AV 病毒学的进步 1687 - 8647 1687 - 8639 Hindawi出版公司 10.1155 / 2015/714062 714062年 研究文章 循环中混合病毒感染住院患者呼吸道感染在科威特 艾萨 萨哈尔 1 Owayed 阿卜杜拉 2 Altawalah Haya 3 Khadadah Mousa 4 Behbehani 纳赛尔 4 Al-Nakib Widad 1 莫里森 特鲁迪 1 微生物学系 医学院 科威特大学 24923年Safat 科威特 kuniv.edu 2 儿科 医学院 科威特大学 24923年Safat 科威特 kuniv.edu 3 病毒学单位 穆巴拉克医院 卫生部 24923年Safat 科威特 moh.gov.kw 4 医学系的 医学院 科威特大学 24923年Safat 科威特 kuniv.edu 2015年 23 4 2015年 2015年 02 02 2015年 26 03 2015年 30. 03 2015年 23 4 2015年 2015年 版权©2015年萨哈尔艾萨等。 这是一个开放的文章在知识共享归属许可下发布的,它允许无限制的使用,分布和繁殖在任何媒介,提供最初的工作是正确的引用。

本研究的目的是确定病毒混合检测的频率在住院患者呼吸道感染和病毒混合评价相关性检测和临床严重程度。住院患者呼吸道感染(RTI)调查了15呼吸道病毒通过敏感的分子技术。总共3天至80岁的850名住院患者筛选从2010年9月到2014年4月。在351名(47.8%)患者诊断为病毒感染,病毒混合检测确定了49例(14%),与人类鼻病毒(HRV)最常见的病毒与病毒混合检测(7.1%),其次是腺病毒(副词)(4%)和人类coronavirus-OC43 (HCoV-OC43) (3.7%)。最高的病毒混合组合检测被确认HRV,副词(2%),其次是HRV和HCoV-OC43 (1.4%)。肺炎和毛细支气管炎是最常见的住院原因与病毒混合检测(9.1%)。有统计学意义的差异混合和单一检测患者诊断为毛细支气管炎( P = 0.002 )和肺炎( P = 0.019 )。我们的发现可能表明一个重要呼吸道病毒混合检测之间的联系和发展中更严重的下呼吸道感染的可能性细支气管炎和肺炎等相比,单一的检测。

 1。介绍

分子技术的进步为呼吸道病毒的识别允许快速和特定的诊断患者呼吸道感染的重要管理(RTI) [ 1, 2]。聚合酶链反应(PCR)技术已被确定为一个适当的工具识别的呼吸道病毒所示许多研究[ 3- - - - - - 5]。呼吸道病毒感染是全球一个主要公共卫生问题,因为它们发生,易于传播在社区里,和相当大的发病率和死亡率 6, 7]。混合呼吸道病毒检测的频率从10%变化到30%住院儿童( 8- - - - - - 11]。几项研究表明混合检测与增加疾病和/或临床严重程度( 9, 12- - - - - - 15]。其他人提出的缺失之间的关系混合呼吸检测和增加疾病和/或临床严重程度( 16, 17]。

呼吸道病毒等人类鼻病毒(HRV)、呼吸道合胞体病毒(RSV)、甲型流感病毒(暗礁),乙型流感病毒(失策),副流感病毒virus-1 (PIV-1),副流感病毒病毒2 (PIV-2),副流感病毒virus-3 (PIV-3),人类coronavirus-OC43 (HCoV-OC43),人类冠状病毒- 229 e (hcov - 229 e)和腺病毒(副词)被认为是RTI的病原体 3, 18]。病毒的小组负责RTI扩展更多的取决于包括更多的病毒,如人类metapneumovirus (hMPV) [ 19, 20.],HCoV-NL63 [ 21, 22),人类bocavirus(博卡)[ 23, 24),人类多瘤病毒KI (KIV),和吴多瘤病毒(WUV) [ 25, 26]。

