三个hexacoordinated八面体镍(II)配合物,倪(sal-L-phe)(苯酚的)(CH3哦)]⋅CH3哦(
通常生物无机化学研究无机元素的相互作用与生物在分子水平上(
氨基酸希夫碱通常都是由氨基酸组成的具有不同醛或酮羰基组。席夫碱是一个多齿的配体,在医学和制药领域起着重要的作用[
苯丙氨酸是一种基本氨基酸对人类和其他生物。氨基酸侧链的芳环,如苯丙氨酸主要有助于蛋白质通过疏水相互作用和形成的稳定的亲水环境(
镍是人体必不可少的微量元素,以及近年含镍(II)中发挥重要的生理功能的生物(
脱氧核糖核酸(DNA)是一种重要的生物分子。表达的生物信息存储在DNA的复制、转录和翻译。这些信息有能力引导细胞生长,代谢和突变。许多小分子发挥其抗癌活动通过与DNA结合,从而改变DNA复制,阻断肿瘤细胞的分裂,导致细胞死亡(
鉴于上述考虑,我们有三个新镍(II)配合物的合成席夫碱来自苯丙氨酸和芳香醛的反应。这些配合物的元素分析、红外(IR)光谱,和单晶x射线衍射。此外,这些配合物与小牛胸腺DNA的相互作用(CT-DNA)和超氧化物清除活动通过使用光谱进行了调查。
L-phenylalanine来自北京京科宏达生物科技有限公司有限公司水杨醛,
Tris-HCl(10毫米)(10毫米氯化钠,pH = 7.1)缓冲溶液和双重蒸馏水制备。CT-DNA在缓冲溶液吸光度比了260和280海里(
红外光谱被记录为那些时光5700 KBr丸在Nicolet傅立叶变换红外光谱仪器的频率范围400 - 4000厘米−1。配合物的荧光光谱和电子记录用日本岛津公司uv - 2550分光光度计和PerkinElmer LS55荧光谱仪,分别。圆二色性(CD)光谱得到Jasco j - 810分光偏振计。
L-phenylalanine (0.1652 g, 1更易)和氢氧化钾(0.056 g, 1更易)溶解在甲醇(20毫升)在323 K和添加到甲醇溶液(5.0毫升)的水杨醛(0.11毫升,1更易)和搅拌1 h。然后,解决方案(2.0毫升)的四水合乙酸镍(II) (0.25 g, 1更易)添加一滴一滴地和连续搅拌2 h。最后,甲醇溶液(4.0毫升)的1,10-phenanthroline (0.180 g, 1更易)补充道,不断搅拌3 h。最终的解决方案是过滤,滤液在室温下放置了两个星期;绿色块适合x射线单晶衍射分析。肛交。calc。(%)为C30.H29日N3O5倪先生(= 570.27):C, 63.19;H, 5.13;和N, 7.37%。发现:C, 63.31;H, 5.20;和N, 7.26%。红外(KBr, 4000 - 400厘米−1):3384.9(年代,
解决L-phenylalanine (0.1652 g, 1更易)、氢氧化钾(0.056 g, 1更易)和2-hydroxy-1-naphthaldehyde (0.1722 g, 1更易)在无水甲醇(20毫升)被加热在323 K 1 h。然后,一个解决方案(2.0毫升)的四水合乙酸镍(II) (0.25 g, 1更易)添加一滴一滴地和搅拌连续2 h。最后,甲醇溶液(5.0毫升)的1,10-phenanthroline(0.20克,1.0更易)补充道,不断搅拌3 h。最终的解决方案是过滤,棕色晶体适合x射线衍射分析得到的滤液保持在正常大气温度两个星期。肛交。calc。(%)为C33H27N3O4倪先生(= 588.28):C, 67.38;H, 4.63;和N, 7.14%。发现:C, 67.29;H, 4.71;和N, 7.08%。红外(KBr, 4000 - 400厘米−1):3423.4(年代,
合成路线制备的复合物
合成路线制备的复合物
这些x射线单晶衍射测量镍(II)配合物被记录在一个力量聪明1000 CCD area-detecting衍射仪。衍射强度的镍(II)配合物收集使用graphite-monochromated莫K
为复合物晶体结构和细化数据
| 复杂的 |
|
|
|
|---|---|---|---|
| 经验公式 | C30.H29日N3O5倪 | C33H27N3O4倪 | C95年H101年N9O20.倪3 |
