组织病理学图像分类是疾病诊断最重要的步骤之一。我们提出了一种多级组织病理学图像分类方法基于深卷积神经网络被称为编码网络。它可以更好地表示组织病理学图像比只使用网络编码。培训的主要过程是深卷积神经网络提取高层特征,融合两个卷积层的高级功能多尺度高级特性。为了获得更好的性能和效率高,我们将采用稀疏autoencoder (SAE)和主分量分析(PCA),以减少维数的多尺度高级功能。我们评估该方法在一个真正的组织病理学图像数据集。我们的研究结果表明,该方法是有效的,优于编码网络。
医学图像分类是疾病诊断最重要的步骤之一。在本文中,我们将专注于组织病理学图像分类任务,这是医学图像分类的一个子集,可以为医生的疾病诊断提供有用的线索。徐et al。
为了提高组织病理学图像分类的效率和准确性,我们提出一个新的方法基于DCNN称为编码网络提取两层高级特性作为多尺度的高级特性。该方法受[
本文的其余部分组织如下。我们将描述的详细过程提取多尺度高级特性,给出一个有效的算法来减少维数的多尺度高级功能部分
我们的编码网络包含六个卷积层此前通过归一化层称为局部反应正常化参考(
编码的配置网络。
| 类型 | 内核大小/ strid | 输出的大小 |
|---|---|---|
| 卷积 | 7×7×3/1 | 134×134×32 |
| 卷积 | 7×7×32/1 | 128×128×32 |
| 马克斯池 | 5×5/2 | 62×62×32 |
| 卷积 | 9×9×32/1 | 54×54×64 |
| 马克斯池 | 5×5/2 | 25×25×64 |
| 卷积 | 7×7×64/1 | 19×19×64 |
| 卷积 | 7×7×64/1 | 13×13×128 |
| 马克斯池 | 6×6/2 | 4×4×128 |
| 卷积 | 4×4×128/1 | 1×1×256 |
| 完整连接 | 1×1×256/1 | 1×1×256 |
| Softmax层 | 1×1×6 |
在提取多尺度高级特性,编码网络意图提取高级特性。我们提取6卷积层和接触层与多尺度的高层特征相结合。第六届卷积层是固定的2048称为cfr,而接触层的尺寸是256称为ffr。它直接融合的病死率和ffr成一个特征向量可以继续喂到另一个softmax分类器分类组织病理学图像。
我们减少了多尺度的高层特征向量的维度基于以下考虑:
提取多尺度高级功能相结合两层高层特征编码网络会导致相当大的计算复杂度,因为他们的高维度。
此外,由于两种不同的高层特征提取编码网络,它也不可避免的带来了明显的相关性。
因此,我们将使用稀疏autoencoder (SAE)来减少多尺度高级特性,因为稀疏autoencoder可能获得更多的区别的特性由于减少高层特征之间的相关性。我们雇佣
主成分分析(PCA)是一个经典的数据降维算法在无监督特征学习领域。大量的工作(
真正的叫做SDT皮肤切片图像数据集,其中包含6类皮肤病图像是用来评估该方法的总体性能。数据集是由2019张图片,每张图片的RGB图像的大小
六类声波时差与发生数量数据集。
| 图像分类 | 数量的图片 | 标签 |
|---|---|---|
| 色素沉着过度的基底细胞层 | 162年 | T1 |
| 棘皮症 | 451年 | T2 |
| 角化不全 | 265年 | T3 |
| 角化过度 | 328年 | T4 |
| 浸润的淋巴细胞 | 597年 | T5 |
| 乳头瘤病 | 216年 | T6 |
在这一节中,有必要比较编码与多尺度网络高级特性证明算法的有效性和效率。此外,多尺度特性+ SAE (MSAE)将与多尺度特性+ PCA (MPCA)来验证降维的效率。定量评价如表所示
算法的整体精度的比较。
| 算法 | 项数据的准确性 |
|---|---|
| 网络编码 | 86.2% |
| MPCA | 92.6% |
| MSAE | 95.3% |
在表
在数据集SDT算法精度的比较。
| 标签 | 网络编码 | MPCA | MSAE |
|---|---|---|---|
| T1 | 80.0% | 88.8% | 94.0% |
| T2 | 88.7% | 95.5% | 97.3% |
| T3 | 87.6% | 97.3% | 98.4% |
| T4 | 84.2% | 89.4% | 96.5% |
| T5 | 88.0% | 91.8% | 93.3% |
| T6 | 84.3% | 90.7% | 92.5% |
图
平均AUC不同的算法。
| 算法 | 平均AUC不同的算法 |
|---|---|
| 网络编码 | 0.9671 |
| MPCA | 0.9855 |
| MSAE | 0.9912 |
不同的算法的混合矩阵。
网络编码的混合矩阵
MPCA的混淆矩阵
MSAE的混淆矩阵
不同的算法的ROC曲线在不同的标签。
我们提出一种多级组织病理学图像分类方法是基于多尺度特征。这种方法训练网络提取高级特性,结合一个卷积编码层特性和接触特性作为多尺度的高级特性。为了解决高维度的问题和加快算法的运行时间,我们使用SAE和主成分分析降低维数的多尺度特性。最后,我们评估数据集SDT上的方法,结果表明,MSAE优于PSAE和编码网络。在未来的工作中,我们将培训薮猫DCNNs整体学习,可以从这些DCNNs提取高级特性。具体来说,我们将设计一个深度学习框架称为多尺度高层框架,它获得的特性。与此同时,融合这些高级特性提要到分类器分类组织病理学图像。
作者宣称没有利益冲突。