本研究的目的是确定病毒混合检测的频率与RTI和住院病人评估病毒混合检测和临床严重程度之间的相关性。

 2。方法和材料 2.1。研究人群

这项研究包括850名住院儿童和成人患者上呼吸道感染(URTI)或下呼吸道感染(下呼吸道感染)穆巴拉克建筑业医院,科威特。所有患者住院期间与RTI筛选从2010年9月到2014年4月。在医院标本收集和存储在病毒学−70°C到加工单位,医学院,科威特大学使用PCR技术检测病毒核酸的存在。患者的年龄介于3天至80年。大多数的样本收集在秋季和冬季。秋天在科威特是9月至11月,冬天在12月和3月之间。

 2.2。临床样本

鼻咽拭子标本URTI和支气管肺泡灌洗后收集下呼吸道感染住院患者获得书面知情同意。伦理被授予的权限来执行这项研究研究健康科学中心和科威特研究所医学专业化(金)联合委员会保护人类受试者的研究。临床资料收集从病历使用统一的数据收集形式。

 2.3。分子检测呼吸道病毒 2.3.1。提取方法

核酸提取是使用自动化核酸提取方法,麦格纳纯LC 2.0(瑞士罗氏诊断有限公司,Rotkreuz)。所有850呼吸道样本提取使用麦格纳纯LC总核酸隔离设备(罗氏应用科学,曼海姆,德国)根据制造商的指示。提取导致60 μL病毒核酸的洗出液储存在−70°C到处理。

确定病毒的存在从呼吸道病毒核酸进行描述之前( 4]。简单地说,一个单一PCR用于检测腺病毒、副流感病毒病毒2 (PIV-2);双工进行了PCR检测甲型和乙型流感病毒;三缸进行了PCR检测呼吸道合胞体病毒(RSV)和副流感病毒病毒(PIV) 1和3,和另一个三层进行PCR检测人类鼻病毒和人类冠状病毒- 229 e和coronavirus-OC43。

 2.3.2。PCR和rt - PCR检测的新发现的呼吸道病毒

从临床标本核酸提取,测定hMPV RNA的存在进行了使用引物被Ordas et al。 27]。西红柿HCoV-NL63 RNA检测用引物所描述的et al。 28],博卡DNA检测用引物被Allander et al。 23]。引物用于检测KIV和WUV DNA以前Allander等人所描述的和Bialasiewicz et al。 25, 26]。

 2.3.3。PCR和rt - PCR条件

60分钟的RT执行步骤10 37°C μ包含1 x L反应体积GeneAmp RNA PCR缓冲,5 μL (MgCl 25毫米2,每个deoxynucleoside三磷酸的1毫米,2.5 μ0.5 M随机五个一, μL核糖核酸酶抑制剂,3 μ2.5 L的病毒核酸,U / μL逆转录酶酶(GeneAmp RNA核心设备;应用生物系统公司,芝加哥,IL)。逆转录酶的热失活后5分钟90°C,整个反应混合物用于PCR总量的50 μl . MgCl反应混合物成分是2毫米2解决方案,1 x PCR缓冲包含0.02 pg的正向和反向引物,和0.05 μ5 U / L μL Ampli Taq DNA聚合酶(美国匹兹堡热费希尔科学)。PCR进行如下:94°C变性1分钟,其次是40变性的周期为30秒94°C,退火在50°C,持续30秒,30秒72°C,伸长和最后一个在72°C扩展7分钟。水是用来代替核酸作为一个消极的控制。每个PCR的特异性PCR成立写明ATCC参考格式使用一组病毒检查大旧呼吸道病毒。DNA模板(110 - 140个基点,热科学)包括退火网站使用的引物和探针的积极控制检测核酸从HCoV-NL63 hMPV,博卡,WUV, KIV。

 2.4。统计分析

数据分析使用社会科学统计软件包(SPSS 20.0版,IBM公司,阿蒙克,纽约,美国)。连续变量的描述性统计使用非参数Mann-Whitney比较 U 测试或克鲁斯卡尔-沃利斯检验。为分类变量,卡方或确切概率法 Z 以及应用于测试之间的差异比例或评估协会是否存在之间的比例。双尾概率值 P < 0.05 被认为是具有统计学意义。