| 分子量 | 570.27 | 588.28 | 1864.98 |
| 波长(A) | 0.71073 | 0.71073 | 0.71073 |
| 晶系 | 单斜晶体的 | 三斜晶系的 | 三斜晶系的 |
| 空间群 | C2 / c | p - 1 | p - 1 |
|
|
26.741 (3) | 10.8240 (8) | 12.7068 (10) |
|
|
18.1651 (17) | 11.9041 (9) | 13.5015 (14) |
|
|
11.8350 (9) | 13.0879 (11) | 29.9214 (17) |
|
|
90年 | 67.226 (10) | 83.667 (2) |
|
|
108.528 (2) | 73.566 (2) | 82.7470 (10) |
|
|
90年 | 64.094 (10) | 63.9790 (10) |
|
|
5450.9 (8) | 1385.43 (19) | 4567.4 (6) |
| Z | 8 | 2 | 2 |
|
|
1.390 | 1.410 | 1.356 |
|
|
2384年 | 612年 | 1956年 |
| 吸收系数(毫米−1) | 0.756 | 0.744 | 0.687 |
| 水晶大小(毫米) | 0.43×0.38×0.35 | 0.23×0.20×0.12 | 0.25×0.21×0.18 |
|
|
2.66到25.02 | 2.19到25.01 | 2.57到25.02 |
| 指数范围 | -25年≤ |
-12年≤ |
-15年≤ |
| -21年≤ |
-14年≤ |
-16年≤ |
|
| -13年≤ |
-15年≤ |
-35年≤ |
|
| 反射收集 | 13562年 | 7109年 | 29803年 |
| 独特的思考 | 4816年 | 4791年 | 16112年 |
|
|
0.0432 | 0.0335 | 0.1085 |
| 最大/最小传输 | 0.7777,0.7368 | 0.9160,0.8475 | 0.8863,0.8470 |
| 数据、约束参数 | 4816年,366 | 4791,0,363 | 16112、2613、1155 |
| 上的拟合优度 |
1.094 | 0.952 | 1.010 |
| 最后 |
|
|
|
|
|
|
|
|
| (e·diff.最大峰值和洞−3) | 0.392−0.287 | 1.099−0.500 | 0.788−0.500 |
晶体结构分析的数据这些镍(II)配合物已经存入剑桥晶体数据中心(CCDC没有。929664 (
这些复合物的结合实验与CT-DNA进行10 mM Tris-HCl / 10毫米氯化钠(pH = 7.1)缓冲溶液。紫外可见吸收光谱的测定进行了通过添加越来越多的DNA(从0到9.0×10−5米),这些复合物固定浓度为1.5×10−5M。光谱测量的波长范围200−500海里。
荧光光谱,我们准备了样品的不同浓度Tris-HCl缓冲溶液通过保持恒定浓度EB-DNA系统(
CD光谱,一系列样本准备通过添加这些配合物浓度的增加不断的DNA浓度(10.0毫米)Tris-HCl缓冲溶液。示例解决方案都是在220 - 320纳米的范围扫描的扫描速度200 nm·分钟−1。每个CD光谱测定的平均值三个扫描分辨率为1.0 nm路径和1响应时间。CD谱仪的光学腔是缺氧干燥氮气使用前和保存在氮气氛中实验。最后的光谱被减去相应的缓冲background-corrected光谱。
粘度实验进行一个Ubbelodhe粘度计30°C的恒温恒温浴。一系列的样本准备使用Tris-HCl缓冲溶液。CT-DNA的浓度(10.0毫米)保持不变,而比率
这些配合物的超氧化物歧化酶(SOD)活性测定通过测量他们对超氧化物阴离子自由基的清除程度。不同浓度的缺失和存在的这些复合物,包含6.2标准的测试解决方案
配合物的红外光谱
标题配合物的红外光谱谱
图
配合物的分子结构
在复杂的
有三个结构相同的复杂的分子结构单元的复杂
鉴于所有这些观察,每个不对称结构单元在复合物
