述模型紧急疫苗接种作为缓解策略,但没有一个人可以模型以下通常周期性特有的设置和实践是依靠控制和根除的关键措施之一(
FMD-free国通常雇佣税模型准备计划和决策支持工具。通知这些决策,建模者和流行病学家不包括多个cocirculating血清型;因此,参数只有一个血清型是用来传播模型。尽管所有税模型实际模仿FMD-free的底层系统的国家,他们有能力有限适用于疾病流行时的条件。多个cocirculating种血清型,例如,在流行国家很常见(
在FMD-free国家,当这些税模型用于防备计划,扑杀通常是有或没有紧急疫苗接种工作。这些严格的行为与疾病跟踪,监测,和可用性的资源导致提示疾病控制和随后的根除,从而模拟结束在很短的时间内和种群动态影响不大。因此,建模者没有考虑种群动态模拟运行期间,因为它接近现实的无病设置。然而,当税模型将被用于流行设置,口蹄疫疫情将持续较长时间,将会花费更长的时间来控制疾病;因此,根除不能被认为是一个短期的目标。人口流动与手足口病相关动态,如群体免疫力。新生儿被添加到群,它增加的比例未接种疫苗的天真的主机,从而减少群体免疫(
在流行的设置,手足口病与重大经济损失(
建模是一个资源密集型的过程需要金融资源和专业技术。因为这个过程是密集的,它将是明智的采取一个模型为一个国家模仿建造另一个国家的情况。模型适应使用的参数可以是一个小变化参数对另一个国家在一个国家,或者它可能需要改变底层的代码和逻辑。着手模型适应之前,研究人员应该理解现有模型的目的以及适应模型。例如,NAADSM最近用于手足口病流行的设置及其底层代码已经修改为包含以下控制策略。修改后的建模框架仿真模型呼吁传染性动物疾病流行地区(SMIAD-ER)已经应用,作为一个示范,在巴基斯坦手足口病控制评估有效的缓解策略(
利用数据的位置和人口个体牲畜控股(
模型适应性提供了几个优势为modeler和最终用户。它提供了建模人员访问数据集,可用于模型验证。举例来说,在我们的经验中,修改NAADSM SMIAD-ER已生成驱动力和访问数据集,否则无法使用位置上的数据和人口等个人占有牲畜和联系网络。适应过程还提供了一个平台交换模型结果中研究人员,为终端用户提供机会等疾病建模者、决策者、流行病学家、和专家从流行国家
仿真建模是一个有用的工具来理解和评价口蹄疫的缓解策略。几个模型已经开发了解手足口病动态。可用文献仿真建模对手足口病通常限于FMD-free国家来说,和现有空间明确的手足口病随机模拟模型在他们的应用程序在流行前需要修改设置。更具体地说,这些模型应该适应,通过融合流行手足口病的组件模拟风土性。适应模型应该进行灵敏度分析,验证,验证和协议分析透明度和建立信誉。这样的模型的应用在疾病流行国家可以补充手足口病的控制,这将改善牲畜健康,为生产者提供经济收益,并帮助减少贫困和饥饿,这将补充努力实现可持续发展的目标。
手足口病
空间显式随机模拟(模型)
首选项报告系统评价和荟萃分析
戴维斯动物疾病模拟(模型)
丹麦技术University-Davis动物疾病模拟(模型)
北美动物疾病传播模型
InterSpread +(模型)
InterSpread(模型)
澳大利亚动物疾病传播(模型)
仿真模型对传染性动物疾病在流行地区
联合国粮食及农业组织()
世界动物健康组织
欧洲委员会对口蹄疫的控制
进步的口蹄疫的控制途径
谷歌学术搜索
网络的科学
常规预防接种疫苗
地理信息系统。
这是一个系统回顾;因此,没有原始数据使用的手稿。
作者宣称没有利益冲突。
作者要感谢赛迪斯基尔,兽医教学医院图书馆,科罗拉多州立大学,因为她的支持与数据库搜索(棱镜在补充材料清单(可用
补充材料提供了棱镜清单用于系统的审查过程。