 3所示。结果

总人数的850名住院患者三百五十一例(47.8%)诊断为病毒性呼吸道感染,210(59.8%)的男性和141(40.2%)是女性。结果表明,从408年351例病毒检测。表 1显示HRV是最临床呼吸道标本中检测到病毒患者的呼吸道症状(41.6%),其次是暗礁(15.1%)、RSV(13.1%),和HCoV-OC43 (12.3%)。351名住院病人中检测到病毒混合检测49例(14%)。HRV与混合是最常见的病毒检测(7.1%),紧随其后的是副词(4%)、HCoV-OC43 (3.7%)、RSV(3.1%),和暗礁(2.8%)(表 1)。

临床表现的患者混合和单一的病毒检测12呼吸道病毒。

病毒 URTI 支气管炎 细支气管炎 肺炎 下呼吸道感染 总 l l l 总额(%) ∗ ∗
混合检测 单一的检测 混合检测 单一的检测 混合检测 单一的检测 混合检测 单一的检测 混合检测 单一的检测 混合检测 单一的检测 病毒检测
WUV 2 0 0 3 2 3 2 1 4 7 6 (1.7) 7 (2) 13 (3.7)
KIV 1 1 1 1 1 0 1 0 3 1 4 (1.1) 2 (0.6) 6 (1.7)
博卡 0 5 2 3 3 5 1 0 6 8 6 (1.5) 13 (3.7) 19日(5.4)
HCoV-OC43 1 9 1 13 4 3 7 5 12 21 13 (3.7) 30 (8.5) 43 (12.3)
hcov - 229 e 0 1 0 5 2 5 1 0 3 10 3 (0.9) 11 (3.1) 14 (4)
阿德 2 4 3 6 4 3 5 3 12 12 14 (4) 16 (4.6) 30 (8.5)
暗礁 4 5 2 11 3 8 1 19 6 38 10 (2.8) 43 (12.3) 53 (15.1)
RSV 3 9 2 0 3 19 3 7 8 26 11 (3.1) 35 (10) 46 (13.1)
PIV-3 1 2 0 2 1 2 0 2 1 6 2 (0.6) 8 (2.3) 10 (2.8)
HRV 2 5 2 39 8 45 13 32 23 116年 25 (7.1) 121 (33.9) 146 (41.6)
PIV-1 0 1 0 1 1 1 1 1 2 3 2 (0.6) 4 (1.1) 6 (1.7)
hMPV 4 5 1 8 0 3 1 0 2 11 6 (1.7) 16 (4.6) 22日(6.3)
总额(%)__ 20 (19.6) 47 (15.4) 14 (13.7) 92 (30.1) 32 (31.4) ∗ 97 (31.7) 36 (35.3) ∗ 70 (22.9) 82 (80.3) 259 (84.6) 102 (25) 306 (75) 408年

__ 括号中的数字表示的数量检测发生率(单一或混合)相对于总(单一或混合)检测的数量百分比的发生率。

∗ ∗ 括号中的数字表示的数量检测发生率与患者的总数( n = 351年 )的百分比。

∗ 统计显著性差异单一和混合检测患者诊断为细支气管炎和肺炎 P < 0.05 。

有趣的是,四个病人三重混合病毒检测。第一个病人是感染了博卡,HCoV-OC43 HRV,第二个病人被诊断为WUV,博卡,和hcov - 229 e,第三个是感染HCoV-OC43,暗礁,HRV,第四个KIV感染病人,RSV, hMPV。

表 2显示病毒混合的频率检测49例。最高的病毒混合组合检测被确认HRV,副词在7例(2%),其次是HRV和HCoV-OC43 5例(1.4%),与HRV和暗礁4例(1.1%)。