选择键长(A)和键角(°)复合物
| 复杂的 |
|||||
| 倪(1)- o (3) | 1.990 (2) | 倪(1)- n (1) | 1.991 (3) | 倪(1)- o (1) | 2.068 (3) |
| 倪(1)- n (3) | 2.075 (3) | 倪(1)- n (2) | 2.116 (3) | 倪(1)- o (4) | 2.117 (3) |
| O(3)镍(1)- n (1) | 92.43 (11) | O(3)镍(1)- O (1) | 173.63 (10) | N(1)镍(1)- o (1) | 81.29 (11) |
| O(3)镍(1)- n (3) | 93.55 (11) | N(1)镍(1)- N (3) | 172.77 (11) | O(1)镍(1)- n (3) | 92.64 (11) |
| O(3)镍(1)- n (2) | 91.84 (11) | N(1)镍(1)- N (2) | 96.26 (12) | O(1)镍(1)- n (2) | 87.84 (10) |
| N(3)镍(1)- N (2) | 79.50 (12) | O(3)镍(1)- O (4) | 89.99 (11) | N(1)镍(1)- o (4) | 92.72 (11) |
| O(1)镍(1)- O (4) | 91.34 (11) | N(3)镍(1)- o (4) | 91.33 (11) | N(2)镍(1)- o (4) | 170.75 (11) |
|
|
|||||
| 复杂的 |
|||||
| 倪(1)- n (1) | 1.987 (3) | 倪(1)- o (3) | 1.997 (3) | 倪(1)- o (1) | 2.068 (3) |
| 倪(1)- n (3) | 2.083 (3) | 倪(1)- o (4) | 2.100 (3) | 倪(1)- n (2) | 2.129 (3) |
| N(1)镍(1)- o (3) | 89.99 (12) | N(1)镍(1)- o (1) | 81.80 (12) | O(3)镍(1)- O (1) | 171.26 (10) |
| N(1)镍(1)- N (3) | 175.09 (12) | O(3)镍(1)- n (3) | 94.34 (11) | O(1)镍(1)- n (3) | 93.75 (11) |
| N(1)镍(1)- o (4) | 90.64 (13) | O(3)镍(1)- O (4) | 92.52 (12) | O(1)镍(1)- O (4) | 90.56 (12) |
| N(3)镍(1)- o (4) | 91.50 (13) | N(1)镍(1)- N (2) | 98.70 (12) | O(3)镍(1)- n (2) | 90.17 (11) |
| O(1)镍(1)- n (2) | 88.13 (11) | N(3)镍(1)- N (2) | 78.99 (12) | O(4)镍(1)- n (2) | 170.29 (12) |
|
|
|||||
| 复杂的 |
|||||
| 倪(1)- n (1) | 2.000 (6) | 倪(1)- o (3) | 2.003 (5) | 倪(1)- o (1) | 2.053 (5) |
| 倪(1)- n (3) | 2.076 (6) | 倪(1)- n (2) | 2.131 (6) | 倪(1)- o (5) | 2.146 (5) |
| 倪(2)- n (4) | 1.982 (6) | 倪(2)- o (8) | 1.992 (5) | 倪(2)- o (6) | 2.059 (5) |
| 倪(2)- n (6) | 2.075 (7) | 倪(2)- o (10) | 2.113 (5) | 倪(2)- n (5) | 2.116 (6) |
| 倪(3)- n (7) | 1.995 (7) | 倪(3)o (13) | 2.008 (5) | 倪(3)o (11) | 2.056 (6) |
| 倪(3)- n (8) | 2.084 (7) | 倪(3)o (15) | 2.099 (6) | 倪(3)- n (9) | 2.114 (7) |
| N(1)镍(1)- o (3) | 92.3 (2) | N(1)镍(1)- o (1) | 82.0 (2) | O(3)镍(1)- O (1) | 173.3 (2) |
| N(1)镍(1)- N (3) | 169.9 (2) | O(3)镍(1)- n (3) | 93.2 (2) | O(1)镍(1)- n (3) | 92.9 (2) |
| N(1)镍(1)- N (2) | 92.6 (2) | O(3)镍(1)- n (2) | 96.1 (2) | O(1)镍(1)- n (2) | 87.8 (2) |
| N(3)镍(1)- N (2) | 78.4 (2) | N(1)镍(1)- o (5) | 95.3 (2) | O(3)镍(1)- O (5) | 90.31 (18) |
| O(1)镍(1)- O (5) | 86.70 (19) | N(3)镍(1)- o (5) | 93.2 (2) | N(2)镍(1)- o (5) | 169.7 (2) |
| N(4)倪(2)- o (8) | 92.7 (2) | N(4)倪(2)- o (6) | 81.3 (2) | O(8)倪(2)- O (6) | 174.0 (2) |
| N(4)倪(2)- N (6) | 171.7 (2) | O(8)倪(2)- n (6) | 93.3 (2) | O(6)倪(2)- n (6) | 92.7 (2) |
| N(4)倪(2)- o (10) | 93.9 (2) | O(8)倪(2)- O (10) | 90.41 (19) | O(6)倪(2)- O (10) | 89.3 (2) |
| N(6)倪(2)- o (10) | 91.6 (2) | N(4)倪(2)- N (5) | 95.0 (2) | O(8)倪(2)- n (5) | 90.8 (2) |
| O(6)倪(2)- n (5) | 90.5 (2) | N(6)倪(2)- N (5) | 79.3 (3) | O(10)倪(2)- n (5) | 170.9 (3) |
| N(7)倪(3)o (13) | 91.9 (2) | N(7)倪(3)o (11) | 80.3 (3) | O(13)倪(3)O (11) | 171.9 (2) |
| N(7)倪(3)- N (8) | 169.6 (3) | O(13)倪(3)- n (8) | 96.3 (2) | O(11)倪(3)- n (8) | 91.6 (2) |
| N(7)倪(3)o (15) | 94.9 (3) | O(13)倪(3)O (15) | 89.3 (2) | O(11)倪(3)O (15) | 89.1 (2) |
| N(8)倪(3)o (15) | 91.6 (3) | N(7)倪(3)- N (9) | 95.4 (3) | O(13)倪(3)- n (9) | 91.4 (2) |
| O(11)倪(3)- n (9) | 91.6 (2) | N(8)倪(3)- N (9) | 78.1 (3) | O(15)倪(3)- n (9) | 169.6 (3) |
2 d复合物超分子网络
氢键长度(A)和键角(°)复合物
| D−H⋯ |
|
|
|
∠(DHA) |
|---|---|---|---|---|
| 复杂的 |
||||
| O4-H4⋯O2# 1 | 0.82 | 1.79 | 2.609 (4) | 173.4 |
| C26-H26⋯O4 | 0.93 | 2.60 | 3.141 (5) | 117.9 |
| O (5′) - h (5′)⋯O (2) | 0.82 | 2.15 | 3.175 (5) | 136.8 |
| O (5) - h (5)⋯O (2) | 0.82 | 2.02 | 2.765 (8) | 149.9 |
|
|
||||
| 复杂的 |
||||