病毒混合频率检测12呼吸道病毒。

病毒 WUV KIV 博卡 HCoV-OC43 HCoV-E229 阿德 暗礁 RSV PIV-3 HRV P1V-1 hMPV
WUV
KIV - - - - - -
博卡 1 - - - - - -
HCoV-OC43 - - - - - - 1 1
hcov - 229 e 1 - - - - - - 1 - - - - - -
阿德 - - - - - - 1 1 3 - - - - - -
暗礁 1 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1
RSV 1 1 - - - - - - 3 - - - - - - - - - - - - 2
PIV-3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1
HRV 1 - - - - - - 2 5 1 7 4 3 - - - - - -
P1V-1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1
hMPV 1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1 1 - - - - - - 1 1 1
总 ∗ 6 4 6 13 3 14 10 11 2 25 2 6

数据的样本阳性病毒混合检测。

∗ 为每一个病毒的混合检测总数。

从49例(14%)患者检测混合,33(9.4%)是男性(32名患者(9.1%)双检测和一个病人(0.3%)与三重检测),16(4.6%)是女性(14例(4%)和双检测和2例(0.6%)与三重检测)(表 3)。

分布的患者未被发现,单身,和混合检测与年龄、性别、住院。

未被发现 单一的检测 混合检测
患者编号为499 (%) ∗ 患者编号为302 (%) ∗ ∗ 病人数量49 (%) ∗ ∗
年龄(岁)
< 1 90 (18) 148 (42.2) 20 (5.7)
1 - 14 144 (29) 66 (18.8) 17 (4.8)
≥15 265 (53.1) 88 (25.1) 12 (3.4)
性别
男性 276 (55.3) 177 (50.4) 33 (9.4)
女 223 (44.7) 125 (35.6) 16 (4.6)
医院单位
加护病房 184 (36.9) 36 (10.3) 6 (1.7)
PICU 175 (35.1) 91 (30) 11 (3.1)
病房 139 (27.9) 175 (50) 32 (9.1)

∗ 括号中的数字表示的数量未被发现的病毒感染与患者的总数( n = 499年 )的百分比。

∗ ∗ 括号中的数字表示的数量检测到病毒感染与患者的总数( n = 351年 )的百分比。

ICU:重症监护室。

PICU:儿科重症监护室。

总共20的49(5.7%)混合病毒检测患者年龄< 1年(18例(5.1%)和双检测和2例(0.6%)与三重检测),17个病人(4.8%)1 - 14年(16例(4.6%)和双检测和一个病人(0.3%)与三重检测),和12例(3.4%)≥15双病毒检测(表 3)。总的来说,大多数的病毒检测混合,达到8.5% ( n = 30. ),是≤5岁的儿童。表 4显示了平均年龄的分布、范围和智商的混合检测为每个患者病毒。年龄中位数是< 1年博卡,HCoV-OC43 RSV而对于吴,副词,暗礁,PIV-3, HRV,和hMPV 1 - 11.5年。此外,对于其他呼吸道病毒KI, hcov - 229 e, PIV-1≥15岁。

年龄分布的混合检测呼吸道病毒。

病毒 年龄中位数 ∗ 范围 智商
WUV 11.5 3 - 68 4-35
KIV 19.5 1-45 1 -
博卡 0 0 - 3 0 - 2
HCoV-OC43 0.5 0-38 鹿
hcov - 229 e 50 3 - 80 3 - 65
阿德 4 0 - 70 约
暗礁 4.5 0-60 0-45
RSV 0 0-24 0 - 1
PIV-3 2 0 - 80 0-24
HRV 1 0 - 80 0-19
PIV-1 36 33-39 33-36
hMPV 1 0 - 68 0-21

∗ 年龄中位数= 0(零编码为< 1年)。

智商:四分位范围。

混合病毒检测中确定17个病人(4.8%),肺炎(15例(4.3%)和双病毒检测和2例(0.6%)与三重检测),15例(4.8%)与毛细支气管炎(14例(4%)和双病毒检测和一个病人(0.3%)与三重检测),10位病人(2.8%)与URTI遭受双重病毒检测,7例(2%)和呼吸窘迫(RD)都遭受了双重病毒混合检测(表 3)。大多数调查呼吸道病毒感染的影响下呼吸道(39例或11.1%)而不是上呼吸道(10位病人,或2.8%)。肺炎和毛细支气管炎是最常见的住院原因与病毒混合检测(32名患者或9.1%)。表 1比较患者的临床表现复杂,单一的病毒检测。有统计学意义的差异混合和单一检测患者诊断为毛细支气管炎( P = 0.002 )和肺炎( P = 0.019 )。