| O4-H4⋯O2# 1 | 0.82 | 1.76 | 2.576 (4) | 170.4 |
| C32-H32⋯O2# 3 | 0.93 | 2.36 | 3.274 (5) | 166.8 |
| 复杂的 |
||||
|
|
||||
| O (16) - h (16)⋯O (2) | 0.82 | 2.03 | 2.828 (10) | 163.2 |
| O (15) - h (15)⋯O (18)# 4 | 0.82 | 1.83 | 2.640 (10) | 171.2 |
| (5)- h (5)⋯O (7)# 5 | 0.82 | 1.93 | 2.697 (8) | 154.2 |
| O (10) - h (10)⋯O (12)# 5 | 0.82 | 1.78 | 2.588 (8) | 169.9 |
| O (17) - h (17)⋯O (2)# 6 | 0.82 | 2.00 | 2.733 (9) | 148.3 |
| O (19) - h (19)⋯O (7)# 6 | 0.82 | 2.03 | 2.853 (9) | 177.6 |
| O (18) - h (18)⋯O (11)# 6 | 0.82 | 1.86 | 2.659 (9) | 166.1 |
| O (20) - h (20)⋯O (13)# 7 | 0.82 | 2.06 | 2.884 (12) | 179.0 |
| O (20) - h (20)⋯O (14)# 7 | 0.82 | 2.55 | 2.966 (12) | 112.5 |
对称密码的复杂:# 1:0.5−
电子吸收光谱是一种常用的方法为研究小分子与DNA的相互作用。在DNA的存在,微环境的配体复杂的影响,从而导致吸收强度和波长的变化复杂。一般来说,紫外可见吸收光谱不改变明显,当金属络合物与DNA相互作用通过静电或海沟交互。但是复杂的吸收峰发生红移和吸收强度降低时,金属络合物与DNA相互作用的夹层(
复合物的紫外可见光谱
为了测量DNA结合的强度与复杂的定量,内在绑定常数(
溴化乙锭(EB)是一个经典的嵌入式荧光探针,研究药物分子与DNA的相互作用。本身是弱荧光,但发色团是嵌入在碱基对DNA分子的荧光强度增强。复杂的添加到EB-DNA系统时,它可以与DNA相互作用和与EB争夺DNA结合,导致荧光强度的降低EB-DNA系统。因此,我们可以推断出复杂的交互模式与DNA通过观察荧光体系的变化的程度。如图
荧光猝灭光谱EB绑定到CT-DNA复合物
Stern-Volmer的荧光猝灭曲线。
CD光谱是最重要的手段之一,研究小分子与DNA的相互作用,探索DNA构象的变化通过测量不同左、右圆偏振光的吸收(
复合物的影响
粘度测定是一种独特的方法来确定的绑定模式复杂的DNA。相邻的碱基对之间的距离增加时,复杂的与DNA相互作用,和小分子的插入过程的复杂。DNA的双螺旋结构细长,粘度增加。相比之下,DNA的双链结构弯折,粘度降低复杂时插入到DNA碱基对通过部分插入或坡口焊接,而槽表面的影响模式或静电作用对粘度的影响较小。DNA溶液的粘度的变化随着浓度的复合物在图所示
越来越多的复合物的影响
从上述结果,我们可以得出这样的结论:DNA结合能力这三个配合物在复杂的顺序
氯化nitrotetrazolium蓝色(电视台)光还原法是一种常用的方法来确定SOD的活性。核黄素(VB2与tetramethylethylenediamine)反应生成超氧化物阴离子自由基光条件下:VB2+ (CH3)2NCH2CH2N (CH3)2→O2·−。超氧化物阴离子自由基可以减少电视台蓝紫色相比化合物命名甲瓒。560 nm的吸光度与甲瓒的浓度成正比。因此,可以得到一条直线通过测量吸光度
配合物的浓度的影响
配合物的抑制率
三个新的镍(II)配合物,倪(sal-L-phe)(苯酚的)(CH3哦)]⋅CH3哦(
使用的数据来支持本研究的发现可以从相应的作者。
作者宣称他们没有利益冲突有关的出版。
这个项目是由中国山东省自然科学基金(Y2004B02号和ZR2016HB73)和聊城大学的本科生进入科技创新和文化创新基金会(没有。26312160514)。
图S1:席夫碱的质谱