大多数患者(32或9.1%)进入病房的住院患者,其次是儿科重症监护室针对新生儿重症监护室医生(儿童重症监护室医生)(11个患者或3.1%),和重症监护病房(ICU)患者(6或1.7%)(表 3)。

病毒的发病高峰混合检测被确认在11月(15发生率的检测或14.7%),其次是1月和6月(14事件的检测每一个或13.7%)。发病率最低的是发现在8月份(2的检测或2%)和病毒混合检测被确认在7月(图 1)。

每月病毒混合分布检测。

 4所示。讨论

病毒感染的分子技术的使用提高了识别的混合病毒检测在一个样本( 29日]。在这项研究中,我们评估了病毒混合检测在科威特的发病率在半连续三年,2010年9月到2014年4月通过PCR技术在儿童和成人URTI和下呼吸道感染住院。的整体流行病毒混合检测在科威特RTI的住院病人中是14%。混合病毒检测的频率大约是下呼吸道感染比URTI高出8%。从已发表的研究使用分子诊断呼吸道病毒混合检测报告,没有其他研究符合我们的研究人群(儿童和成人)或临床表现(URTI和下呼吸道感染)。一个以社区为基础的研究在济南,中国,720年的住院病人和门诊病人样本RTI为期一年的期间确认95年病毒混合检测样品(13.19%)。同时,在本研究下呼吸道感染的病毒正率大约是20%高于URTIs [ 9]。在最近的一项研究中48%(140/292)的儿童和成人急性下呼吸道感染住院,样本病毒混合检测,观察在8%(22/292)的样品 10]。131年另一项最新研究样本主岁儿童急性RTI, 19(14.5%)与混合病毒检测( 11]。

所涉及的三个主要病原体混合病毒检测HRV,副词,HCoV-OC43。类似的结果被报道,他们发现了HRV,副词,HCoV-OC43所涉及的主要病毒混合检测( 30.]。其他的研究报告不同分组的主要病毒参与混合检测。最近的研究报道RSV, HRV,副词的主要病毒参与混合检测儿童( 8, 31日)和儿童/成人( 10]。在另一项研究中最常见的病毒参与混合检测儿童与RTI HRV,此外,流感病毒( 9]。这些差异可能是由于呼吸道病毒检测的面板,地区或环境变化和不同的病毒检测技术。

49病毒合并感染的患者,45(12.8%)患有双重病毒检测和4(1.1%)三病毒检测。在流行病学研究中从韩国混合病毒检测分析显示,17.1%的双重检测和1.8%的三重检测,这是高于我们的结果可能是因为他们更大的样本量和我们测试了一个更大的测试面板的病毒( 30.]。另一项研究也报道了两20.3%,三倍3.9%病毒检测与RSV感染儿童中 8]。最常检测组合HRV /副词,HRV / HCoV-OC43, HRV /暗礁。HRV /副词的组合是最主要的组合;这一发现直接比较与先前的报道( 8, 30.]。在这项研究中,大多数的病毒混合检测< 1岁儿童患者(20或5.7%)。这是类似与其他最近的研究( 8- - - - - - 10, 31日]。这可能是由于一个婴儿的免疫系统不成熟和缺乏早期接触呼吸道病毒可能会增加他们的混合感染的易感性 12]。

在这项研究中病毒混合检测RSV之间的不确定和hMPV尽管许多研究发现hMPV和RSV合并感染的发病率大约~ [5 - 14% 20., 32, 33]。然而,在荷兰进行的研究在儿童下呼吸道感染住院,没有检测到病毒合并感染RSV之间和hMPV [ 34]。

如表所示 2HCoV-OC43积极最常合并感染患者HRV和RSV。从2006年到2009年在中国进行的一项研究旨在评估10呼吸道病毒的总发病率在儿童急性下呼吸道感染,coronaviruses-positive样本最常合并感染HRV和RSV 35]。类似的数据描述高冠状病毒的混合检测率与RSV也被先前描述( 36, 37]。

第一个KIV鉴定和WUV以来,他们已确定在全球呼吸道病毒序列样本RTI患者( 38- - - - - - 41]。然而WUV和KIV被发现与出口增速控制个人没有呼吸系统疾病之间的关系这些多瘤病毒和呼吸道疾病仍然是假设的 38, 40, 42]。混合检出率74%已被确认为KIV和WUV率从68年的79% ( 39- - - - - - 41]。在这项研究中,一个WUV检测患者住院诊断为支气管炎、细支气管炎和肺炎(表 1)。在中国南方的一项研究中,住院儿童一个WUV检测出现咳嗽、中度发热、和喘息,他们也被诊断出患有肺炎、毛细支气管炎,URTI和支气管炎。这些发现表明,多瘤病毒可以导致URTI和下呼吸道感染( 43]。在另一项研究评估WUV的发病率和病毒载量和KIV呼吸道免疫功能不全的样本和免疫活性的孩子透露WUV的患病率和KIV类似与免疫活性的人口相比,免疫功能低下的患者( 44]。然而这些数据需要进一步的研究证实。

多项研究表明,博卡检测往往是与其他呼吸道病毒如HRV,副词,RSV [ 23, 35, 45]。在这项研究中博卡病毒混合检测被确认HRV, HCoV-OC43, hcov - 229 e,副词(表 2)。持续的病毒传染和高频率的混合检测导致争论其作为一个真正的病原体( 42, 46]。其他研究证实,博卡病毒是最有可能的原因RTI如果病人有一个高病毒载量检测和临床样本( 45, 47]。在这项研究中,我们的病人被诊断为单个博卡病毒检测患有URTI和下呼吸道感染(表 1)。然而,尽管这场辩论变得越来越明显,博卡病毒是一个重要的呼吸道病毒( 48]。

我们的发现可能表明一个协会之间的呼吸道病毒混合检测和毛细支气管炎等发展中更严重的下呼吸道感染的可能性( P = 0.002 )和肺炎( P = 0.019 )相比,单一的检测。混合病毒检测和疾病之间的关系/临床严重程度是有争议的。早期的研究报道,混合检测呼吸道病毒增加住院和肺炎的风险( 8, 9, 13, 14),而其他的研究报道之间没有联系混合检测和疾病/临床严重程度( 16, 49]。然而,尽管敏感分子的可用性分析,报告仍有争议的关于混合作用的检测在疾病/临床严重程度相比单一的检测。提出了许多理论来解释混合呼吸道病毒检测和RTI严重程度之间的关系;这些理论包括原发感染后免疫反应的变化( 50, 51)和主机脆弱性多个病毒( 15]。

季节性的发病率混合病毒检测可检测全年除了七月,在1个月的发病高峰,6月和11月检测或42.1%的发病率(43)。

总之,我们的研究结果可能表明病毒混合检测患者的RTI并不少见,混合检测可能增加患者肺炎或毛细支气管炎的临床严重程度。进一步的调查是必要的调查疾病严重程度的决定因素在RTI病毒混合检测。

虽然该研究也有一些局限性像缺乏研究控制(匹配住院没有必要RTI估计由于疾病),rt - pcr的差异之间的敏感性和特异性针对病原体,和缺乏系统性测试潜在的细菌病原体,没有检测到病毒载量但这些数据提供代表混合在科威特呼吸道病毒检测的结果。

 利益冲突

作者宣称没有利益冲突有关的出版。

 确认

作者感谢连续支持这项研究(MI 03/08)的研究部门,科威特大学。特别感谢博士是由于Wassim Chehadeh(医学院微生物系副教授,科威特大学)为他的优秀的技术援助在分析病毒聚合酶链反应。特别感谢将Prem Sharma博士(技术顾问、副总统办公室、科威特大学)为他的杰出的帮助的统计分析数据。

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